陈建安
- 作品数：6 被引量：28H指数：3
- 供职机构：淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室更多>>
- 发文基金：江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金江苏省自然科学基金江苏省高校自然科学研究项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 西施舌ISSR-PCR扩增条件优化被引量：4
- 2008年
- 采用CTAB裂解、酚氯仿抽提法,提取了连云港、长乐、北海、胶南等地的西施舌基因组DNA,并从10条ISSR引物中筛选出了能够显示西施舌种群遗传差异的引物835和847,对模板DNA浓度、镁离子浓度、dNTP浓度、引物浓度和Taq酶浓度等条件进行了优化,初步筛选出适于西施舌ISSR分析的最佳反应体系:在25μL体系中,加模板38ng,10×Buffer 2.5μL,镁离子浓度为3.5mmol/L,引物浓度为0.8μmol/L,dNTP为0.3μl(10mmol/L),Taq DiNA聚合酶2U,退火温度为47.2℃。
- 张波孟学平陈建安
- 关键词：西施舌ISSR
- 西施舌16S rRNA基因片段PCR扩增及其核苷酸序列分析被引量：4
- 2006年
- 利用酚/氯仿抽提法提取了西施舌闭壳肌总DNA,以总DNA为模板,利用两条16S rRNA基因特异引物,进行PCR扩增,扩增产物测序后进行序列分析。结果从西施舌的闭壳肌提取得到总DNA,获得一个长度约300 bp的PCR扩增产物;测序结果显示此片段为294 bp;核苷酸序列经WU-blast2分析,与Spisula subtruncata(AJ548774)和Corbicula sp(AY097259)的16S rRNA的同源性均为74%。经DNAStar分析,此核苷酸序列A,G,T,C含量分别为35.74%,25.51%,26.19%和13.59%,A+T(61.90%)含量明显高于G+C(38.10%)含量。
- 姚丽娅肖宁陈建安孟学平
- 关键词：西施舌RRNA基因
- 江苏连云港沿海蛤蜊科贝类18S-ITS1序列分析被引量：2
- 2009年
- 利用PCR技术扩增了江苏连云港海域3种贝类(西施舌、中国蛤蜊,四角蛤蜊)核糖体RNA基因18S-ITS1区域序列。用DNAStar和MEGA3.1软件分析序列的碱基组成、进行序列比对,构建系统发育树。结果显示,西施舌、中国蛤蜊、四角蛤蜊18S-ITS1部分序列长度分别为1052bp、1017bp、1013bp,ITS1部分序列长度分别为910bp、875bp、871bp,G+C含量为58.90%～60.23%;18S区序列保守,种间仅存一个碱基变异位点。序列分析显示,中国蛤蜊与四角蛤蜊的ITS1同源性为70.1%～71.1%。西施舌与中国蛤蜊、四角蛤蜊的同源性为44.7%～46.3%;18S-ITS1序列适于蛤蜊科种间特别是蛤蜊属内种间的分子系统发育分析。
- 孟学平陈建安申欣程汉良董志国阎斌伦田美
- 关键词：RRNA基因ITS1西施舌中国蛤蜊四角蛤蜊
- 蛤蜊科3种贝类16S rRNA基因片段及ITS2核苷酸序列分析被引量：16
- 2006年
- 利用PCR技术分别扩增连云港及启东沿海蛤蜊科的西施舌(Coelomactra antiquata)、中国蛤蜊(Mactrachinensis)和四角蛤蜊(Mactra veneriformis)3种双壳贝的16S rRNA基因片段和ITS2核苷酸序列,测序后用DNA star软件分析了核苷酸差异。结果显示:三种贝类16S rRNA基因片段长度相同,均为306bp(去除引物),核苷酸存在多态性,共有45个变异位点,54个核苷酸发生了变异,全部为碱基置换。西施舌与中国蛤蜊此片段核苷酸的同源性为88.9%,与四角蛤蜊的同源性为88.6%,中国蛤蜊与四角蛤蜊的同源性为90.6%。三种蛤蜊ITS2序列分别为390 bp(西施舌)4、41 bp(四角蛤蜊)和466 bp(中国蛤蜊),存在长度多态性,ITS2核苷酸差异分析结果显示,西施舌与中国蛤蜊的同源性为70.9%-71.1%,西施舌与四角蛤蜊的为70.5%-71.0%,中国蛤蜊与四角蛤蜊的同源性为88.1%-88.8%。ITS2序列分析结果与16S rRNA基因片段分析结果一致,2种分子分析法均显示中国蛤蜊与四角蛤蜊的亲缘关系近。
- 孟学平高如承董志国阎斌伦程汉良李艳杰陈建安
- 关键词：西施舌中国蛤蜊四角蛤蜊ITS2
- 基于ITS2和16S rRNA的西施舌群体遗传差异分析被引量：2
- 2013年
- 目前,我国西施舌群体分子遗传差异研究结果存在争议。分析我国南北沿海(9个群体)、与广西北海毗邻的越南(1个群体)西施舌核DNA的内转录间隔区2(ITS2)和线粒体DNA的16S rRNA基因(16S)片段核苷酸序列及其二级结构,为解决争议问题提供分子生物学资料。扩增获得西施舌ITS2片段和16S序列,其长度分别为389—402 bp和306 bp,加之下载序列共147条;序列分析显示,74个ITS2序列共有17种基因型,73个16S序列有15种单倍型,其中,长乐(CL)群体独享9种ITS2基因型和5种16S单倍型,非长乐群体(nCL)多数为群体间交叉共享1种或几种基因(单倍)型;基因(单倍)型核苷酸变异位点占5.7%(ITS2)和11.8%(16S);基于ITS2和16S的CL群体和nCL群体间的遗传距离与群体内遗传距离之比分别为2.42和11.08,nCL群体间的平均遗传距离均为0.007;二级结构显示CL群体ITS2的9种基因型和16S的5种单倍型均区别于nCL群体,nCL的ITS2和16S二级结构分别相似;ITS2和16S基因的系统发育分析显示,CL西施舌形成支持率很高(98,96)的单系支,而nCL群体则交叉聚为另一支(98,96)。研究结果揭示,福建西施舌是腔蛤蜊属(Coelomactra)的一个新种。
- 孟学平申欣赵娜娜田美曾云陈建安董志国程汉良阎斌伦
- 关键词：西施舌ITS1RRNA
- 连云港沿海蛤蜊科贝类rRNA基因18S-ITS1序列分析
- 西施舌(Coelomactra antiquata)、中国蛤蜊(Mactra chinesis)和四角蛤蜊(Mactra veneriformis)属帘蛤目蛤蜊科贝类,前者属腔蛤蜊属,后两种属蛤蜊属。这三种贝类是连云港沿...
- 陈建安孟学平
- 关键词：人工养殖四角蛤蜊
- 文献传递
