熊清
- 作品数：13 被引量：42H指数：3
- 供职机构：重庆大学更多>>
- 发文基金：教育部“春晖计划”重庆市应用基础研究项目国家新药研究基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学自动化与计算机技术更多>>
- 真核启动子预测
- 本文分为两部分：真核启动子预测和生物大分子定量构效关系(QSAR)研究。
基因转录是遗传信息传递和表达的枢纽，是基因表达调控机制发挥作用的重要环节。而启动子是决定转录起始点和转录频率的关键元件，因此启动子的识别...
- 熊清
- 关键词：启动子预测遗传算法定量构效关系基因转录基因表达
- 电性距边矢量系统(MED)应用于生物医药分子建模与定量构效优化
- 李志良刘树深蔡绍皙李根容吴世容廖春阳周丽平张梦军梅虎孙立力杨胜喜覃仁辉曹晨忠熊清周原李波叶楠兰玉坤侯敏刘振德李伯玉聂金媛尹子卉徐红王远强曾晖刘永红仇亮加林光华
- 该课题据分子拓扑结构并依原子划分方案，按原子电性和间距描述相互作用，提出系列二维新型电性距边矢量（MED/MDE/MEE/MHD）描述子，用于生物与药物及毒物分子结构表达。通过不同结构分辨及定量构效相关考察，证明能高效简...
- 关键词：
- 关键词：医药
- 分子电性距离矢量(MEDV-B)用于二肽的分子结构表征与生物功能预测被引量：5
- 2005年
- 使用从分子一级拓扑结构出发、结合分子中非氢原子电性和键连属性以及原子间相对距离的分子电性距离矢量(MEDV-B),对58个血管紧张素转化酶(ACE)抑制剂二肽和48个苦味(BT)二肽进行定量结构活性相关(QSAR)研究,用多元线性回归建立矢量描述子与活性观测值间相关模型,并用留一法交互校验(LOO-CV)检验其预测力,取得较满意的结果(ACE:n=58,m=10,R=0.894,Rcv=0.818;BT:n=48,m=10,R=0.947,R=0.898);再用逐步回归对变量进行筛选与优化,建立新模型,稳定性与预测力得到进一步改善(AACE:n=58,m=5,R=0.859,Rcv=0.824;BT:n=48,m=5,R= 0.931,Rcv=0.908)。结果表明:该矢量描述子可用于二肽结构表征与生物功能预测,且计算简便。
- 王远强熊清叶楠李志良
- 关键词：定量结构活性相关分子电性距离矢量
- 冠状病毒主蛋白酶及其化学抑制剂研究进展被引量：2
- 2004年
- 一个新的冠状病毒已经被鉴定为急性呼吸道综合症(SARS)的病原体,控制该病毒复制复合体活性的主蛋白酶(Mpro或3CLpro)将很可能成为开发针对SARS特效治疗药物的靶位点。综述了人冠状病毒株229E(HCoV229E)和一种在猪体内引发传染性胃肠炎的病毒(TGEV)的Mpro的晶体结构以及以此为基础构建的SARS冠状病毒(SARS-CoV)同源蛋白酶的空间结构模型。通过对这些同源蛋白酶的结构及其与已知的蛋白酶化学抑制剂的结合特征进行分析后发现Mpro的底物结合位点具有惊人的保守性,这种保守性也被重组SARS-CoVMpro能介导的TGEVMpro的底物剪切实验所进一步证实。分子模型表明已有的鼻病毒3Cpro抑制剂经过改进后或许能用于SARS的治疗。
- 熊清王远强李志良
- 关键词：冠状病毒晶体结构抑制剂
- 超分子与纯分子连接性指数的研究与应用
- 2003年
- 根据有关原理与方法,计算了色谱分离过程中溶质分子的分子连接性指数及其与固定相形成超分子的超分子连接性指数。并用这些指数对硫醇类化合物在聚乙二醇固定相上分离的定量结构一保留关系(QSRR)进行了研究,所得回归方程相关系数高达0.99。该方法不仅保留了分子连接性指数的优点,还能够反映溶质分子与固定相相互作用模型对色谱保留值的影响,因此超分子连接性指数比分子连接性指数能更全面地反映影响色谱保留值的因素,使用范围更广泛,具有良好应用前景。
- 胡力玫熊清蒋兴荣李志良
- 关键词：定量结构-保留关系色谱保留值
- 植物抗脱水胁迫的分子机制被引量：27
- 2000年
- 主要介绍植物在脱水胁迫下 ,逆激基因产物的功能和胁迫信号的转导过程 .逆激基因产物的功能可分为两类 :一类起“保护”作用 ,另一类起“调节”作用 .在脱水胁迫起始信号和基因表达之间至少存在四条信号转导通路 ,两条依赖脱落酸 (ABA) ,两条不依赖ABA ,依赖ABA的途径中有 1条必须有蛋白质合成 .不依赖ABA的途径中有
- 熊清王伯初段传人cqu.edu.cn
- 关键词：信号转导基因表达脱水胁迫抗逆机制
- 细胞因子克隆及其相关芯片的制备和应用
- 该文以补血中药的研究作为切入点,分别对59个细胞因子、细胞因子受体及其它一些相关基因进行了克隆,建立起细胞因子库,并制作了细胞因子基因芯片,通过与经人参皂甙诱导后的骨髓基质细胞中提取的mRNA经过一轮反转录后制备的荧光标...
- 熊清
- 关键词：克隆细胞因子补血中药基因芯片
- 文献传递
- 肽定量构效关系的研究与应用
- 李志良梅虎周原周鹏吴世容李根容杨胜喜蔡绍皙梁桂兆刘树深曾晖田菲菲张巧霞陈刚张梦军周丽平廖春阳杨力叶楠熊清杨善彬兰玉坤刘振德李伯玉覃仁辉聂金媛李波侯敏尹子卉王远强曹晨忠林志华仇亮加徐红王娇娜刘永红陈国华彭传友邓婕等
- 该项目从拓扑结构、物化性质及相互作用等方面，建立起肽定量构效关系(QSAR)分子结构表征体系，通过最优化实验设计方法及自适应构效模型技术，实现相关肽和蛋白质的定量化生物活性预测与功能开发。该成果深层次融合肽定量构效关系研...
- 关键词：
- 关键词：定量构效关系
- SARS-CoV编码蛋白质的识别被引量：1
- 2004年
- 选取非典型肺炎病毒(SARS-CoV, NC 004718)和其他6种冠状病毒共计100个编码蛋白为样本, 从172个变量中经逐步回归选取23个变量建立多元线性回归模型, 模型的复相关系数R2 = 0.645, 交互检验R2cv = 0.375. 剔除4个异常样本后, 模型的复相关系数R2 = 0.743, 交互检验R2cv = 0.543.
- 梅虎孙立力周原熊清李志良
- 关键词：SARS-COV冠状病毒多元线性回归编码蛋白非典型肺炎病毒
- 基于遗传神经网络的启动子识别系统被引量：4
- 2006年
- 将遗传算法与神经网络结合,用遗传算法优化神经网络的连接权值,建立遗传神经网络模型,并将其应用于真核生物蛋白编码基因启动子的识别中。实验结果表明:我们以此模型为基础构建的系统对训练集和测试集中的启动子序列均能有效识别,在训练集和测试集上的平均识别率分别为99%和97%,表明此算法用于启动子序列的识别可行且十分有效。
- 熊清王远强李志良
- 关键词：启动子识别遗传算法神经网络
