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采用PCR-DGGE技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性: 2014年; 本试验旨在采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术分析瘤胃菌群在不同纤维索富集条件下的多样性。试验采用羧甲基纤维素（CMC）培养基、蛋白胨纤维素（PCS）培养基、J培养基和K培养基分别在37和50℃条件下培养瘤胃内容物，使用PCR-DGGE技术、DGGE图谱共性及特异性条带的克隆和测序、聚类分析和主成分分析（PCA）几种方法分析瘤胃菌群多样性。结果表明：37℃条件下，不同培养基的DGGE图谱差异较大，J培养基SDPCS培养基间的相似性系数为0．77；J培养基和CMC培养基间的相似性系数仅为0．76。50℃条件下不同培养基的DGGE图谱相似性较高，J培养基和PCS培养基间的相似性系数为0．78；而CMC培养基和PCS培养基间的相似性系数高达0．84。DGGE图谱中共性条带属于解没食子酸链球菌和解脲芽孢杆菌2个菌属，是瘤胃中的优势菌群；而主要的特异性条带属于解没食子酸链球菌、摩氏假单胞菌、产碱杆菌和未培养毛螺旋菌4个菌属。结果提示，不同纤维素富集培养基和温度对瘤胃菌群的多样性有一定程度上的影响。; 曾燕孙朋倪学勤; 关键词：PCR-DGGE 羧甲基纤维素瘤胃内容物变性梯度凝胶电泳

采用PCR-DGGE技术分析瘤胃细菌在不同纤维素富集条件下的多样性: 本试验旨在研究不同纤维素富集培养条件下瘤胃细菌的多样性。试验采用CMC、PCS、J和K培养基在37℃和50℃条件下培养瘤胃内容物,使用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-...; 曾燕孙朋倪学勤杨杰曾东张洪瑜; 关键词：瘤胃细菌纤维素 PCR-DGGE 聚类分析; 文献传递

不同纤维素培养基及温度对体外培养瘤胃细菌多样性的影响被引量：1: 2013年; 为探讨瘤胃细菌多样性,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(Polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术结合共性及特异性条带的克隆测序和聚类分析及主成分分析,对牛体外厌氧条件下瘤胃细菌在CMC、PCS、J、K培养基及37和50℃培养温度下的多样性进行研究。结果表明:1)37℃条件下不同培养基的DGGE图谱差异较大,虽然具有较高的平均条带数,CMC和K培养基样品分别为20和27条,但各样品间的相似性系数较低,J和CMC培养基间的相似性系数为0.84,J和PCS培养基间的相似性系数仅为0.75。2)50℃条件下不同培养基的DGGE图谱差异较小,平均条带数较低,CMC和K培养基样品均为15条,但各样品间的相似性较高,CMC和PCS培养基间的相似性系数为0.89;而J和PCS培养基间的相似性系数高达0.97。3)DGGE图谱中共性条带序列表明瘤胃优势细菌主要是Streptococcus macedonicus,而特异性条带主要是Escherichia coli、Firmicutes以及Brevundimonas。体外厌氧条件下不同纤维素培养基和温度在一定程度上影响瘤胃细菌的多样性。; 曾燕孙朋倪学勤杨杰曾东张洪瑜; 关键词：瘤胃细菌纤维素

不同纤维素培养基及温度对体外培养瘤胃细菌多样性的影响: 为探讨瘤胃细菌多样性,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术结合共性及特异性条带的克隆测序和聚类分析及主成分分析,对牛体外厌氧条件下瘤胃细菌在CMC、PCS、J、K培养基及37和50℃培养温度下的多...; 曾燕孙朋倪学勤杨杰曾东张洪瑜; 关键词：纤维素培养基环境温度; 文献传递

酵母铬对尼罗罗非鱼生长和糖代谢的影响被引量：2: 2013年; 本试验旨在采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性。试验采用羧甲基纤维素（CMC）培养基、蛋白胨纤维素（PCS）培养基、J培养基和K培养基分别在37和50℃条件下培养瘤胃内容物,使用PCR-DGGE技术、DGGE图谱共性及特异性条带的克隆和测序、聚类分析和主成分分析（PCA）几种方法分析瘤胃菌群多样性。结果表明：37℃条件下,不同培养基的DGGE图谱差异较大,J培养基和PCS培养基间的相似性系数为0.77;J培养基和CMC培养基间的相似性系数仅为0.76。50℃条件下不同培养基的DGGE图谱相似性较高,J培养基和PCS培养基间的相似性系数为0.78;而CMC培养基和PCS培养基间的相似性系数高达0.84。DGGE图谱中共性条带属于解没食子酸链球菌和解脲芽孢杆菌2个菌属,是瘤胃中的优势菌群;而主要的特异性条带属于解没食子酸链球菌、摩氏假单胞菌、产碱杆菌和未培养毛螺旋菌4个菌属。结果提示,不同纤维素富集培养基和温度对瘤胃菌群的多样性有一定程度上的影响。; 曾燕孙朋倪学勤杨杰曾东张洪瑜; 关键词：PCR-DGGE 聚类分析主成分分析

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孙朋