近十年来基因组学和蛋白质组学的快速发展为医学生物学的研究提供了前所未有的机遇。一方面,大规模、高通量的基因和蛋白质的测定工作产生了大量有价值的各类数据;而另一方面,因数据标准的缺乏、数据兼容和整合的艰难而妨碍了人们去充分有效地共享数据,进而更好地促进各自领域的发展。生物信息学也因此成为当今生物医学研究发展必不可少的一个手段。本文就美国国家癌症研究所(National Cancer Institute,NCI)以癌症研究为试点所建立的一个生物信息核心框架caCORE(cancer Common Ontologic Reference Environment)作一简短介绍。
目的从发文时间、期刊、基金资助和引文角度对近20年冠状病毒遗传学研究的整体布局分析,识别该领域的核心研究机构及其合作网络,挖掘当前的研究热点。方法在PubMed和Web of Science数据库分别检索2003—2021年冠状病毒遗传学研究文献及其引文数据,利用Excel软件对文献的分布年代、机构分布和基金资助进行分析,再选择Citespace软件进行机构合作网络和文献同被引聚类分析。结果冠状病毒遗传学研究的文献在2020年有爆发式增长。载文量排名前10的期刊累计收录了23.4%的相关文献。在该领域发表文献最多的机构是中国科学院,前10所高产机构中,中国机构共有7所。在合作网络中,中国科学院、香港大学和圣保罗大学具有较高的中介中心度。基金资助论文的总被引次数和篇均被引次数均高于无基金资助论文。同被引聚类分析显示近20年共出现了7个研究热点,近5年仍活跃的为"中东呼吸综合征冠状病毒的基因序列和功能受体研究"、"新型冠状病毒的基因溯源与药物研发"和"美国突发性猪流行性腹泻病毒的基因分型、溯源和经济影响"。结论未来几年甚至更长久时期内,冠状病毒遗传学研究将处于一个持续高位阶段;发表相关领域高影响因子(IF>5.00)期刊论文有一定难度;中国科研机构在该领域研究非常活跃,尤其以中国科学院和香港大学最具影响力,他们与其他机构合作关系也最为紧密;关于冠状病毒的基因溯源、基因序列和功能受体以及药物研发极有可能是该领域研究前沿,我国政府应在该领域提前布局,加大相关科研基金立项数量和资金支持力度。