陈姣
- 作品数:14 被引量:20H指数:2
- 供职机构:中国药科大学更多>>
- 发文基金:国家基础科学人才培养基金中央高校基本科研业务费专项资金江苏省普通高校研究生科研创新计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学化学工程更多>>
- IMP-1型金属β-内酰胺酶肽抑制剂的虚拟筛选
- 细菌产生β-内酰胺酶是造成对β-内酰胺抗生素耐药的主要原因之一,这些酶可以断开β内酰胺环中的酰胺键而使抗生素失活。根据Amber分类方法,β-内酰胺酶可分为A,B,C和D四类,其中A,C,D是丝氨酸β内酰胺酶,其活性位点...
- 房咪陈姣劳兴珍顾觉奋郑珩
- 关键词:抗生素Β-内酰胺酶抑制剂
- IMP-1型金属β-内酰胺酶抑制剂活性预测模型的研究
- 为建立计算机辅助IMP-1酶抑制剂设计方法,使用文献报道的已知抑制剂活性建立了基于对接亲和能的QSAR模型。首先使用晶体重构实验,确定使用MOE软件对接时,放置方式参数设为Triangle matcher,打分方式设为A...
- 郑珩陈灵犀许岩沈秉正陈姣
- 关键词:计算机辅助设计QSAR模型
- 文献传递
- VIM型金属β-内酰胺酶及抑制剂研究进展被引量:2
- 2011年
- VIM金属β-内酰胺酶是1种能水解几乎所有(除氨曲南等单环外)的β-内酰胺类抗生素,也是已报道蛋白质中与新德里金属β-内酰胺酶(NDM-1)序列相似性最高的一类获得性金属β-内酰胺酶。VIM-1与NDM-1相似,前者基因易于在细菌间传播和扩散,迄今还未发现临床有效的抑制剂,所以研发新型有效的抑制剂迫在眉睫。综述了近年来VIM序列、结构特点、耐药机制及相关抑制剂的最新研究进展,为设计、筛选、开发新型VIM-1抑制剂奠定基础,亦可为深入了解NDM-1设计开发其抑制剂提供帮助。
- 房咪陈姣陈辉郑珩
- 关键词:VIM金属Β-内酰胺酶抑制剂
- 药效团技术在抗感染新药研究中的应用被引量:2
- 2013年
- 药效团(pharmacophore)是指药物分子中对活性起重要作用的"药效特征元素"及其空间排列形式。药效团技术作为1种发展迅速的计算机辅助药物设计方法,已广泛应用于虚拟筛选、全新药物设计、先导化合物优化和ADMET预测等新药的设计和研发过程中,可提高药物研发的成功率,降低研发成本,缩短研发周期。近年来,禽流感、甲流感及超级细菌等新型传染性疾病的出现,为抗感染新药研发提出了新的挑战,为此,综述近年来国内、外发表的有关药效团模建技术的研究进展及其在抗感染新药研发中应用的文献以促进计算机辅助药物设计手段在抗感染新药研发中的应用。
- 肖静房咪陈姣郑珩
- 关键词:药效团抗感染
- 金属β-内酰胺酶TMB-1三维结构模建及活性位点的分析
- 2013年
- 目的:模拟金属β-内酰胺酶TMB-1三维结构,分析其结构特点与水解活性之间的关系。方法:运用DS 2.5版软件搜索模板、序列比对和构建模型,用Ramanchandran图和3D Profile程序验证模型,经分子动力学优化与水解后氨苄西林Libdock对接,再经动力学优化后与NDM-1重叠分析模型活性位点关键残基。结果:经Ramanchandran图和3D Profile分析,表明TMB-1蛋白模建结构较为合理;重叠分析显示其空间结构为与其他金属β-内酰胺酶类似的αββα折叠,其锌配位残基具有高度的序列和结构保守性。结论:TMB-1相比NDM-1活性位点Loop3和Loop10上氨基酸残基自由度的降低可能是造成特异水解活性重要原因之一。
- 黄灿陈姣劳兴珍郑珩
- 关键词:同源模建
- 新德里金属β-内酰胺酶的抑制肽及其应用
- 本发明涉及生物药物领域,具体涉及一种NDM-1型金属β-内酰胺酶的三肽抑制剂,其氨基酸序列为:Phe-Cys-D-Phe。药效学试验证明本发明的肽可用于制备抗菌药物用于预防和治疗耐药菌感染。
- 陈姣郑珩劳兴珍
- 文献传递
- 金属-内酰胺酶催化机制的研究进展被引量:2
- 2011年
- 金属β-内酰胺酶(MBLs)属于B型β-内酰胺酶,携带该酶基因的细菌表现出对多种抗生素的耐药性。由于目前临床上还没有有效的抑制剂出现,所以在面对细菌对抗生素的耐药作用时,人们显得束手无策。金属β-内酰胺酶催化水解包括青霉素、头孢菌素、碳青霉烯类和头霉素类抗生素时,都需要有锌离子的参与。金属酶在金属离子结合位点都拥有不同数量的锌离子配体,但是金属离子的确切作用仍然是有争议的。本文结合近几年国内外文献,简述了金属β-内酰胺酶催化机制的研究进展。
- 陈辉沈秉正周亚丽陈姣郑珩
- 关键词:金属Β-内酰胺酶耐药性
- 新德里金属β-内酰胺酶的抑制肽及其应用
- 本发明涉及生物药物领域,具体涉及一种NDM-1型金属β-内酰胺酶的三肽抑制剂,其氨基酸序列为:Phe-Cys-D-Phe。药效学试验证明本发明的肽可用于制备抗菌药物用于预防和治疗耐药菌感染。
- 陈姣郑珩劳兴珍
- 文献传递
- 结合支持向量机和分子对接的方法虚拟筛选IMP-1型金属-β-内酰胺酶抑制剂
- 目的:金属-β-内酰胺酶能够广泛水解β-内酰胺类抗生素,目前临床上尚无针对其有效的抑制剂。因此,近年来金属-β-内酰胺酶抑制剂的开发受到重视。方法 :本论文结合支持向量机(SVM)和对接的方法虚拟筛选IMP-1型金属-β...
- 陈姣郑珩姚文兵
- 关键词:支持向量机对接
- 文献传递
- 金属β-内酰胺酶的研究进展被引量:14
- 2011年
- 金属β-内酰胺类酶是一类需要金属离子协助才能发挥催化活性的一类广谱β-内酰胺酶,它能水解包括碳青霉烯在内的几乎所有的β-内酰胺类抗生素,且不被临床所用的β-内酰胺类抗生素所抑制。由于该酶位于质粒(整合子)上,极易在细菌中扩散,近期发现的携带NDM-1金属β-内酰胺酶超级细菌证实了这一担忧。因此,本文从分类、结构、催化机制以及进化等方面对金属β-内酰胺酶的研究进展进行了综述,希望对抗菌治疗的研究提供帮助。
- 陈照强刘一方朱宁陈姣郑珩
- 关键词:金属Β-内酰胺酶耐药性进化