陆忠华 作品数:126 被引量:240 H指数:8 供职机构: 中国科学院计算机网络信息中心 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 文化科学 经济管理 理学 更多>>
一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案 基于基因电脑克隆软件SiClone和可变剪接分析软件AltSplice的并行优化工作,提出了一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案.这种方案对所要进行比对分析的大规模序列库按照某种策略进行分割部署,使机群中每个结点处理... 牛北方 郎显宇 陆忠华 迟学斌文献传递 一种改进的BMUF训练框架及联邦学习系统实现 2022年 【目的】在隐私保护日益严峻的环境下,联邦学习常被用于解决“数据孤岛”与“数据隐私”等问题,但传统的联邦学习架构受限于中心化特点,带来了额外的隐私风险与成本,基于区块链的去中心化联邦学习架构因其明显的应用优势得到了更多关注与研究。【方法】本文改进BMUF训练框架,使其在联邦学习中数据量分布不平衡(Unbalanced).数据非独立同分布(Non-IID)场景下有较好效果;在客户端本地训练中加入差分隐私机制保护本地隐私;提出一种基于全局更新梯度的拜占庭检测鲁棒聚合算法,使聚合者可以检测出系统中存在的拜占庭客户端并完成鲁棒聚合。【结果】针对上述三点进行多组实验,实验结果表明改进的BMUF训练框架在Unbalanced与Non-IID场景下较FedAvg算法聚合效果更好;在客户端本地训练中加入差分隐私机制时,模型仍可收敛并获得较高准确率;在拜占庭攻击环境下,聚合者可以有效剔除拜占庭客户端并完成鲁棒聚合。【结论】本文改进BMUF训练框架,并实现了一个基于区块链的联邦学习系统,可以在去中心化架构下针对不同数据分布场景,有效保护客户端隐私,抵御拜占庭攻击,实现模型的高效训练。 赵鑫博 代闯闯 陆忠华关键词:区块链 构建评测二进制代码比对工具的测试数据集的方法及系统 本发明涉及构建评测二进制代码比对工具的测试数据集的方法,包括:从GitHub代码托管服务平台采集多个项目的信息,并存储于数据库系统中;项目的信息包括项目的各发布版本及父版本/子版本对的commit信息;构建分布式编译源代... 詹科 陆忠华文献传递 基于PSWAT的水文模拟平台的设计与实现 2014年 我们在中国科学院超级计算环境提供的云服务开发接口的基础上,研究和实现了基于PSWAT(Parallel Soil and Water Assessment Tool)的水文模拟Portal系统,该系统能够方便快速的处理PSWAT水文应用,提供了作业提交、查询、状态实时查看、结果文件的批量下载以及流水线工具等功能。测试和实际应用表明,该水文模拟平台具有简单易用、符合研究人员操作习惯等特性,方便用户高效、安全的完成计算任务。 黄志明 陆忠华 陈曦 邓笋根关键词:水文模拟 国家网格步入佳境 被引量:3 2005年 中国国家网格是聚合了高性能计算和事务处理能力的新一代信息基础设施试验床。从2005年初起,中国国家网格步入推进应用与完善环境的新阶段,其任务重点是如何支持和促进网格应用。 陆忠华关键词:信息基础设施 网格应用 试验床 事务 红细胞形态的MPI+OpenMP并行自适应相场模拟 2014年 本文针对红细胞形态的相场模型研究并行自适应算法。我们依据界面追踪的原则设计了自适应网格的更新准则,并基于离散能量下降准则设计了时间步长的自适应算法。在基于MPI的块结构自适应网格管理软件包PARAMESH的基础上设计并实现了MPI+OpenMP的混合并行算法。通过红细胞稳定态的自适应计算验证了自适应算法的正确性并测试了混合并行实现的效率。测试结果显示混合并行算法具有良好的可扩展性。 刘旸 张鉴 陆忠华关键词:自适应网格 相场模型 MPI+OPENMP 红细胞形态 面向海量告警数据的并行处理系统设计与实现 被引量:8 2018年 为提高海量告警数据的处理效率,设计并实现一种网络管理中面向海量告警数据的并行处理系统,由采集任务更新模块、采集任务调度模块、采集任务处理模块和系统管理模块构成。系统核心为采集任务调度模块,通过采用带宽资源目标和/或计算资源目标计算的双目标任务调度模式,利用采集机的带宽资源和计算资源,提高海量告警数据的采集效率。该系统可广泛适用于网络数据采集及其它领域。 张海阔 陆忠华 张海阔 陆忠华 刘芳 王珏关键词:网络管理 数据采集 并行处理 任务调度 2014年度中国科学院超级计算发展指数发布 15年10月10日,在广州举办的第五届中国科学院超级计算应用大会(SCA2015)上,中国科学院超级计算中心发布了2014年度中国科学院超级计算发展指数(CAS SCDI),该指数的评价指标数据基于自主开发的"... 刘利萍 陆忠华关键词:数据分析 学术论文 专利授权 国内外科学工作流综述研究 被引量:4 2014年 科学工作流管理系统(Scientific Workflow Management Systems,SWfMS)为科学家提供一个对复杂科学计算流程进行描述、运行、重运行和监控的有效平台,向科学家隐藏了底层与计算相关以及与数据操作的相关细节,从而减轻了科学家的负担,提高了科学家进行科学发现的效率。本文对国内外围绕科学工作流(Scientific Workflow,SWF)开展的若干关键技术进行了综述,介绍了SWF语言、SWF流程组合以及来源管理等,并对近期的最新研究进行了分析,在此基础上指出了该领域存在的一些不足,给出了一些建议。 吴响 邓笋根 陆忠华关键词:科学工作流 2013年度中国科学院超级计算发展指数发布 2014年 2014年8月22日,在青海西宁举办的第四届中国科学院超级计算应用大会(SCA2014)上,中国科学院超级计算中心发布了2013年度中国科学院超级计算发展指数(CAS SCDI),该指数的评价指标数据基于自主开发的“CAS SCDI 数据收集系统”Web在线收集,院超级计算环境用户群体中共计181个课题组提交了超级计算应用成果。 刘利萍 陆忠华关键词:数据收集 用户群体 计算环境 CAS