金媚媚
- 作品数:5 被引量:1H指数:1
- 供职机构:浙江工业大学信息工程学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 一种基于进化树拓扑路网构建的路径规划确定方法
- 一种基于进化树拓扑路网构建的路径规划确定方法,包括获取城市完全路网数据,应用邻接矩阵方法构造表示原始地理信息的路网全连通图G;将路网全连通图G归类划分为二叉路网拓扑进化树;获取包含所有目标结点的最小分支树;对于包含所有路...
- 张贵军吴海涛郭海峰洪榛何洋军金媚媚俞立
- 文献传递
- 一种基于进化树拓扑路网构建的路径规划确定方法
- 一种基于进化树拓扑路网构建的路径规划确定方法,包括获取城市完全路网数据,应用邻接矩阵方法构造表示原始地理信息的路网全连通图G;将路网全连通图G归类划分为二叉路网拓扑进化树;获取包含所有目标结点的最小分支树;对于包含所有路...
- 张贵军吴海涛郭海峰洪榛何洋军金媚媚俞立
- 一种新的蛋白质结构预测多模态优化算法被引量:1
- 2013年
- 针对现阶段药物设计中对于蛋白质结构多模态的需求,提出了一种基于排挤差分进化策略的多模态优化算法。为了降低蛋白质构象空间求解的复杂度,算法采用能量极小化过程,有效缩小了可行域的搜索空间;同时,为了有效地平衡多模态优化问题的局部收敛性和模态多样性,在排挤差分进化算法的框架下,在保证算法收敛速度的前提下,算法采用空间局部性原理,同时随机选取不同交叉策略的集结思想又有效改善了种群的多样性。以脑啡肽为例,算法不仅得到了其全局最稳定结构,还获得了一系列局部最优结构。
- 程正华张贵军邓勇跃金媚媚
- 关键词:差分进化算法多模态优化
- 分子构象多模态优化算法设计及实现
- 随着人类基因组计划的完成以及蛋白质工程研究的日益深入,蛋白质分子构象空间确定与功能的研究已成为分子生物学领域中最具有挑战性的问题之一。根据Anfinsen原则,以计算机为工具,运用适当的算法,从氨基酸序列出发,直接预测蛋...
- 金媚媚
- 关键词:蛋白质结构预测
- 文献传递
- 基于集结过程的蛋白质构象优化方法
- 2013年
- 混合优化算法结合两种或更多种算法的优点,成为解决非凸优化问题的有效方法.针对蛋白质结构预测,提出了一种有效的混合优化算法.这个方法在传统的差分进化算法基础上,结合了集结过程思想,保存了较好的片段,并同时使用构象空间退火中的种子保存策略,可以得到更多质量较高的后代.实验表明:提出的方法可以有效的寻找到脑啡肽(Met-enkephalin)的最低能量构象,相比于其他现有方法,其可靠性更高,速度更快.
- 张贵军金媚媚程正华
- 关键词:蛋白质结构预测差分进化算法脑啡肽