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志贺菌的分子分型方法被引量：5: 2006年; 金东任志鸿徐建国; 关键词：细菌性痢疾志贺菌分子分型

O∶3和O∶9小肠结肠炎耶尔森菌主要毒力基因分布调查被引量：57: 2004年; 目的　了解我国常见致病性血清型毒力基因的分布情况。方法　参照国外发展成熟的聚合酶链反应(PCR)技术进行毒力基因检测。结果　实验证实在我国分离到的主要流行血清型O∶3和O∶9小肠结肠炎耶尔森菌毒力基因分布特征为 :ail+ 、ystA+ 、ystB-、yadA+ 、virF+ 占 5 6.2 % ;ail+ 、ystA+ 、ystB-、yadA-、virF-占 2 5 .6% ;其他型占18.2 %。结论　通过实验证实在我国引起感染暴发和流行的血清型O∶3和O∶9小肠结肠炎耶尔森菌毒力基因的分布主要为 :ail +、ystA+ 、yadA+ 、ystB-、virF+ 型 ,很少部分的ail+ 、ystA+ 、ystB-、yadA-、virF-根据以前的资料被认为是毒力质粒丢失的结果 ,其他型很有可能是非致病的菌株。; 景怀琦李继耀肖玉春邱海燕顾锋夏胜利崔志刚金东阚飙顾玲汪华徐建国; 关键词：小肠结肠炎耶尔森菌毒力基因血清型

四川省自贡市食品和环境携带屎肠球菌的耐药性和多位点序列分型研究被引量：2: 2017年; 目的研究四川省自贡市食品和环境样本中屎肠球菌耐药性及携带毒力基因情况,并对分离菌株进行序列分型(ST)。方法对2013年采集的157份食品和环境样本进行屎肠球菌分离鉴定,全自动微生物鉴定仪检测屎肠球菌对14种常见抗生素的敏感性;使用聚合酶链式反应方法检测屎肠球菌携带毒力基因(hyl,esp)的情况,并应用多位点序列分型(MLST)方法对分离菌株进行序列分型。结果自贡地区肉制品和冰箱拭子样本屎肠球菌分离率为28.03%(44/157),其中耐药菌株的比例为86.36%(38/44)。分离菌株对红霉素、四环素和利福平的耐药率分别为65.91%(29/44)、31.82%(14/44)和27.27%(12/44),对环丙沙星,高浓度链霉素和高浓度庆大霉素以及氯霉素也有一定的耐药率。分离到1株喹奴普丁-达福普丁耐药的菌株。未检测到对青霉素类、糖肽类、脂肽类、喹诺酮类和恶唑烷酮类抗生素耐药的菌株。44株屎肠球菌分为38个ST型别,ST94克隆群为优势克隆群,包括13株菌。分离到1株CC17克隆群的屎肠球菌多重耐药菌株和1株ST957的八重耐药菌株。检测到2株携带esp基因的屎肠球菌。结论自贡市食品和环境中存在多种ST型别的屎肠球菌,且对多种抗生素耐药。应重视肉制品中耐药屎肠球菌对公众健康的潜在威胁。; 杨晶王红朱文涛张桂金东; 关键词：屎肠球菌耐药性多位点序列分型

马鞍山市食品中单核细胞增生李斯特菌污染调查及分子生物学特征被引量：4: 2010年; 单核细胞增生李斯特菌（listerial monocytogenes,LM）在自然界分布广泛,主要以家畜、家禽为宿主,可引起人和动物脑膜炎、败血症、流产等症状,是人畜共患病的致病菌,病死率达20%～30%.近30年来,国外多次报道由LM引发的食物中毒事件.目前,国内虽没有LM引起食物中毒暴发的相关报道,但食品监测显示食品中LM污染情况较为严峻,同时我周也曾报道多起由该菌引起临床感染的病例报告。; 汪永禄王艳郑锦绣詹圣伟金东叶长芸刘燕陶勇石志峰王利; 关键词：单核细胞增生李斯特菌食品监测分子生物学特征污染调查食物中毒事件污染情况

肠集聚性大肠埃希菌分离株脉冲场凝胶电泳分析被引量：3: 2013年; 目的对我国散发腹泻患者肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)分离株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,以了解其分子流行病学特征并初步建立我国EAEC菌株的基础数据库。方法参照PulseNet大肠埃希菌O157∶H7的PFGE实验方法对52株EAEC分离株进行分析,并使用BioNumerics软件进行聚类。结果在限制性内切酶XbaⅠ和PulseNet推荐的电泳参数下,菌株基因组酶切片段分布均匀,条带易于识别。52株EAEC分离株产生了48种PFGE带型,初步聚类为A^N 14个群,不同地区来源及不同HEp-2细胞黏附表型的菌株广泛分布在不同PFGE聚类群中。结论我国散发腹泻患者EAEC分离株呈现高度多态性,PFGE电泳参数和限制性内切酶XbaⅠ适用于我国EAEC菌株的分析。; 孙晖刘学通赵爱兰金东熊衍文卢珊; 关键词：脉冲场凝胶电泳分子分型

青藏高原喜马拉雅旱獭粪便携带腹泻相关病毒的调查分析被引量：1: 2016年; 目的调查我国青藏高原喜马拉雅旱獭粪便中腹泻相关病毒的携带情况,并对检出病毒进行序列分析。方法根据腹泻相关病毒基因组保守区设计兼并引物,采用直接PCR或一步法RT-PCR方法对96份喜马拉雅旱獭粪便标本核酸进行检测;阳性PCR产物测序后与参考毒株进行序列比对;利用Phy ML 3.0软件对喜马拉雅旱獭粪便中病毒序列进行进化分析。结果 96份青藏高原喜马拉雅旱獭粪便中共检出星状病毒32份、小双节RNA病毒42份和嵴病毒5份,阳性率分别为35.4%、43.8%和5.2%;星状病毒、小双节RNA病毒和嵴病毒与参考毒株核苷酸一致性分别为78%、77%和93%,氨基酸一致性分别为77%、84%和91%。兼并引物未检测到腺病毒、札如病毒和诺如病毒。结论青藏高原喜马拉雅旱獭粪便中存在星状病毒、小双节RNA病毒和嵴病毒,为后续喜马拉雅旱獭携带病毒谱系研究提供了重要线索。; 罗雪莲郑雅匀戴晓懿金东孙晖熊衍文; 关键词：喜马拉雅旱獭星状病毒

老年男性体内胰岛素抵抗指数、炎症因子水平与冠心病的关系: 方法: 选取2006年6月～11月我院心内科行冠状动脉造影术老年男性住院病人80例, 均患有Ⅱ型糖尿病(根据冠状动脉造影结果, 明确诊断为冠心病的病人共50例,作为病例组;同时参照冠状动脉病变严重程度,又将病例...; 金东; 关键词：胰岛素抵抗指数炎症因子老年男性冠心病; 文献传递

腹泻儿童肠道菌群动态分析及相关巴黎链球菌全基因组研究: 通过对连续采集的粪便标本中16S rDNA的扩增、克隆和序列分析,我们可以了解腹泻儿童肠道菌群的动态变化,这是常规分离培养方法所不能实现的,同时为研究未知的腹泻病原菌提供了可能。本文使用细菌16S rDNA序列分析方法,...; 金东; 关键词：全基因组; 文献传递

2007-2011年江苏省南京市细菌性痢疾病原学监测结果分析被引量：2: 2013年; 目的对江苏省南京市2007-2011年细菌性痢疾的血清群(型)分布、耐药谱、毒力基因携带情况及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,为江苏省南京市细菌性痢疾的防控提供依据。方法对从江苏省南京市2007-2011年各医院腹泻病患者中分离的75株志贺菌进行血清群(型)、耐药性和毒力基因检测,并进行PFGE分子分型。结果75株志贺菌包括宋内志贺菌54株(72.0%),福氏志贺菌21株(28.0%),除2010年福氏X型为优势血清型外,其余年份宋内志贺菌为优势血清群;75株菌普遍对氨苄西林、四环素和磺胺甲恶唑耐药,耐药率在61.1%～95.2%之间;三重及以上耐药菌株占所有测试菌株的88.0%;毒力基因ipaH、sen、set1、ial阳性率分别为100%、46.7%、24.0%、48.0%;福氏志贺菌优势毒力基因模式为Ⅰ型(66.7%),宋内志贺菌优势基因模式为Ⅶ型(61.1%)和Ⅳ型(25.9%);宋内志贺菌分为20个PFGE基因型,其中以S7、S8、S10三个带型为主,占宋内志贺菌的53.7%;相似度>95%,可能来自于同一克隆系;福氏志贺菌分为17种带型,各带型较散在分布。结论江苏省南京市志贺菌流行菌群不断变迁,宋内志贺菌有取代福氏志贺菌成为流行菌群的趋势;多重耐药现象严重;福氏志贺菌优势毒力基因模式为Ⅰ型、宋内志贺菌为Ⅶ型和Ⅳ型;PFGE型别呈现多元化流行特点。; 程婷婷王建平史小超雍玮丁洁金东余波谢国祥; 关键词：志贺菌 PFGE 药敏试验毒力基因

粪肠球菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立被引量：2: 2013年; 目的建立用于检测粪肠球菌的TaqMan实时荧光定量-聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative-Polymerase Chain Reaction,FQ-PCR)方法。方法根据粪肠球菌的d-丙氨酸聚连接酶(ddl)基因设计TaqMan FQ-PCR的引物及探针,并使用39种常见致病菌和条件致病菌检测其特异性。将目的基因克隆到质粒中,制作标准曲线,确定方法的检测下限。制备血液模拟标本,直接提取核酸进行检测,探索临床应用的可能。结果在特异性评价实验中,除阳性对照外其余样本均未出现特异性扩增曲线。建立粪肠球菌TaqMan FQ-PCR方法的标准曲线,确定该方法的检测下限为20 copy/管。通过对粪肠球菌血液模拟标本的检测发现,本方法对模拟标本的检测灵敏度为3.9×103cfu/ml。在稳定性评价中,对含菌量为3.9×108、3.9×106和3.9×104cfu/ml的血液模拟标本重复检测10次,结果显示扩增反应Ct值的变异系数(CV)为0.99%～1.84%。结论本研究建立了适用于临床标本检测的粪肠球菌TaqMan FQ-PCR方法。; 金东于波刘莎刘凯徐建国叶长芸; 关键词：粪肠球菌

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金东

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