董长征 作品数:24 被引量:139 H指数:6 供职机构: 宁波大学医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 浙江省教育厅科研计划 宁波市自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
甲型流感病毒基因组进化事件检测软件的实现 2011年 目的流感病毒通过跨宿主迁移和基因组重配作用等进化事件引起抗原转换是造成流感大流行的主要原因;传统上利用系统发生树通过进化分析检测这些事件,而进化分析过程复杂并且算法参数较难设定。方法作者曾提出了一种利用基因型谱检测甲型流感病毒基因组进化事件的新方法,弥补了进化分析的这些缺陷。在本文中,利用C++Builder开发工具在Windows平台上实现了基因型谱分析方法。结果利用甲型流感病毒进化事件检测软件,可以快速的检测跨宿主迁移和基因组重配作用等甲型流感病毒基因组进化事件。结论甲型流感病毒进化事件检测软件可以作为流感病毒疫情监测控制中进化分析的辅助工具,无论在病毒基因组进化的基础研究和疾控实践中都将具有很强的应用价值。 应莉娅 袁东方 董长征关键词:迁移 基因水平的关联分析方法 被引量:5 2013年 全基因组关联研究(Genome wide association study,GWAS)已经在国内外的医学遗传学研究中得到广泛应用,但是GWAS数据中所蕴含的与多基因复杂性状疾病机制相关的丰富信息尚未得到深度挖掘。近年来,研究者采用生物网络分析和生物通路分析等生物信息学和生物统计学手段分析GWAS数据,并探索潜在的疾病机制。生物网络分析和生物通路分析主要是以基因为单位进行的,因此必须在分析前将基因上全部或者部分单个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)的遗传关联结果综合起来,即基因水平的关联分析。基因水平的关联分析需要考虑单个SNP的遗传关联、基因上SNP数量和SNP之间的连锁不平衡结构等多种因素,因此不仅在遗传学的概念上也在统计方法方面具有一定的复杂性和挑战性。文章对基因水平的关联分析的研究进展、原理和应用进行了综述。 罗旭红 刘志芳 董长征关键词:全基因组关联研究 网络分析 决策树在原发性肝癌鉴别诊断中的应用 被引量:1 2015年 以95例原发性肝癌和190例肝硬化病例的CT诊断、乙肝表面抗原、甲胎蛋白、癌胚抗原和岩藻糖苷酶等影像学和血清学标志物检测结果以及性别和年龄等为基本资料,利用决策树算法和诊断指标建立判别规则,辅助对原发性肝癌进行鉴别诊断。结果表明以决策树为代表的数据挖掘技术能够较好地辅助肝癌鉴别诊断。 孙向东 董长征 陈晓妍 唐玲 王侃关键词:决策树 原发性肝癌 回顾性时空重排扫描统计量在手足口病聚集性疫情探测中的应用 被引量:2 2016年 目的:探讨回顾性时空重排扫描统计量在手足口病聚集性疫情探测的可能性,为手足口病流行预警提供一种方法。方法:收集中国疾病监测信息系统报告的2013年义乌市手足口病个案,采用描述流行病学和回顾性时空重排扫描统计量的方法判断聚集性。结果:义乌市2013年手足口病报告发病率为238.16/10万;4-7月份和11-12月份有2个小高峰;回顾性时空重排扫描统计量分析得到,2013年7月8日至2013年11月1日在城西街道和稠江街道(P=0.003 5)和2013年9月28日至10月29日在苏溪镇、大陈镇和廿三里街道(P=0.003 7)存在手足口病聚集性疫情。结论:回顾性时空重排扫描统计量描述流行病学判断手足口病聚集性更加精确,是评价传染病聚集性的一种行之有效的方法。 冯霞燕 董选军 沈毅 余运贤 董长征 杨洁新型农村合作医疗贫困线的测算 被引量:2 2009年 目的:确定不同经济水平地区的新型农村合作医疗的贫困线水平.方法:文章数据来源于2005年和2006年的宁波市专项合作医疗调查,采用扩展线性支出系统法(ELES)对当地的贫困线水平进行测算.结果:新型农村合作医疗贫困线测算结果为年人均4410元.结论:满足宁波地区农村居民基本生活需求的贫困线为4410元,根据这个贫困线水平,为宁波地区农村居民就医经济风险,就医经济风险临界线的分析提供参考. 陈明 张莉娜 董长征 唐立健 秦小岸 沈其君关键词:新型农村合作医疗 贫困线 产前筛查中超声估计孕龄方法的研究进展 被引量:2 2011年 超声估计孕龄是产前筛查中极为重要的一个环节,直接关系到风险估计的准确性.然而,超声估计孕龄的方法种类繁多,且彼此间存在较大差异.为了能更加准确地估计孕龄,进而提高产前筛查的效能,比较了目前国内外相对公认的超声估计孕龄的方法,并对各方法之间的差异进行了综述,为我国今后产前筛查中准确用超声估计孕龄提供参考. 秦小岸 陈明 卓仁杰 张莉娜 董长征 沈其君关键词:产前筛查 超声 孕龄 控制图预警模型及其Excel实现 被引量:9 2013年 目的通过Microsoft Excel实现5种主要的控制图预警模型(休哈特控制图、基于长期基线数据的累积和控制图、基于短期基线数据的累积和控制图、移动平均控制图和指数加权移动平均控制图)。方法利用Excel函数功能计算各种类型控制图的预警统计量和预警上线。结果以宁波市镇海区2006—2011年乙型肝炎每月报告发病数据作为模板,通过Excel表格和图形可以进行传染病预警分析。结论控制图预警模型的Excel程序Excel CC可用于传染病的回顾性和前瞻性时间预警分析。 刘志芳 袁东方 董长征关键词:控制图 预警模型 EXCEL 传染病预警模型研究进展 被引量:14 2012年 2003年传染性非典型肺炎(SARS)和2009年甲型H1N1流感的全球暴发表明传染病依然是生命健康和社会经济的重大威胁。经济全球化、生产国际化、交通更加便捷、人货流动加快等因素的影响,使得传染病的传播速度加快、传播范围更广,也加大了传染病的防控难度。及早探测到传染病的早期暴发并发出预警和采取应对措施, 袁东方 应莉娅 董长征关键词:预警模型 传染病 甲型H1N1流感 传染性非典型肺炎 经济全球化 基于谷歌地图的传染病空间聚集性分析 被引量:5 2014年 目的探讨谷歌地图在传染病空间聚集性分析中的应用,探索以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析。方法利用谷歌地图的地理译码技术和计算几何算法以及文本解析方法,将宁波市镇海区2005-2010年结核病的报告数据和模拟数据,转换成以社区(行政村)为单位的发病统计数据,以此为基础利用SaTScan进行扫描统计分析,比较以街道为单位和以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析的结果。结果无论是以街道为单位还是以行政村为单位的聚集性分析,均发现镇海区蛟川街道2005-2010年具有明显的结核病空间聚集性现象,而以行政村为单位的聚集性分析更精确地给出主要聚集区位于中官路村、五里牌村和俞范社区等行政村。对镇海区招宝山街道模拟数据的分析表明,以社区为单位进行聚集性分析能够在早期发现街道内部小范围的空间聚集性,这与以街道为单位进行聚集性分析着重发现较大范围的空间聚集性形成互补。结论谷歌地图及其地理译码技术在传染病空间聚集性分析中具有广阔的应用前景,以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析具有可行性和现实意义。 袁东方 应莉娅 刘志芳 罗旭红 董长征关键词:空间聚集性 谷歌地图 人肠道病毒71型与手足口病的分子流行病学及其分子进化 被引量:31 2015年 人肠道病毒71血清型(Enterovirus 71,EV71)是手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的主要病原体之一,除了引起手、足和口腔等部位出现疱疹的手足口病典型症状,还能引起无菌性脑膜炎和急性迟缓性麻痹等神经系统并发症并致死亡。EV71在历史上曾经造成多起手足口病疫情,尤其是1997年之后,在亚太地区发生了大规模的手足口病疫情,造成了大量的手足口病病例和死亡病例。手足口病尚无上市疫苗和抗病毒药物,主要依赖对症治疗,因此对EV71的分子流行病学和分子进化研究对手足口病的监测和防控具有重要意义。文章对EV71基因型的分类、时空分布、进化特征和模式以及所造成的代表性疫情进行了综述,为EV71致病机制、抗病毒药物和疫苗的研究以及对手足口病疫情的监测和防控提供启发。 刘志芳 桂娟娟 华启航 董长征关键词:手足口病 肠道病毒71型 基因型