- 增强子位点突变对GFP报告基因表达影响及生物信息学分析
- 目的：增强子(enhancer)是上调基因表达的顺式(cis)元件，其上调基因表达的机理尚有许多值得研究之处。本研究室前期工作证明，SV40PolyA序列中一段长22bp的片段(称为22R，5’-GTGAAAAAAATG...
- 景向阳
- 关键词：增强子位点突变生物信息学
- SV40PolyA顺式活化基因元件中不完整茎环结构的发现和序列研究被引量：1
- 2011年
- 研究室的前期工作发现,Alu串连序列插入pEGFP-C1质粒的GFP基因下游,瞬时转染HeLa细胞抑制GFP基因表达,2F2R(来自SV40PolyA反序5′端的第2个60 bp)插入GFP和Alu串连序列之间可以解除Alu序列对GFP基因的抑制作用。文章通过删减2F2R发现,45R(2F2R 5′端的45 bp)、30R和22R可以活化基因,且二串连体活化基因作用高于单体。Secloop(2F2R近中部的22 bp)和Poly4(2F2R 3′端的30 bp)不能活化基因。30R与Poly4用9碱基连接形成30R-Poly4,其活化基因作用低于2F2R,两个22R之间连接碱基数对活化GFP基因作用没有明显的影响。22R(5′-GTGAAAAAAATGCTTTATTTGT-3′)含有不完整的回文序列,可以形成不完整的茎环结构,包括一个3碱基loop、3 bp第一茎、2碱基泡和3 bp第二茎。改变22R茎环结构的碱基突变明显影响其活化GFP基因的作用,过多互补和过少互补的茎环结构均不利于活化基因,提示适当的不完整茎环结构与活化基因有关。
- 王红钢马欢李珠张彬景向阳张媛吕占军
- 关键词：非编码序列GFP茎环结构ALU
