吴朝
- 作品数:3 被引量:0H指数:0
- 供职机构:中国医学科学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 自然反义转录物Lmo4as对神经系统重要编码基因Lmo4的调节作用
- 2014年
- 目的探索小鼠神经系统重要编码基因Lmo4基因座位上自然反义转录产物Lmo4as对该编码基因的表达调控功能。方法 1)使用c DNA末端快速扩增(RACE)与RT-PCR技术,验证Lmo4as是否具有多聚腺苷酸(poly A)尾,克隆Lmo4as的全长序列;2)使用实时定量PCR和原位杂交技术确定Lmo4as及相应编码基因的时空表达谱;3)使用荧光素酶报告基因实验在体外验证Lmo4as对Lmo4是否具有调控作用。结果 1)Lmo4as是一个具有多聚腺苷酸(poly A)尾的非编码RNA转录本,获得其RNA全长信息;2)Lmo4as与相应编码基因转录Lmo4的丰度在时间上具有协同性,而在空间表达上具有明显不同的分布;3)Lmo4as对Lmo4在转录后水平具有负性调节作用,另外miR-124也能够抑制Lmo4的表达。结论编码基因Lmo4基因座位上自然反义转录产物Lmo4as对其转录后水平的负性调节与microRNA的调节共同发挥作用。
- 张靖吴朝朱丽媛阴彬侯琳彭小忠
- 关键词:原位杂交转录后调控
- 转录因子的自然反义转录物在小鼠大脑发育过程中的功能探索
- 自然反义转录物的研究历史与现状。长非编码RNA是指长度大于200nt,不具有蛋白编码功能的转录产物。21世纪以来,转录组学的研究发现不同的物种中都有大量的长非编码RNA,其中一部分长非编码RNA的功能已经得到阐释。长非编...
- 吴朝
- 关键词:转录因子大脑发育原位杂交网络调控
- 文献传递
- PCBP2基因座位上长非编码RNA的筛选与鉴定
- 2013年
- 目的从EST鉴定入手利用生物信息学方法筛选验证PCBP2基因内部UC.338基因座位附近的长非编码RNA。方法首先利用生物信息学方法筛选包含内含子转录区域的ESTs,经CPC分析和统计学比较,共筛选到4个(人、鼠各两个)可能的lncRNAs,用PCR方法进行鉴定,克隆到pGEM-T载体测序验证,并用PCR,real-time PCR的方法检测各ESTs在人源细胞系或小鼠不同组织,小鼠发育不同时间点大脑中的表达谱。结果筛选到4个ESTs中有3个ESTs均具有一定的非编码特征,并最终测序正确:1个人源,2个鼠源,并且其中有些lncRNAs具有一定的细胞、组织特异性,有些lncRNAs具有广谱表达模式。结论使用了一种新的寻找lncRNAs的方法,从EST鉴定入手,对现有数据库进行了挖掘。找到了可能在小鼠大脑发育过程中起作用的lncRNAs。
- 赵阿妮朱丽媛吴朝刘雪梅阴彬张靖
- 关键词:ESTS生物信息学分析LONG表达谱分析