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吕暾: 作品数：33 被引量：56H指数：5; 供职机构：福州大学更多>>; 发文基金：福建省省属高校科研专项重点项目福建省科技厅青年人才基金国家自然科学基金更多>>; 相关领域：生物学农业科学自动化与计算机技术医药卫生更多>>

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毒素DON单链抗体的同源建模及与DON结合的分子模拟研究被引量：6: 2011年; 通过同源模建及分子力学构建并优化了呕吐毒素DON单链抗体的三维结构,结合Procheck和verify_3D方法评估得到合理的抗体模型.利用分子对接方法研究了单链抗体与其抗原DON的识别及相互作用.结果表明,毒素结合到抗体轻链上,通过轻重链的交界区残基与重链结合,与残基Pro107之间存在氢键作用.采用分子动力学模拟和MM/GBSA方法计算了毒素DON与抗体之间的结合自由能,计算结果与实验值相吻合,体系疏水相互作用是维持复合物稳定结构的主要驱动力.动力学模拟氢键分析和能量分解结果共同表明,残基Pro107参与稳定氢键的形成并贡献很强的范德华作用,是毒素结合抗体最关键的残基.本研究为该毒素抗体的结构设计提供了重要的线索和理论依据,对毒素类分子新型抗体的研究和开发具有理论指导价值.; 郑蓉吕暾; 关键词：DON 同源建模分子对接

一株产碱性纤维素酶菌株LT3及其选育方法和产酶条件初步优化: 本发明提供一株产碱性纤维素酶菌株LT3及其选育方法和产酶条件初步优化，通过对从腐烂朽木及其附近土壤中得到的样品进行富集培养、分离纯化、经刚果红染色鉴定和液体发酵获得一株纤维素酶分泌量较高的细菌LT3、经初步鉴定、克隆序列...; 吕暾李殿殿郑蓉黄爱玲吕静琳; 文献传递

一种纳米佐剂及其制备方法: 本发明提供一种纳米佐剂及其制备方法，按比例称取硼酸、尿素、葡萄糖=10:10:3，研磨均匀，放入坩埚中，在高温电炉中进行加热，升温速率5度/min至1250度/min，保持5h，自然冷却，获得到粉末，并且再次均匀研磨，用...; 吕暾黄彩进王立波刘秋文周敏; 文献传递

不同佐剂对猪圆环病毒衣壳蛋白免疫原性的影响被引量：1: 2016年; 试验旨在研究猪圆环病毒不同佐剂疫苗的制备及其对免疫原性的影响。将去除信号肽的PCV2(porcine circovirus type 2,PCV2)Cap蛋白基因连接在pET-28a载体上,进行诱导表达,用脱氧胆酸钠(DOC)和低浓度尿素对表达产物进行溶解,制备氢氧化铝胶体佐剂、脂质体佐剂、弗氏佐剂、白油佐剂、蜂胶佐剂,并与纯化的PCV2-Cap蛋白混合制成亚单位疫苗,以商品化的灭活疫苗作为阳性对照,免疫小鼠,并使用ELISA方法检测动物血清中抗体及细胞因子含量的变化,评估其免疫保护效果。结果显示,表达产物以包涵体的形式存在,使用DOC溶解包涵体可省略蛋白复性步骤,且纯化方法简单,获得纯度较高的衣壳蛋白;ELISA检测结果表明PCV2-Cap蛋白能诱导产生特异性较高的抗体;水系佐剂制备的亚单位疫苗具有较高的免疫活性,为亚单位疫苗的商品化提供重要的数据支持。; 王立波吴润生闫超吕暾; 关键词：猪圆环病毒包涵体佐剂亚单位疫苗

一种采用新的相似性度量方法的共调控基因动态模糊聚类算法被引量：1: 2011年; 针对基因间共调控关系的特点和现有共调控基因聚类分析方法的不足,提出一种基于广义信息论中二次互信息的广义相似性度量标准QMISM,并利用免疫遗传算法将高维样本映射到二维空间,进而实现动态模糊聚类和聚类结果可视化.对人工合成数据和真实的基因表达数据的实验结果表明,该算法能得到更好的聚类结果.; 李小梅郭红吕暾; 关键词：免疫遗传算法

猪圆环病毒衣壳蛋白在枯草芽孢杆菌中的表达研究被引量：6: 2016年; 研究猪圆病毒衣壳蛋白在枯草芽孢杆菌中的表达情况。以3个不同的质粒为基础,构建不同类型的猪圆环病毒衣壳蛋白基因(PCV2-ORF2)重组表达载体,并分别转化进入枯草芽孢杆菌168和WB800中。利用SDS-PAGE和Western blot检测目的蛋白的表达,并通过实时荧光定量PCR检测目的基因的转录水平上的表达情况。结果显示,ORF2基因原序列在枯草芽孢杆菌中难以表达,经过密码子优化后,构建的截短ORF2基因表达载体在枯草芽孢杆菌内表达系统中成功表达目的蛋白。密码子优化促进了目的基因的表达。; 陈灵艳陈先进蒋烨吕暾; 关键词：枯草芽孢杆菌实时定量PCR 密码子优化

多核CPU和GPU加速分子动力学模拟被引量：6: 2011年; 在多核中央处理器(CPU)—图形处理器(GPU)异构并行体系结构上,采用OpenMP和计算统一设备架构(CUDA)编程实现了基于AMBER力场的蛋白质分子动力学模拟程序。通过合理地将程序划分为CPU单线程、CPU多线程和GPU多线程执行部分,高效地利用了计算机的处理能力。性能测试结果表明,相对于优化后的CPU串行计算,多核CPU-GPU异构并行计算模型有强大的性能优势,特别是将占整个程序执行时间90%的作用力的计算移植到GPU上执行,获得了最高可达12倍的计算加速比。; 林江宏林锦贤吕暾; 关键词：分子动力学图形处理器计算统一设备架构 OPENMP

LU分解和Laplace算法在GPU上的实现被引量：10: 2011年; 随着图形处理器(GPU)性能的大幅度提升以及可编程性的发展,已经有许多算法成功地移植到GPU上。LU分解和Laplace算法是科学计算的核心,但计算量往往很大,由此提出了一种在GPU上加速计算的方法。使用Nvidia公司的统一计算设备架构(CUDA)编程模型实现这两个算法,通过对CPU与GPU进行任务划分,同时利用GPU上的共享存储器提高数据访问速度,对GPU程序进行分支消除,并且对矩阵分段计算以达到加速计算的目的。实验结果表明,随着矩阵规模的增大,基于GPU的算法相对于基于CPU的算法具有良好的加速效果。; 陈颖林锦贤吕暾; 关键词：图形处理器 LU分解统一计算设备架构共享存储器

纤维素酶整合型重组枯草芽孢杆菌的构建及其应用: 本发明公开了纤维素酶整合型重组枯草芽孢杆菌的构建方法及其应用。具体是将纤维素酶基因克隆到枯草芽孢杆菌整合型表达载体上，构建纤维素酶重组整合表达载体，然后将重组整合表达载体转化枯草芽孢杆菌，通过双交换将纤维素酶表达元件整合...; 吕暾黄文斌黄爱玲冯荣虎; 文献传递

犬细小病毒VP2基因在枯草芽孢杆菌中的表达及鉴定被引量：3: 2011年; 从犬细小病毒/犬瘟热二联苗中提取CPV基因组,根据GenBank发表的CPV-VP2基因序列设计一对引物,对VP2基因进行PCR扩增,并克隆至TA Cloning Kit Dual Promoter(pCRⅡ),获得克隆载体pCR-VP2。将重组质粒亚克隆到枯草芽孢杆菌表达载体pHT43上,获得重组表达载体pHT43-VP2。经双酶切鉴定及序列比对分析后,将pHT43-VP2载体转化入枯草芽孢杆菌WB600中进行诱导表达,产物使用PAGE胶蛋白回收法纯化。结果表明,在69 kD处存在目的蛋白,ELISA检测发现,纯化后的目的蛋白与阳性血清存在特异性反应。; 李爽黄文斌黄爱玲吕暾; 关键词：犬细小病毒 VP2蛋白枯草芽孢杆菌