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刘阳

作品数：2 被引量：3H指数：1
供职机构：上海大学理学院更多>>
发文基金：国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域：理学更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇理学

主题

  • 1篇支持向量
  • 1篇支持向量机
  • 1篇生物基因
  • 1篇生物基因组
  • 1篇剖面
  • 1篇向量
  • 1篇向量机
  • 1篇茎环结构
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇表面积

机构

  • 2篇上海大学

作者

  • 2篇张冬宁
  • 2篇王翼飞
  • 2篇刘阳
  • 1篇汤正诠
  • 1篇沈称意
  • 1篇邵建林

传媒

  • 2篇上海大学学报...

年份

  • 2篇2006
共 2 条 记 录，以下是 1-2
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排序方式：
MiRdetector:一个预测与搜寻miRNA基因的计算工具被引量：2
2006年
MicroRNA（miRNA）是一类内源性的长约21～24nucleotide（nt）的非编码小分子RNA，能够调节其它基因的表达活性，在生物体的发育过程中发挥重要的作用．每种生物体中miRNA的基因总数还未知，生物信息学分析手段为发现新的miRNA基因提供了有效的方法．作者开发了一个预测与搜寻miRNA基因的完全自动化系统“MiRdetector”．MiRdetector系统是基于计算机比对和miRNA前体茎环结构判断的．用水稻miRNA基因对系统的预测精度进行了检验。系统正确识别了155个样本中的140个，预测精度达到90．32％，并且搜寻到了95个可能的水稻miRNA基因。由于系统的假阳性率较低，因此能够为进一步证实miRNA基因的实验研究提供高质量的数据集．
张冬宁刘阳王翼飞
关键词：生物基因组茎环结构
基于序列剖面和可及表面积的蛋白质相互作用位点的预测被引量：1
2006年
蛋白质相互作用位点的预测对于突变设计和蛋白质相互作用网络的重构都是至关重要的.由于实验确定的蛋白质复合物和蛋白质配体复合物的结构依然相当少,预测蛋白质相互作用位点的计算方法就显得十分重要.该文提出了一种以支持向量机为分类器,以邻近残基的序列剖面和可及表面积为输入数据来预测蛋白质相互作用位点的方法.计算结果显示,界面残基和非界面残基被识别的准确率为75.12%,假阳性率为28.04%.与输入数据仅有序列剖面的方法相比,界面残基和非界面残基被识别的准确率提高了4.34%,假阳性率降低了4.63%.
刘阳张冬宁邵建林沈称意汤正诠王翼飞
关键词：支持向量机剖面
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共1页<1>
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