刘宏德
- 作品数：40 被引量：40H指数：4
- 供职机构：东南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 预防或治疗阿尔茨海默症的药物、靶点及其应用
- 本发明公开了鸟嘌呤核苷单磷酸还原酶1作为预防或治疗阿尔茨海默症的药物靶标的应用，所述药物为Lumacaftor或其衍生物或含有Lumacaftor的药物组合物。鸟嘌呤核苷单磷酸还原酶1(GMPR1)的水平在阿尔茨海默症患...
- 刘宏德罗坤
- 一种基于生理生化指标识别早期糖尿病患者的方法
- 本发明公开了一种基于生理生化指标识别早期糖尿病患者的方法，包括数据收集；数据分析与预处理；模型建立，采用BP神经网络模型，所述模型包含输入层、6层隐藏层以及输出层；模型训练，按照7：3将源数据划分成训练集、测试集进行模型...
- 刘琰李珂刘宏德邱山虎孙子林
- 基于Web技术的核小体在线预测平台实现被引量：1
- 2010年
- 核小体定位是真核生物基因转录调节的重要方式,要彻底了解基因表达调控信息,就必须考虑核小体定位的调控作用,因此提供一个快速、准确的核小体在线预测平台十分必要。基于本实验室开发的运用弯曲度谱预测核小体位置的核心算法,我们构建了基于Matlab Web服务和ASP技术的核小体在线预测平台(http://www.gri.seu.edu.cn/icons/)。本文详细介绍了该平台的设计、实现过程及平台的预测结果。
- 张德金刘宏德袁志栋孙啸
- 关键词：核小体定位MATLABWEB技术
- 一种基于核小体脱氧核糖核酸模版的核小体预测方法
- 一种基于核小体脱氧核糖核酸模版的核小体预测方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1获取待预测DNA序列，长度为T，计算待预测DNA序列弯曲度信号Signal。步骤2建立核小体DNA模版信号P，P的长度为147bp，两端区域...
- 刘宏德谢建明孙啸
- Hi-C的干细胞染色质多重相互作用特征分析
- 2017年
- 染色质高级结构是基因转录调节的重要因素,染色质多重相互作用是高级结构中的一种,是多个(≥3)染色质片段在空间上相互接触而形成的紧凑结构。为了解染色质多重相互作用这类高级结构的特征及其在干细胞中分化中起到的作用,通过对Hi-C数据进行相关分析并计算基因的FPKM表达量,研究了染色质多重相互作用。分析发现:多重相互作用约占所有作用的30%,包含近70%的基因;此类作用区域的高表达基因多于低表达基因;且与组蛋白乙酰化相关性高。在分化过程中,多重作用位点数目和比例减少;位于多重作用区域的基因的表达略有降低;组蛋白乙酰化(H3K27ac和H3K23ac)在多重作用区域的减弱,而组蛋白甲基化(H3K4me3和H3K27me3)倾向于增强。结果表明,染色质多重相互作用是一种广泛存在的染色质高级结构,在干细胞分化中有重要作用,此类结构多具有H3K27ac修饰,调节基因的表达。总之,染色质多重相互作用是一种重要的基因转录调节因素,在细胞分化中具有调控作用。
- 张峰刘亚军谢建明孙啸刘宏德
- 关键词：基因表达组蛋白修饰
- 信号处理技术在生物分子序列分析中的应用被引量：1
- 2008年
- 信号处理技术在生物分子序列分析中的应用主要包括周期分析、基因预测、相似和重复序列分析、蛋白质分子结构预测等。涉及的技术方法有:Fourier变换、小波变换、相关分析、分形技术、非线性信号处理技术等。本文将全面回顾这些应用。
- 刘宏德吴建盛谢建明杨锡南徐自祥孙啸
- 关键词：基因预测
- 预防或治疗阿尔茨海默症的药物组合物及其应用
- 本发明公开一种组合物，组合物包括亚麻油酸、辣木籽油酸、花生四烯酸、b谷甾醇、维生素B1、维生素C、维生素E、维生素B5、维生素B2、维生素B3、天冬氨酸。本发明还公开组合物在制备预防治疗阿尔茨海默症的药物或食品中的应用。...
- 刘宏德
- 染色质构象解析技术——Hi-C及染色质构象信息提取被引量：6
- 2015年
- 真核生物染色质在核内的空间组织形式能影响DNA的空间分布,因而对基因转录、DNA复制等生物学过程具有调节作用。目前对这种空间上高度有序的基因组结构的认识还是粗糙的、碎片式的和不完整的。近年,利用染色质构象捕获技术发展起来的衍生技术——Hi-C技术,是一种研究全基因组范围的染色质相互作用以及探明全基因组的三维结构的分析技术。利用Hi-C技术能够对染色质内部或所有染色质之间的相互作用进行精细分析,从而把基因表达调控引入到空间的、全局性的研究层面,为全面解析与DNA有关的生物学过程的机理开启新的契机。本文主要阐述染色质构象解析技术Hi-C的实验原理、数据处理以及染色质构象信息提取,包括染色质内相互作用情况分析、全基因组基因活性分类、拓扑关联结构域(TAD)和染色质环(chromatin loop),介绍染色质构象信息与基因调控研究方面的国际前沿进展。
- 胡文桥侯越张峰刘宏德孙啸
- 一种非编码区单核苷酸基因组变异的功能预测方法
- 本发明公开了一种非编码区单核苷酸基因组变异的功能预测方法，包括以下步骤：1）染色质开放区域识别；2）转录因子结合位点识别；3）评估单核苷酸变异的作用：基于转录因子的位点特异频率矩阵，计算位于转录因子结合位点区内的单核苷酸...
- 刘宏德孙啸罗坤马伟恒
- Nucleosome Positioning Regulates 3'end Processing of Protein coding genes in the Human Genome
- Background: It has been reported that 3' end processing is coupled to transcription and nucleosome depleti...
- 黄焕刘宏德孙啸
- 关键词：NUCLEOSOMEPOSITIONINGENDPROCESSINGPOLYADENYLATION
