任松叶
- 作品数：5 被引量：2H指数：1
- 供职机构：内蒙古科技大学生物与化学工程学院生物工程与技术研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测
- 2013年
- 以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二次判别算法对核心DNA和连接DNA进行分类预测,整体准确率和相关系数分别达到83.08%和0.619.对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列与缺失序列中偏好的k-mers进行了比较,结果表明核小体缺失序列更为保守.
- 陈冰任松叶赵秀娟蔡禄
- 关键词：大肠杆菌基因组核小体定位
- 基于二级结构预测蛋白质复合体亚基相互作用
- 2010年
- 蛋白质相互作用在生命活动中起着核心作用,蛋白质复合体亚基的结合是蛋白质相互作用的一种重要形式.由于实验方法耗时耗力,因此从理论上预测蛋白质相互作用有着特殊的意义.首先对蛋白质复合体的结合区统计其二级结构、超二级结构和二级结构组合的频数,以及这些结构占整个蛋白质氨基酸链中各类统计数目的百分比,得到各类型结构出现在结合区的相对倾向值.而后,根据相对倾向值给出相结合的两个蛋白亚基的氨基酸链的打分规则.选取64个氨基酸长度为标准滑动窗口,以1为步长,将每一对蛋白链得到一组分值作为特征值输入支持向量机,构建模型.用10折交叉检验评价其预测能力,得到整体准确率、敏感性、阳性预测值和相关系数分别是64.52%、66.87%,63.92%和0.291.这表明本方法有一定的区分度,用于预测蛋白质亚基相互作用是可行的.
- 裴智勇任松叶蔡禄
- 关键词：超二级结构蛋白质相互作用支持向量机
- 人类染色体隔离子区域核小体占据情况的统计分析
- 2012年
- 计算了隔离子区的G和C占总碱基数的比例,统计分析了隔离子起始位点与终止位点上下游1 000碱基对范围内核小体的平均占据,结果表明了隔离子区序列G和C占总碱基数的比例高,隔离子区域核小体的平均占据比两翼的核小体平均占据高,得出了以下结论:序列中G和C占总碱基数比例高的DNA序列易发生弯曲和组蛋白八聚体形成致密的核小体,而隔离子区核小体占据率高有利于序列中两个转录功能域的隔离。
- 任松叶
- 关键词：人类染色体核小体
- Nucleosomes are depleted in Promoter Region in Saccharomyces cerevisiae
- Nucleosome organization is critical for various biological processes such as gene replication,transcription,DN...
- 任松叶蔡禄
- 文献传递
- 人类及酵母基因组功能区的核小体定位预测
- 核小体是构成真核生物染色质的基本结构单位。核小体在基因组DNA序列上的精确定位称为核小体定位。核小体定位在DNA复制、修复和转录调控等细胞过程中起着重要的作用。核小体定位已成为目前表观遗传学研究的热点问题。文章包括以下3...
- 任松叶
- 关键词：核小体表观遗传学酵母基因组
