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植物血红蛋白基因家族的分子进化研究被引量：1: 2014年; 植物血红蛋白(Hemoglobin)是一类由珠蛋白(Globin)和血红素(Ferroheme)组成的结合蛋白,广泛存在于植物界中。根据序列特征、表达模式及配基结合性质可将血红蛋白分为共生血红蛋白(Symbiotic hemoglobin,sHb)、非共生血红蛋白(Nonsymbiotic hemoglobin,NsHb)和截短的血红蛋白(Truncated hemoglobin,tHb)3大类,并对植物血红蛋白基因家族进行了分子系统发育分析和进化研究。结果表明,通过基因重复在被子植物中产生了class 1和class 2两类血红蛋白基因。该基因重复发生在单、双子叶植物分化之前,但由于class 2类基因在单子叶植物中发生了一次基因丢失事件,致使class1类基因广泛分布于单、双子叶植物中,而class 2类基因则仅见于双子叶植物;class 2类基因的进化速率高于class 1类基因,并分别在class 2、sHbs的祖先支上检测到了正选择的发生,表明基因重复发生后,class 2、sHbs通过插曲式进化和适应性进化获得了不同的功能;在class 1和class 2的功能性分歧位点检测中获得14个I类功能性分歧位点,但未能发现II类功能性分歧位点,这些功能性分歧位点是由正选择作用或者放松的选择限制产生的。该研究结果可以指导后续的试验工作,来验证那些具有重要功能的氨基酸置换位点和正选择位点,从而揭示功能性分歧和适应性进化的分子基础。; 齐小琼王艇; 关键词：血红蛋白基因基因家族分子进化分析适应性进化

水蕨血红蛋白基因的分子克隆和序列分析被引量：1: 2016年; 植物血红蛋白(Hemoglobin)是一类由珠蛋白(Globin)和血红素(Ferroheme)组成的结合蛋白,在植物中广泛分布,迄今已在苔藓植物、裸子植物和被子植物中克隆到血红蛋白基因序列,但在蕨类植物中相关研究还未见报道。该研究采用热不对称交错PCR(TAIL-PCR)方法克隆了水蕨血红蛋白基因的全长序列。该基因的序列总长为949 bp,包含4个外显子和3个内含子,编码189个氨基酸。预测的蛋白质(命名为CtHb)的分子量为21.14 kDa,等电点(pI)为7.81。三维结构模拟表明CtHb具有植物血红蛋白典型的三级结构:即含有A、B、C、E、F、G和H螺旋,形成了3-on-3的"三明治"结构。和水稻血红蛋白的三级结构相比,CtHb的大部分结构(包括具有远端和近端组氨酸定位的E螺旋和F螺旋的位置等)同水稻的结构极为相似。两者的不同之处主要表现在:(1)CtHb含有较长的N-端区域;(2)两者CD-loop的折叠方式不同;(3)两者螺旋B和螺旋C的连接方式不同,CtHb是通过卷曲连接的,而水稻中借助的是螺旋。结构进化分析揭示了植物血红蛋白从非共生到共生进化过程中的一些关键改变,这些改变可能有助于非共生血红蛋白向共生血红蛋白结构的转变,特别是有助于豆血红蛋白共生功能的实现。; 齐小琼葛亚飞李大卫; 关键词：植物血红蛋白结构进化水蕨

CVNH结构域的进化分析和选择压力检测被引量：3: 2010年; 蓝藻抗病毒蛋白-N(Cyanovirin-N,CV-N)具有广谱抗病毒活性,其同源物构成CVNH(Cyanovirin-N homology)蛋白家族,并且家族成员的抗人类免疫缺陷病毒结构域在进化上非常保守。文章通过重建基因树对CVNH结构域的"零散分布"特点作了更为细致的了解,发现在黑曲霉、费氏曲菌、产黄青霉、粗糙脉孢霉、蓝杆藻和水蕨等物种中存在多份该结构域拷贝。在此基础上,分别采用机理式模型(Mechanistic model)和MEC模型(Mechanistic-empirical combination model)对CVNH结构域序列位点进行适应性进化分析,结果显示:1)两类模型均未检测到统计上显著的正选择位点;2)净化选择对CVNH起主导作用;3)MEC模型更适合所研究的数据。进一步使用"支-特异"模型和"支-位点"模型对蓝杆菌菌株7822和7424的祖先分支进行检测,发现该分支经历过适应性进化,并且鉴定出6个正选择位点(34L、63L、13H、76C、78K和80I)。; 齐小琼高磊苏应娟王艇; 关键词：基因复制适应性进化

篦子三尖杉牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的克隆与序列分析被引量：1: 2016年; 三尖杉是我国特有植物,主要含有生物碱、黄酮及萜类等生物活性物质。以篦子三尖杉为试验材料,根据同源克隆的方法扩增三尖杉牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶(GGPPS)基因,并通过生物信息的方法对该基因进行鉴定和分析。结果表明,篦子三尖杉GGPPS基因全长1 217 bp,含有1个完整的1 182 bp开放阅读框(ORF),编码393个氨基酸的蛋白序列,GGPPS蛋白相对分子量为43.042 ku,理论等电点(p I)为6.57,其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;蛋白质同源分析表明,三尖杉GGPPS含有多聚异戊二烯基合成酶家族中保守的5个特征性结构和2个富含天冬氨酸的区域;同源模建分析显示,三尖杉GGPPS具有GGPPS蛋白典型的三维结构,特别与薄荷GGPPS蛋白的三维结构及活性位点极其相似;系统进化分析表明,三尖杉GGPPS蛋白归属植物进化支,且与加拿大红豆杉、曼地亚红豆杉、海南粗榧的GGPPS蛋白归为同一分支。; 齐小琼胡晨熙李大卫; 关键词：篦子三尖杉萜类化合物同源模建系统进化

An Orthogonal Experiment of Papain-Assisted Extraction of Polysaccharides from Agrocybe aegirit: 2015年; [Objective] This study aimed to explore optimum conditions for papain-as- sisted extraction of polysaccharides from Agrocybe aegirit. [Method] Because enzyme is capable of destroying organizational structure of cells, papain was selected to cat- alyze cells to let polysaccharides out. An orthogonal experiment was carried out to investigate the effects of hydrolysis temperature, hydrolysis time, enzyme concentra- tion and solid to liquid ratio on extraction of polysaccharides from A. aegirit. [Result] Through the orthogonal experiment, the optimum papain-assisted extraction conditions were obtained： hydrolysis temperature, 45 ℃; hydrolysis time, 2 h; enzyme concen- tration 2%; solid to liquid ratio, 1：80. [Conclusion] This study will provide a reference for extraction of polysaccharides from A. aegirit.; 齐小琼陈丽

芝麻成株期茎点枯病原菌致病性研究被引量：1: 2012年; 通过对芝麻成株期茎点枯病病原菌的致病性进行研究,从而为芝麻种质资源的抗病性鉴定,发掘抗源,加快抗病育种进程提供技术方法。对感茎点枯病芝麻植株进行病原菌分离纯化及鉴定获得具有高致病力的病原菌株Macrophomina phaseolina,再进行芝麻成株期致病性鉴定,并对感病植株进行病原菌再分离及鉴定。对分离纯化的病原真菌进行表型及分子鉴定,从而确定该病原真菌为M.phaseolina,对该类型病原菌进行芝麻芽期致病力接种鉴定并选取致病力高的菌株用于芝麻成株期致病力接种鉴定。在接种后的成株期芝麻茎杆内,M.phaseolina会导致维管束组织形成一个由上往下逐渐坏死的棕黑色条纹,随后开始呈放射性收缩并坏死并逐渐扩大,所有病原菌接种的茎杆上都出现大量的菌核。对所有接种病原菌的植株感病茎杆进行病原真菌再分离纯化及鉴定,确定再次获得的病原真菌仍为M.phaseolina。芝麻茎点枯病病原菌的分离鉴定、致病性鉴定以及病原菌再分离结果都符合科赫法则,为芝麻茎点枯病相关研究提供方法支持。; 黎冬华张艳欣王林海吕海霞危文亮齐小琼丁霞张秀荣; 关键词：芝麻成株期

水蕨抗人类免疫缺陷病毒蛋白同源物的基因及制备方法和应用: 本发明公开了一种水蕨抗人类免疫缺陷病毒蛋白同源物的基因及制备方法和应用，步骤：1.总DNA提取：用改良的CTAB法提取总DNA，保存；2.水蕨抗人类免疫缺陷病毒蛋白同源物基因中间片段的扩增；3.水蕨抗人类免疫缺陷病毒蛋白...; 齐小琼苏应娟王艇杨永霞; 文献传递

芝麻核心种质芝麻素和芝麻酚林的关联分析被引量：12: 2014年; 选用来源我国黄河流域至长江流域8省215份芝麻核心种质材料，对其种子中芝麻素（sesamin）和芝麻酚林（sesamolin）含量进行测定，芝麻素平均值5．24mg／g，变异范围为0．88～11．05mg／g，变异系数38．56％，芝麻酚林平均值3．30mg／g，变异范围为0．93—6．96mg／g，变异系数22．68％，二者均符合正态分布，且相关分析表明两者间呈极显著正相关；采用标记一性状关联分析法，进行芝麻素和芝麻酚林与SSR、SRAP、AFLP标记的关联分析。利用GLM模型共检测到33个标记与芝麻素和芝麻酚林极显著（P〈0．01）关联，同时与两种成分显著关联的有4个；利用MLM模型共检测到8个显著关联的标记，与两种成分显著关联的分别有4个；其中SSR标记SSll82-3在两种模型中同时极显著关联到芝麻素和芝麻酚林，且解释率较高。该研究将为芝麻功能性成分遗传改良和分子标记研究奠定重要基础。; 王蕾黎冬华齐小琼张艳欣丁霞王林海危文亮高媛张秀荣; 关键词：芝麻芝麻素

热水法提取香菇多糖和茶树菇多糖研究被引量：15: 2016年; 真菌多糖具有降血糖、抗肿瘤、抗氧化、抗病毒和免疫调节等多种生理功能,且对机体毒副作用小,具有广阔的开发前景。以营养价值和药用价值均较高的香菇(Lentinus edodes)、茶树菇(Agrocybe aegirit)为原料,用热水提取法在90℃、料液比1∶20(g∶m L)、提取1次、4 h的条件下,提取两种真菌多糖。结果表明,热水法提取香菇多糖的得率为9.70%,茶树菇多糖的得率为13.10%,说明茶树菇中的多糖含量高于香菇。该研究可为后续开发利用真菌多糖提供重要依据。; 齐小琼邓雯卿李大卫; 关键词：多糖

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齐小琼

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