闫晓红 作品数:52 被引量:94 H指数:6 供职机构: 中国农业科学院油料作物研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 湖北省自然科学基金 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
甘蓝型油菜BnADC基因的克隆及原核表达 被引量:1 2012年 利用同源克隆和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术从甘蓝型油菜中克隆到精氨酸脱羧酶(Arginine decarboxylase,ADC)基因cDNA全长序列,命名为BnADC。BnADC全长为2 649bp,包含344bp的5'非翻译区(5'Untranslated region,5'-UTR)、226bp的3'非翻译区(3'Untranslated region,3'-UTR)和2 079bp的完整开放阅读框(open reading frame,ORF),编码75.1kD的蛋白质。5'-UTR中含有12bp的uORF(Upstream open readingframe),编码MIRE 4个氨基酸。氨基酸同源性比对表明,BnADC蛋白与其他植物ADC蛋白具有很高的相似性,与芥菜的同源性高达93%;系统进化树分析表明,BnADC与芥菜、拟南芥的ADC亲缘关系较近。在获得全长cDNA的基础上,构建融合表达载体pET30a(+)-BnADC,转化大肠杆菌(Escherichia coli)表达菌株BL21(DE3),SDS-PAGE检测到一个约81.1kD的融合蛋白被E.coil表达,且融合蛋白主要存在于菌体沉淀中。 洪林 闫晓红 袁亚宾 刘王辉 胡长清 李晨 陈春丽 魏文辉关键词:甘蓝型油菜 同源克隆 RACE 原核表达 一种甘蓝型油菜雄性不育基因BnMS5e、cDNA、蛋白、载体、工程菌及其应用 本发明涉及一种甘蓝型油菜雄性不育基因BnMS5<Sup>e</Sup>、cDNA、蛋白、载体、工程菌及其应用,属于生物育种技术领域。所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明所述基因BnMS5<Sup>e<... 曾新华 吴刚 闫晓红 袁荣 王淼 刘芳 罗军玲 武玉花 朱莉 李晓飞 李均植物基因叠加技术的研究进展 被引量:2 2011年 将不同外源基因转入植物并实施基因叠加是植物基因工程技术发展的一个重要方向。虽然在商业化的转基因作物中,一部分已经实现了基因叠加和优良性状的重组,但只是极少数转基因事件实现了3个或者更多外源基因的导入。为此,综述了基因叠加的几种主要方法,分析了其面临的问题,并对其发展前景进行了展望。 谭茂玲 李晨 闫晓红 梁国鲁 魏文辉关键词:植物 转基因 一种基因编辑位点特异性PCR方法的开发和应用 2021年 为了对基因组编辑产品进行精准定性和定量检测,以水稻SP1基因的编辑植株为材料,在编辑位点上下游设计通用引物,在编辑位点处设计基因编辑位点特异性TaqMan探针,建立了编辑位点特异性PCR方法。利用该方法可准确鉴定特异基因组编辑产品,检测灵敏度达到5~10拷贝,可在实时荧光PCR(qPCR)和微滴数字PCR(ddPCR)平台上对基因组编辑产品进行定量检测。由于数字PCR的微反应单元可消除野生型DNA对通用引物的竞争性消耗,与qPCR的定量结果相比,ddPCR定量结果具有更高的定量准确性。 张洪文 赵圣博 闫晓红 李俊 翟杉杉 肖芳 高鸿飞 李允静 吴刚 武玉花关键词:身份鉴定 甘蓝型油菜ADC基因片段的克隆及序列分析 被引量:1 2012年 【目的】克隆甘蓝型油菜精氨酸脱羧酶(ADC)基因的cDNA片段,为进一步获得ADC基因全长及研究其的生物学功能奠定基础。【方法】以甘蓝型油菜(Brassica napus L.)品种中双6号的花蕾为材料,设计简并引物,采用同源克隆法扩增ADC基因的cDNA片段。【结果】成功扩增获得8个不同的ADC基因拷贝,按长度将其分为1011、999、981bp3类,8个拷贝核苷酸序列之间的同源性为81%~99%,其推导氨基酸序列之间的同源性为86%~99%。1011bp片段包含3种不同的序列S1~S3,序列间存在9个单核苷酸多态性(SNP)位点。999bp序列包含S4和S5,具有3个SNP位点,两个区段出现连续碱基缺失。981bp序列包含S6~S8,发现14个SNP位点,且第67位核苷酸出现无义突变,4个区段发生碱基缺失。序列S4~S8共同缺失第632~634、642~650位的核苷酸小片段。氨基酸同源比对和系统进化分析结果表明,8个不同ADC基因拷贝与芥菜(Brassica juncea L.)、拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)、盐芥(Thellungiella halophila L.)等物种的ADC基因同源性高,亲缘关系近。【结论】所获得的8个基因拷贝即为来自于甘蓝型油菜ADC基因的片段。 洪林 闫晓红 李晨 刘正富 魏文辉关键词:甘蓝型油菜 同源克隆 鉴定空气中痕量转HSA基因工程水稻花粉基因型的方法 本发明公开了一种鉴定空气中痕量转HSA基因工程水稻花粉基因型的方法,过程包括:于水稻盛花期,以涂油凡士林的载玻片在距离转基因水稻种植源50米以外的地方收集花粉;将收集到的花粉转移至PCR管中,并以单细胞基因组扩增试剂盒进... 罗军玲 李晓飞 闫晓红 姜伟华 姚晓青 李俊 赵圣博 刘芳 吴刚甘蓝型油菜温敏GMS TE5A幼蕾酵母双杂交cDNA文库的构建及筛选 被引量:2 2016年 为进一步解析甘蓝型油菜温敏细胞核雄性不育系(GMS)TE5A的不育机理,筛选与育性蛋白Bna A.tsMs互作的重要蛋白。提取不育系TE5A的幼蕾(直径≤2mm)总RNA,利用SMART(switching mechanism at 5'end of the RNA transcript)技术构建酵母双杂交cDNA文库和诱饵载体p GBKT7-Bna A.tsMs,转化酵母菌株Y2H gold,检测其毒性和自激活活性,通过Mating方法筛选与蛋白Bna A.tsMs互作的蛋白,并根据基因注释推测其功能。结果成功地构建了甘蓝型油菜温敏细胞核雄性不育系TE5A幼蕾酵母双杂交cDNA文库,文库库容量为2×107cfu,重组率达到100%,插入片段平均长度大于1.8kb。发现诱饵载体p GBKT7-Bna A.tsMs对酵母没有毒性,没有自激活活性。筛选出49个候选互作蛋白,其中有丝分裂纺锤体检测点蛋白(BUBR1)、周期蛋白D3(cyclin-D3)和F-box蛋白(FBW2)三个互作蛋白可能与该不育蛋白相互作用,共同调控该不育系TE5A的育性。 李可琪 王莎莎 曾新华 闫晓红 吴刚关键词:甘蓝型油菜 蓖麻成熟期胚抑制消减cDNA文库构建及其差异表达基因分析 被引量:3 2009年 利用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术,以高含油量蓖麻品种油蓖5号开花后第15d胚和36d胚为实验材料构建36d成熟期胚消减cDNA文库。文库的插入片段平均长度约400bp,随机挑取700个克隆进行PCR筛选,获得596个阳性克隆,经过点杂交筛选后选择了521个阳性克隆进行测序。经过同源性比对归并后得到96个差异表达基因,其中包括31个未知基因。已知基因涉及油脂合成、糖的分解、蛋白质贮藏与降解等多个方面。本研究还通过RT-PCR检测了部分可能与蓖麻油脂合成相关基因的差异表达水平,对其可能的功能进行了简要的分析。 高艳平 王力军 陈春丽 闫晓红 严兴初 魏文辉关键词:蓖麻 抑制性消减杂交 CDNA文库 一种与油菜显性细胞核不育相关的基因辅助育种的分子标记及其应用 本发明公开了一种与油菜显性细胞核不育相关的基因辅助育种的分子标记及其应用,涉及油菜分子育种技术领域。本发明提供了油菜显性细胞核不育相关的基因辅助育种的分子标记、鉴定引物、试剂盒以及在油菜及相关作物显性细胞核雄性不育杂种优... 曾新华 闫晓红 吴刚 袁荣 王淼 罗军玲 刘芳 朱莉 李晓飞 李均文献传递 一种快速鉴定二倍体T<Sub>0</Sub>代基因编辑作物双等位基因纯合突变的方法 本发明提供了一种快速鉴定二倍体T<Sub>0</Sub>代基因编辑作物双等位基因纯合突变的方法,涉及基因型鉴定技术领域;通过T7E1内切酶处理待测T<Sub>0</Sub>代基因编辑植株的PCR产物来去除嵌合体、杂合体和... 闫晓红 吴刚 赵圣博 罗君玲文献传递