赵利峰 作品数:11 被引量:38 H指数:4 供职机构: 中国海洋大学海洋生命学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 国家重点实验室开放基金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 更多>>
肝脏细胞生长相关基因在大鼠肝再生中表达模式和作用分析 肝脏有很强再生能力,部分肝切除(partial hepatectomy,PH)后,残肝细胞经过激活、增殖、再分化及组织结构重建等生理生化活动、持续约一周时间将丢失的肝组织补偿,这一过程称为肝再生(liver regene... 赵利峰关键词:肝脏细胞 肝再生 肝脏干细胞 肝细胞生长和分化相关基因在大鼠肝再生中的表达方式及作用分析 被引量:1 2008年 目的在基因转录水平了解肝再生中肝细胞的生长和分化情况。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与肝细胞生长和分化基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生(LR)中的表达情况,通过比较手术组和假手术组中基因表达差异性以确定上述基因中的肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中110个基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5~4h)、G0/G1过渡(PH后4~6h)、细胞增殖(PH后6~66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72~168h)等4个阶段起始表达的基因数为63、11、43和3,基因总表达的次数为63、43、101和80,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调488次,下调248次,分为6种表达方式,表明肝再生中细胞生理生化活动的多样性和复杂性。结论肝细胞生长和分化贯穿于整个肝再生中。 徐存拴 赵利峰 常翠芳 陈晓光关键词:分化 肝再生相关基因 大规模鉴定大鼠0,4,36,72,96h短间隔连续部分肝切除中再生肝差异表达的基因 2005年 用抑制性消减杂交方法(SSH)构建了短间隔连续部分肝切除(SISPH)再生肝的消减cDNA文库,从中筛选出了551个与肝再生相关的基因,把这些基因制成cDNA微阵列(cDNA芯片),分析它们在0h正常肝及4,36,72,96h再生肝中的动态变化发现,185个基因至少在肝再生的一个时间点表达变化达2倍以上;185个基因中的86个属未报道的基因,99个为已报道的基因,但在此之前尚不知道它们与肝再生有关;185个基因中的103个在肝再生中表现上调表达,82个表现下调表达.用GeneMath软件和GeneSpring方法对这些基因在肝再生中的表达轮廓进行聚类分析表明,基因的表达模式可分为8组,即早期诱导、中期诱导、晚期诱导、持续诱导、早期抑制、中期抑制、晚期抑制和持续抑制.与一次性部分肝切除(PH)相比,41个基因在SISPH中特异性表达,其他基因在两个模型中的表达趋势相同,但在各时间点的表达丰度有差异.综合分析可见,抑制性消减杂交技术与基因芯片技术相结合是研究再生肝差异表达基因的有效方法;肝再生中上调表达的基因多于下调表达的基因;早期诱导的基因多于晚期诱导的基因;诱导表达幅度大的基因少于诱导表达幅度小的基因. 徐存拴 袁金云 韩鸿鹏 常翠芳 李文强 杨柯金 赵利峰 李玉昌 张会勇 Salman Rahman关键词:短间隔连续部分肝切除 抑制性消减杂交技术 CDNA微阵列 CDNA芯片 杂交方法 脂肪细胞分化相关基因在大鼠再生肝中表达变化(英文) 被引量:5 2007年 肝脏由多种细胞构成,肝再生与细胞分化密切相关,细胞分化受基因转录水平调控。为在基因转录水平了解脂肪细胞分化基因在大鼠肝再生中作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome2302.0芯片检测它们在大鼠肝再生(liver regeneration,LR)中表达情况,将三次检验结果相同或相似、在肝再生中表达变化2倍以上、真手术组和假手术组相比差异显著的基因视为肝再生相关基因。初步证实上述基因中75个基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5-4h)、G0/G1过渡(PH后4-6h)、细胞增殖(PH后6-66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72-168h)等四个阶段起始表达的基因数为44、13、30和1;基因的总表达次数为88、58、302和90。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调313次、下调167次,分为43种表达方式。表明肝再生中脂肪细胞发生和分化相关基因活动多样和复杂。根据本文研究结果推测,上述基因不仅调节脂肪细胞分化,而且参与肝再生的生理生化活动。 赵利峰 邵恒熠 徐存拴关键词:部分肝切除 GENOME 脂肪细胞分化 肝再生相关基因 大鼠短间隔连续部分肝切除中再生肝的基因表达差异 被引量:6 2004年 目的:鉴定0-36-40-44 h大鼠短间隔连续部分肝切除(0- 36-40-44 h SISPH)中与肝再生有关的基因,并分析他们在肝再生中的表达动态和作用. 方法:从0-36-40-44h SISPH再生肝消减cDNA文库中筛选与肝再生有关的基因,用基因芯片技术分析其在肝再生中的表达动态,并用GeneMath软件对有关基因进行聚类分析. 结果:用基因芯片技术分析的551个与肝再生有关基因中, 157个基因至少在肝再生的—个时间点表达变化达2倍以上,其中,上调表达的基因有87个,下调表达的基因有70个;157个基因中的71个属未报道的基因,86个为已报道基因,但在此之前尚不清楚他们与肝再生有关;聚类分析和统计学分析表明,0-36-40-44 h SISPH的基因表达模式分为6类,即早期诱导,中期诱导,晚期诱导,早期抑制,中期抑制,晚期抑制.与PH相比,38个基因在0-36-40-44 h SISPH中特异性表达,119个基因在这两个模型中表达趋势相同,但在各时间点的表达丰度不同. 结论:0-36-40-44 h SISPH中,上调和下调表达的基因数目相差不大;晚期表达的基因多于早期表达的基因,远多于中期表达的基因;表达幅度小的基因(2-5倍)多于表达幅度大的基因. 徐存拴 韩鸿鹏 袁金云 常翠芳 李文强 杨柯金 赵利峰 李玉昌 张会勇 Salman Rahman 章静波关键词:肝再生 基因芯片技术 细胞周期蛋白 肝干细胞的来源与作用 被引量:16 2004年 卵圆细胞(oval cells)是肝脏内体积小、细胞质清澈、核卵圆形、不易定性的细胞。它们可能来源于骨髓或与骨髓有关的细胞群,是活化形式的肝干细胞。肝干细胞的形态特征与卵圆细胞相似,生化标记为c-kit/CD^(45)/TER19。本文总结了人们对肝干细胞的认识和肝干细胞在肝脏发育、肝再生、肝癌发生中的作用及与其它细胞来源的联系。 徐存拴 赵利峰 杨柯金 章静波关键词:卵圆细胞 肝干细胞 肝再生 肝癌发生 性别决定与分化相关基因在大鼠肝再生中的表达模式和作用分析 被引量:1 2007年 目的在基因转录水平了解调控性别决定与分化基因在肝再生中的作用。方法查阅相关论文和NCBI、GENMAPP、KEGG、BIOCARTA、RGD等网站获得调控性别决定与分化基因,用Rat Genome 230 2.0芯片分析它们在大鼠肝再生中表达变化和作用。结果肝再生启动[部分肝切除(PH)后0.5-4h]、G0/G1过渡(PH后4-6h)、细胞增殖(PH后6-66h)、细胞再分化和组织结构功能重建(PH后72-168h)等4个阶段起始表达的基因数为41、61、8和3;总表达的基因数为41、25、57和41。表明肝再生相关基因主要在肝再生启动阶段开始表达,在不同阶段发挥作用。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调次数相近等5类,涉及22、9、15、9和7个基因,共表达上调231次、下调146次,表明肝再生中多数基因表达加强,少数基因表达降低。它们表达的时间相关性分为15组,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性。它们的表达模式分为20类,表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。结论雄性性别决定、分化和雌性性别分化相关基因主要在肝再生晚早期和前期表达增强,雌性性别决定相关基因主要在肝再生前期表达增强,与肝再生密切相关。 李鹏鸽 阴棉棉 赵利峰 徐存拴关键词:部分肝切除 性别决定 性别分化 肝再生相关基因 调控肝再生的基因和生长因子的研究进展 被引量:10 2004年 赵利峰 徐存拴 王林嵩 章静波关键词:肝再生 基因 肝干细胞的生长和分化与大鼠肝再生的相关性分析 被引量:2 2008年 目的在基因转录水平了解肝干细胞在大鼠肝再生中的作用。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与肝干细胞生长和分化的基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠部分肝切除(PH)后肝再生中的表达情况,用比较真、假手术中基因表达差异性确定上述基因中的肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中50个基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5~4h)、G0/G1过渡(PH后4~6h)、细胞增殖(PH后6~66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72~168h)等4个阶段起始表达的基因数为24、10、21和2;基因总表达次数为242、3、46和26,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调153次、下调123次,分为6种表达方式,表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。结论肝再生中肝脏干细胞的生长和分化活动加强,与某些基因表达状态和方式有关。 赵利峰 徐存拴关键词:部分肝切除 肝干细胞 分化 肝再生相关基因 肌细胞分化基因与大鼠肝再生的相关性分析(英文) 被引量:1 2007年 肌细胞是组织器官的重要组成部分。为在基因转录水平了解肌细胞分化相关基因在大鼠肝再生中的作用.本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生(liver regeneration,LR)中表达情况,用比较真、假手术基因表达的差异性方法确定肝再生相关基因。初步证实上述基因中52个基因与肝再生相关。根据肝再生中基因表达的时间相关性将上述基因聚合为0.5-1h:2-12h;16、30、42、96h;18-24、36、48-60h;66-72、120- 168h等5类,表达上调和下调的基因数分别为8和10,24和8,21和24,53和64,28和36。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调次数相近等5类,涉及15、10、17、7和3个基因,共上调表达143次、下调136次,分为8类表达方式。表明肌细胞分化相关基因表达变化多样和复杂。根据上述结果推测,肝再生中成肌细胞和平滑肌细胞分化增强;骨骼肌和心肌细胞分化相关基因参与肝再生的生理生化活动。 赵利峰 张明真 徐存拴关键词:部分肝切除 GENOME 肌细胞分化 肝再生相关基因