李阳
- 作品数：8 被引量：7H指数：1
- 供职机构：江南大学理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省普通高校研究生科研创新计划项目中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：理学自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 改进的实时图像拼接方法被引量：1
- 2010年
- 通过分析比较不同配准算法的优缺点,提出一种基于灰度相关与特征点相结合的实时图像拼接方法。算法首先对图像进行自适应缩放,调整为需要输出的大小,然后用基于特征边缘点方法确定配准方向和大体位置,用基于灰度相关方法准确定位最佳匹配点,最后通过加权平均法对重叠图像进行融合处理。实验结果表明,算法能准确地对图像进行拼接,具有实时性和高效性。
- 李阳林意
- 关键词：图像拼接图像配准图像融合灰度相关全景图
- 基于粗粒化的流感病毒蛋白进化树构建被引量：1
- 2016年
- 在127 065条血凝素、神经氨酸酶流感病毒蛋白基础上,提出基于粗粒化的病毒蛋白进化树的构建方法.首先基于病毒蛋白序列特征,给出序列间相似性度量,提取流感病毒系统层次递阶结构,并定义层次聚类指标,确定最佳聚类数.然后基于距离中心最近的原则提取流感病毒系统代表.最后采用距离度量构造流感病毒进化树.实验表明,相同流感病毒具有宿主相同、时间跨度较小、爆发地点相近,更倾向于处于相同分支的特点,这与已有的文献吻合,因此该方法有利于挖掘病毒变异轨迹.
- 李阳唐旭清
- 关键词：流感病毒进化树粗粒化结构聚类
- 大规模灾害救助中面向伤员簇的救护车配置
- 2013年
- 研究了伤员簇人数函数和救护车救助能力函数的性质,提出了大规模伤员救助中救护车满负荷工作约束的简化等价条件。基于此条件,给出了伤员救助工期的一个下界和单种救护车情形下的最小救助工期。通过建立数学模型,在给定救助工期的条件下求救护车最小需求量及其分配方案;在给定救护车数量条件下求最小工期和最小总加权工期救护车分配方案。以上模型考虑了多种规格救护车的组合。利用模拟地震场景数据进行试算,结果表明模型的合理性和求解方法的有效性。
- 魏国强李阳
- 关键词：突发事件
- 基于粒度空间的最优聚类指标研究被引量：1
- 2018年
- 本文在粒度空间理论的基础上，进行了基于粒度空间的最优聚类模型研究．具体包含以下三个内容：首先提出了基于类内偏差和类间偏差获取数据分层结构的优化聚类指标，进一步建立最优聚类模型，证明了该模型解的存在性，并给出了相应的算法；其次将发生在1902～2015年间同时含有HA与NA蛋白的甲型HIN1流感病毒序列作为实验数据库，应用本文提出的优化模型和算法构建了流感病毒蛋白系统的第一级结构和第二级结构，基于距离中心最近原理建立了签名病毒选取的优化模型，挑选签名病毒蛋白，并构建H1N1流感病毒的核心进化树；最后基于距离中心最近原则构建分类器以验证本文方法的有效性．实验结果表明：应用本文方法处理甲型H1N1流感病毒可得到非常好的分类结果，且正确率达到93．25％．这些为基于大数据的信息处理提供一整套全新的处理方法．
- 唐旭清梁启浩李阳
- 关键词：粒度空间多层结构
- 基于H1N1型禽流感病毒的HA蛋白序列进化树研究被引量：1
- 2015年
- 为了从本质上揭示H1N1病毒分子的变异、流感流行等关系,提出一种构建H1N1病毒进化树新方法。在1902—2013年全球22 455条H1N1型禽流感病毒HA蛋白质序列数据的基础上,利用其特征向量构建基于内积的HA蛋白质序列相似度。采用基于相似度的完全聚类图的方法进行数据系统粗粒化的相似信息提取。最后,利用基于模糊邻近关系的结构聚类方法进行H1N1型禽流感病毒HA蛋白质序列的进化树研究,将病毒分为33大类。进一步分析表明,H1N1病毒的变异不仅与爆发时间密切相关,还与所分布地域及地域间的距离有很大关系,即分布地域间的距离越近,爆发的病毒进化的相似程度越高。对大量的病毒进行进化树分析,从宏观角度体现了各类病毒之间的进化关系。
- 薛晓丽李阳唐旭清
- 关键词：H1N1病毒结构聚类进化树
- 基于功率谱的蛋白质序列特征提取新方法被引量：1
- 2018年
- 采用分层聚类和熵评价方法进行基于功率谱的蛋白质序列特征提取新方法研究。具体包含以下3个内容:首先,基于经典的HP模型给出了氨基酸序列的数值序列表达;其次,采用离散傅里叶变换方法获取蛋白质序列的特征频谱,构造12维特征向量;最后,利用分层聚类法获取蛋白质序列的分层结构。这种新方法将基于功率谱的DNA序列特征提取方法推广到蛋白质序列上。通过基于19条动物线粒体脱氢酶亚基1和亚基4,以及11条β珠蛋白等3组数据的分层结构比较实验,结果表明,新方法在数据系统的分层结构的信息提取上优于基于功率谱的DNA序列分析方法。因此,新方法对确定未知基因的结构与功能有重要的生物意义。
- 梁启浩李阳唐旭清
- 关键词：DNA序列功率谱分层聚类蛋白质序列
- 基于功率谱的流感病毒蛋白质序列结构分析被引量：1
- 2017年
- 基于经典HP模型,本文采用离散傅里叶变换获取蛋白质特征,利用分层聚类方法进行蛋白质序列的结构分析。其目的是将自动信号频谱分析技术与层次聚类方法相结合,并应用到蛋白质序列结构分析中。通过流感病毒HA和NA蛋白质序列的实验结果表明:应用该方法可得到非常好的分类结果。这些研究为基于大数据的蛋白质序列的自动信息提取和结构分析提供基础。
- 梁启浩李阳唐旭清
- 关键词：流感病毒离散傅里叶变换分层聚类蛋白质序列
- 不同特征描述下H1N1病毒血凝素蛋白序列的比较分析被引量：4
- 2016年
- 在传统表征蛋白质序列的40维特征向量的基础上,依据氨基酸的种类与理化性质,将蛋白质序列40维向量分解为20维、4维和16维3种子特征向量描述。结合33条H1N1流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)蛋白质序列和统计学相关性分析理论,进行了蛋白质序列两两之间及每条病毒蛋白质序列对应的不同子特征向量之间的相关性分析,发现病毒蛋白质序列之间存在高度相关性,且每条病毒蛋白质序列对应的20维子特征向量与其他两种子特征向量之间均不显著相关,而4维与16维子特征向量之间显著相关。进一步依据不同的特征向量对33条HA蛋白质序列进行分类,研究发现依据40维特征向量与16维特征向量进行的分类结果高度一致。因此,在不影响表征病毒序列特性的前提下,对于已有的表征蛋白质序列的40维特征向量,可以用16维的特征向量进行代替,以减少计算复杂度。
- 李巍巍李阳唐旭清
- 关键词：H1N1流感病毒特征向量系统聚类
