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排序方式：

基于RNA-Seq技术的甘蔗参考转录组建立及分析被引量：6: 2015年; 本研究基于RNA-Seq技术建立了一个由3个甘蔗原始亲本和8个不同来源的甘蔗栽培品种/系构成的甘蔗参考转录组,并进行生物信息学相关分析。研究结果表明:对供试材料+1叶RNA混合样本进行转录组测序,可组装出98 945条Contig,从中找到5 806个SSR位点,其中三核苷酸重复最多、六核苷酸重复最少,CCG/CGG出现的频率最高。进一步处理Contig获得75 656条Unigene,将所有的Unigene与Nr数据库、Swiss-Prot数据库、KEGG数据库和COG数据库进行Blast,有53 951条Unigene得到注释。在Nr和KEGG注释结果基础上,对Unigene进行GO和KEGG功能分类,分别获得44个功能小组和123个Pathway注释。研究结果可为研究甘蔗在不同时空条件下的差异基因表达奠定基础。; 李穆程志远石莹何平王先宏何丽莲李富生; 关键词：甘蔗 RNA-SEQ UNIGENE SSR

云南鸢尾上发现番茄环纹斑点病毒被引量：11: 2014年; 从云南鸢尾上采集到疑似感染番茄斑萎病毒属病毒的样本KBG-IR,经过TSWV和INSV免疫试纸条检测、RT-PCR,克隆和测序.获得病毒样本NP （834 bp）,NSs（1380 bp）,NSm （930 bp）以及部分L RNA片段（923 bp）.测序分析表明,KBG-IR分离物所扩增片段与番茄环纹斑点病毒（TZSV）的核苷酸序列同源性达到96.1％～97.8％,氨基酸序列同源性为96.1％～ 100％.构建系统进化树也体现了序列的高度一致性.寄主范围测定结果与TZSV相近.这些数据表明该病毒为番茄环纹斑点病毒,这是首次在鸢尾上发现TZSV.; 李秋芳智龙李穆徐烨黄亚宁刘雅婷; 关键词：鸢尾番茄斑萎病毒属

甘蔗细茎野生种ScNAC1基因的克隆与功能分析被引量：4: 2015年; 本研究根据转录组信息从甘蔗细茎野生种(Saccharum Spontaneum)中克隆得到一个抗旱相关的NAC家族基因,命名为Sc NAC1(NCBI accession KP742345)。研究结果显示:该基因包含一个1 212个碱基的开放阅读框,编码403个氨基酸;通过序列比对发现该基因在N端具有保守的NAC结构域,进化树分析显示Sc NAC1属于NAC家族基因的NAP亚家族;通过将Sc NAC1-GFP融合载体转化拟南芥原生质体中,证明Sc NAC1定位于细胞核内;定量PCR检测在甘蔗细茎野生种发育不同时期Sc NAC1对于干旱的响应,发现Sc NAC1在各个时期都受干旱诱导。研究结果可为进一步研究甘蔗干旱响应机理提供参考。; 程志远李穆石莹何平王先宏何丽莲李富生; 关键词：甘蔗细茎野生种干旱功能分析

甘蔗苗期对干旱胁迫的生理响应研究被引量：5: 2014年; 为研究云南6个甘蔗品种苗期对干旱胁迫的响应,确定各品种的抗旱性,采用盆栽试验的方法,在人工控水造成干旱胁迫的条件下,测定可溶性糖含量、游离脯氨酸含量、叶绿素含量、丙二醛含量、水分含量和质膜透性等生理指标。采用模糊隶属函数、系统聚类法对多指标进行综合分析,全面评价6个甘蔗品种的抗旱性。结果表明:‘闽糖69-421’表现出较强的抗旱性,‘新台糖22’和‘桂糖11’表现为中度抗旱性,‘粤糖86-368’、‘滇蔗01-58’、‘粤糖93-159’表现出较弱的抗旱性。; 何平程志远李穆石莹李富生; 关键词：甘蔗干旱胁迫生理响应抗旱性

甘蔗印度种响应干旱胁迫的数字基因表达谱被引量：5: 2018年; 本研究以甘蔗印度种的代表品种"春尼"为试材,采用数字基因表达谱(DGE)技术对干旱胁迫后的"春尼"进行差异基因表达分析,共筛选到差异表达基因9 810个,其中上调表达4 687个,下调表达5 123个。GO功能显著性富集分析表明:差异表达基因主要定位于细胞质、质体、叶绿体、类囊体等,主要行使催化活性、氧化还原酶活性、辅因子结合、裂解酶活性等功能,主要涉及小分子代谢、细胞酮体代谢、有机酸代谢、含氧酸代谢、化学刺激应答、非生物刺激应答等生物过程。KEGG显著性富集分析表明:差异表达基因主要涉及植物激素信号转导、RNA转运、次生代谢产物的生物合成、淀粉和蔗糖代谢、泛素化蛋白降解、嘌呤碱代谢等通路。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)分析2个差异表达上调基因在"春尼"的苗期、伸长期、成熟期受干旱诱导的表达情况,结果均为"上调-上调-上调"模式,验证了DGE测序结果可靠、重复性好。; 李穆李穆程志远何丽莲王先宏; 关键词：干旱差异表达基因

几个甘蔗品种在伸长期对干旱胁迫的响应差异研究被引量：3: 2014年; 研究6个云南甘蔗主栽品种新台糖22号、闽糖69-421、桂糖11号、粤糖86-368、粤糖93-159、滇蔗01-58对干旱胁迫的响应差异。采用大棚盆栽和人工控水的方法对6个处于伸长期的甘蔗品种进行干旱胁迫,处理期间调查供试品种株高、茎径、有效茎等形态指标,测定脯氨酸含量、可溶性糖含量、叶绿素含量、净光合速率、气孔导度、蒸腾速率等生理指标。结果表明:综合各种生理指标的模糊隶属函数评价法和系统聚类分析法,是一种较科学的抗性鉴定方法,适用于多个品种之间的比较;生理指标结合形态指标来看,抗旱性最好的品种是新台糖22号和粤糖86-368,适合在云南干旱地区种植。; 何平程志远李穆石莹李富生; 关键词：甘蔗干旱胁迫生理响应抗旱性

SNP技术及其在作物研究上的应用被引量：5: 2014年; SNP(单核苷酸多态性)是最新发展起来的第三代分子标记技术,具有分布广、多态信息量大、易于检测和统计分析等特点。目前,SNP技术在水稻、玉米、大豆等作物研究中应用较多。本文综述该技术在这些作物的遗传标记、分子标记辅助选择、构建高密度遗传连锁图谱、绘制EST图谱等方面的研究进展。; 石莹李穆何平李富生; 关键词：SNP 分子标记作物

利用高通量测序分析甘蔗的抗旱响应机制被引量：6: 2015年; 干旱是一种重要的非生物胁迫形式,农作物产量受干旱影响巨大。甘蔗是一种重要的经济和能源作物,而目前对于甘蔗干旱响应调节过程知之甚少。本研究利用高通量测序技术,对甘蔗品种新台糖22在伸长期的抗旱机理进行研究,发现6 861个上调基因和4 574个下调基因,并发现存在大量差异表达基因参与代谢和响应刺激等生物学过程。另外本研究还发现了一系列参与水分和氧化胁迫响应的基因,并找到许多起调节作用的转录因子和蛋白激酶,最后利用定量PCR证明测序结果的可靠性。; 程志远李穆石莹何平何丽莲李富生; 关键词：高通量测序差异表达基因生物学过程定量PCR

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李穆