朱明库
- 作品数：20 被引量：154H指数：4
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- 番茄SlMYBL基因的克隆、生物信息学及表达特性分析被引量：1
- 2014年
- MYB转录因子构成了植物体内最大的转录因子家族之一,参与植物生长发育和代谢,是一种重要的转录因子。根据NCBI数据库登录的番茄序列,通过RT-PCR方法从野生型番茄AC++中克隆得到全长为1 630 bp基因片段,生物信息学分析表明,该基因ORF为1 245 bp,编码414个氨基酸,该编码蛋白有保守的DNA结合域:MYB-like、C-末端和多个磷酸化位点,主要定位于线粒体基质和细胞质中,根据其结构域该基因命名为SlMYBL。二级结构预测显示SlMYBL蛋白含有26.33%的α螺旋,65.46%的无规则卷曲和6.28%的延伸链及1.93%的β折叠。表达模式分析表明,SlMYBL在成熟叶、茎及萼片中表达量较高。荧光定量PCR分析表明SlMYBL基因表达量受外源激素IAA、ABA等的诱导。非生物胁迫结果表明,在高温、低温、伤害和盐处理中该基因表达也受到不同程度的诱导。该实验结果为进一步研究SlMYBL基因在番茄生长发育过程中的功能奠定了基础。
- 刘霞胡宗利张彦杰朱明库殷文成陈国平
- 关键词：番茄生物信息学激素处理非生物胁迫
- 番茄胁迫响应基因、其重组表达载体及其在培育耐盐番茄中的应用
- 一种番茄胁迫响应基因，其核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。含有上述番茄胁迫响应基因的全序列或部分片段的重组表达载体和微生物转化体。上述重组表达载体和微生物转化体在培育耐盐番茄品种中的应用。本发明的番茄胁迫响应基因通...
- 朱明库孟小庆董婷婷李格李宗芸
- 文献传递
- 番茄SlEBI基因及其RNAi表达载体和应用
- 本发明公开了番茄SlEBI基因及其RNAi表达载体和应用，番茄SlEBI基因的序列如SEQ ID No.3所示，将番茄SlEBI基因沉默后番茄表型呈多花及花柄、果柄无离区表型，因此可以通过沉默SlEBI基因获得多花且不易...
- 胡宗利董婷婷陈国平朱明库张建苓殷文成
- 文献传递
- 乌塌菜DET1基因的克隆及表达模式分析
- 2014年
- 高叶绿素是一种极为优良的农艺性状，有利于提高光合作用效率，增加产量。以芸薹属高叶绿素突变体乌塌菜为试验材料，研究调控叶绿素合成的基因DET1与乌塌菜高叶绿素含量的关系。测序结果显示，乌塌菜DET1基因全长cDNA为1690bp，编码535个氨基酸。与小白菜和羽衣甘蓝相比，乌塌菜DET1基因在第734。739位缺失了6个核苷酸“TGATGA”，导致乌塌菜DET1编码的蛋白质BrDET1w在第245位和第246位氨基酸处缺失了2个甲硫氨酸，其中，第245位的甲硫氨酸位于芸薹属DET1蛋白的保守位点。尽管生物信息学分析显示，乌塌菜BrDET1w的相对分子质量、等电点以及亲水性没有受到明显影响，半定量RT-PCR结果也显示，DET1基因的表达量在小白菜和乌塌菜中差别不大，但DET1基因保守位点的缺失仍可能是由于乌塌菜高叶绿素含量的原因。这一结果为乌塌菜DETI基因的后续研究奠定了基础。
- 张彬周爽朱明库尹美强赵娟王玉国
- 关键词：乌塌菜基因克隆
- 光对紫甘蓝花青素合成代谢影响及基因表达模式分析被引量：3
- 2012年
- 为了研究光对紫甘蓝花青素合成代谢影响及其调控机制,以"早红"紫甘蓝为试验材料,普通甘蓝"丰园913"(青甘蓝)为对照,对生长1周的幼苗进行遮光处理和光照处理,采用pH差示法测定花青素含量,半定量RT-PCR分析花青素合成途径结构基因表达模式。结果表明:光照处理与遮光处理后,除PAL、UFGT外,紫甘蓝结构基因表达无明显差异,无光条件下,紫甘蓝幼苗仍着色明显,而青甘蓝幼苗完全白化;与青甘蓝相比,紫甘蓝花青素合成途径下游结构基因表达量明显增高,幼苗着色深,揭示紫甘蓝花青素的大量积累与下游结构基因的表达密切相关。
- 李亚丽胡宗利张彬朱明库陈国平
- 关键词：紫甘蓝基因表达
- 番茄SlEBI基因及其RNAi表达载体和应用
- 本发明公开了番茄SlEBI基因及其RNAi表达载体和应用，番茄SlEBI基因的序列如SEQ ID No.3所示，将番茄SlEBI基因沉默后番茄表型呈多花及花柄、果柄无离区表型，因此可以通过沉默SlEBI基因获得多花且不易...
- 胡宗利董婷婷陈国平朱明库张建苓殷文成
- 文献传递
- 番茄DEAD-box RNA解旋酶基因SlDEAH1的克隆及表达分析被引量：3
- 2014年
- DEAD-box RNA解旋酶是一种特殊的RNA分子伴侣,参与了RNA代谢,包括前体RNA剪接、核糖体合成、RNA降解以及基因表达,并对植物的发育和抗性等也具有重要作用。根据已报道的拟南芥DEAD-box蛋白,通过同源比对,在NCBI据库中筛选得到一个DEAD-box RNA解旋酶同源蛋白,命名为SlDEAH1,并根据其基因序列设计特异引物,应用RT-PCR方法从野生型番茄(Solanum lycopersicum)AC++中克隆得到了该基因的全长编码区序列。利用生物学网站、软件及实时荧光定量PCR方法,对其进行生物信息学、表达模式、胁迫及激素处理分析。结果表明:SlDEAH1包括2 073 bp的开放阅读框,编码690个氨基酸残基,其编码蛋白有9个保守结构基序,其所涉及到的ATP结合、ATP水解及RNA结合等功能对于解旋酶活性是至关重要的;表达模式分析表明SlDEAH1基因可能在野生型番茄萼片、叶片发育及果实成熟方面起到重要作用;高温、低温、脱水、伤害、盐胁迫不同程度的诱导了SlDEAH1的表达,但在根中该基因的表达受盐胁迫抑制;ABA、ACC、IAA、GA3、MeJA和ZT均不同程度诱导了SlDEAH1的表达,其中ABA诱导效应最为明显。这些结果为进一步研究SlDEAH1在番茄发育和胁迫响应中的功能奠定了基础。
- 张建苓陈国平朱明库涂昀胡功铃胡宗利
- 关键词：番茄DEAD-BOXRNA解旋酶胁迫RT-PCR分析
- 甘薯盐胁迫诱导IbDEAD1基因的克隆、生物信息学及表达分析被引量：2
- 2017年
- DEAD-box解旋酶是植物中最大的解旋酶家族,不仅在几乎所有涉及DNA/RNA代谢的细胞过程中发挥关键作用,而且还广泛参与植物生长发育与胁迫响应过程.目前,甘薯中有关DEAD-box基因的功能研究尚未见报道.本研究以耐盐性品种徐薯22与盐敏感性品种徐薯32为研究材料,通过RNA-seq及生物信息学分析,首次从甘薯中筛选出一个受盐胁迫诱导的DEAD-box基因,命名为IbDEAD1.根据转录组分析的测序结果设计引物,从徐薯22中克隆出该基因的全长序列(GenBank登录号:MF043568).序列分析表明,IbDEAD1基因包含一个1 701bp的开放阅读框,编码566个氨基酸.序列分析显示IbDEAD1蛋白具有一个DEAD-box蛋白典型的解旋酶中心和多个磷酸化位点,且为DEAD-box RNA解旋酶.系统进化树及qRT-PCR分析均表明,IbDEAD1基因可能在甘薯盐胁迫响应过程中发挥重要作用.这些结果为进一步研究IbDEAD1基因在甘薯盐胁迫响应中的功能奠定了基础.
- 朱明库孟小庆蔡敬李格李宗芸
- 关键词：甘薯生物信息学
- 甘薯MADS-box转录因子IbMADS11-Like的克隆及胁迫响应分析被引量：2
- 2017年
- MADS-box蛋白在植物生长发育及抗逆等过程中均发挥重要功能。本实验室根据甘薯近缘野生种I.trifida基因组序列,在甘薯栽培种徐薯22(Ipomoea batatas(L.)Xu22)中克隆到一个STMADS11亚家族MADS-box基因,命名为IbMADS11-Like。实时定量RT-PCR分析表明,IbMADS11-Like基因在甘薯根中大量表达,并且随着块根的形成和膨大表达量逐渐降低,表明该基因可能参与了甘薯块根的发育过程。胁迫处理分析表明,IbMADS11-Like基因的表达受干旱、盐和高温的诱导,而低温则抑制其表达。此外,IbMADS11-Like基因对ABA、IAA、ZT、BR、ACC、JA及GA等激素的处理也有不同程度的响应,暗示IbMADS11-Like基因可能参与了甘薯生长发育及胁迫的调控过程。这些结果为进一步分析IbMADS11-Like基因在甘薯块根发育和胁迫响应中的功能奠定了基础。
- 谈传婷宋炜涵朱明库徐涛董婷婷李宗芸
- 关键词：转录因子克隆非生物胁迫甘薯
- 甘薯块根类胡萝卜素代谢调控因子及其植物表达载体的应用
- 本发明提出了一种甘薯块根类胡萝卜素代谢调控因子及其植物表达载体。甘薯块根类胡萝卜素代谢调控因子IbMBP3的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，将该基因序列构建到超表达载体后，通过农杆菌介导转化甘薯茎尖愈伤获得转基因...
- 董婷婷杨一宇张渝皎向金会朱嘉豪李典李宗芸朱明库张立明
