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独脚金转录组特征分析: 2023年; 【目的】获取独脚金[Striga asiatica(L.)O. Kuntze.]的转录组信息特征。【方法】提取独脚金叶片和茎的总RNA、建库、测序、组装,以注释和比对等生物信息分析技术得到独脚金转录组的遗传信息。【结果】共获得38 096 466个高质量Reads,通过de novo组装获得41 918条Unigenes,N50长度为1 754 bp,平均长度1 029 bp。共有27 375条Unigenes(占65.31%)在CDD、PFAM、KEGG、KOG、GO、NR、NT等数据库中得到注释。其中NR数据库注释到27 187条Unigenes,在KEGG中注释到5 331条Unigenes,涉及284条代谢通路。在独脚金中共鉴定到30条Unigenes涉及黄酮类生物合成,同时还鉴定到778个转录因子(TFs)。采用微卫星识别软件(MISA)对组装的1 000 bp以上的Unigenes分析发现,13 107条Unigenes包含17 036个简单重复序列(SSR)位点。【结论】利用转录组数据分析为独脚金的重要功能基因鉴定和次生代谢通路的挖掘奠定了研究基础。; 张龙蔡时可蔡时可梅瑜梅瑜; 关键词：转录组功能注释

一种简单、有效的适于PCR操作的放线菌DNA提取方法被引量：62: 2007年; 目的:利用改良酶法发展了一种从微量(几百微升)发酵液中快速安全的提取放线菌基因组DNA的方法。方法:利用溶菌酶破壁,蛋白酶K和SDS除蛋白,成功提取较高质量的放线菌基因组DNA,所得的DNA可作为PCR反应的模板进行16SrRNA等基因有效扩增。结果:能从海绵和土壤分离的放线菌中成功提取基因组DNA。结论:该方法操作简单、费用低廉、不使用酚、氯仿等有毒害作用有机试剂,非常适于长期从事放线菌操作的研究人员。为大量放线菌菌株的快速鉴别、高通量筛选和系统分类研究创造了条件。; 姜淑梅张龙戴世鲲李翔; 关键词：放线菌基因组DNA提取 PCR DNA

一种穿心莲转录因子ApMYB62及其克隆方法: 一种穿心莲转录因子ApMYB62，所述的穿心莲转录因子ApMYB62的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。一种穿心莲转录因子ApMYB62的克隆方法，包括如下步骤：(1)提取穿心莲的总RNA；(2)以步骤(1)提取的...; 王继华徐世强张龙李方平梅瑜顾艳邓权清李静宇

穿心莲TCP基因家族全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达分析被引量：2: 2024年; 穿心莲是我国岭南地区重要的药用植物,具有清热解毒、抗菌消炎等功效。TCP基因家族是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子。为解析TCP基因家族成员在穿心莲非生物胁迫下的作用,该研究基于全基因组水平鉴定穿心莲TCP基因家族,并进行了其响应非生物胁迫的表达模式分析。结果表明,穿心莲TCP基因家族共有23个成员,氨基酸长度为136~508 aa,相对分子质量为14854.71~55944.90 kDa,等电点为5.67~10.39,均定位于细胞核,不均匀分布于13条染色体上,系统进化分析将其划分为3个亚家族:PCF、CIN和CYC/TB1。基因结构和保守基序分析显示绝大多数TCP基因家族成员均含有相同排列顺序的motif 1、motif 2、motif 3和1~3个CDS。启动子顺式作用元件分析表明穿心莲TCP基因家族的转录表达可能受光、激素和逆境胁迫的诱导;结合TCP基因家族响应逆境胁迫的表达模式分析和qRT-PCR验证,预测到ApTCP4、ApTCP5、ApTCP6和ApTCP11可能参与响应干旱、高温和MeJA等多种非生物胁迫。该研究为深入挖掘穿心莲TCP基因响应非生物胁迫下的功能奠定基础。; 张龙徐世强李静宇胡学博顾艳王继华; 关键词：穿心莲基因家族非生物胁迫

花色素苷生物合成与分子调控研究进展被引量：68: 2008年; 花色素苷是决定植物花色的主要色素,其生物合成是目前研究得最为清楚的植物次生代谢途径之一。花色素苷的生物合成主要在3个关键酶F3H,F3′H和F3′5′H的作用下形成3个分支,最终分别生成橙色到砖红色的天竺葵素糖苷、红色的矢车菊素糖苷和蓝色到紫色的飞燕草素糖苷。F3′H、F3′5′H和DFR基因是利用遗传转化引入花卉植物原本缺乏的花色代谢途径的关键基因。花色素苷合成结构基因的转录调控是目前研究的热点,进行调控的转录因子主要包括两大类相互作用的bHLH和MYB转录因子;花色素苷合成的转录调控机理,包括bHLH和MYB两类因子之间的相互作用,以及它们对结构基因顺式元件的识别与结合,已经阐述得比较清楚。另外,对于一些处于bHLH和MYB上游的WD40类因子和光敏色素的研究,开启了对从信号传导到花色素苷合成的整个调控过程的探索。; 张龙李卫华姜淑梅朱根发王碧青李洪清; 关键词：花色素苷生物合成转录调控

穿心莲内酯生物合成与调控的研究进展: 2024年; 穿心莲内酯是中药材穿心莲的主要活性成分,具有清热解毒、抗菌消炎、保肝利胆等功效,临床上主要用于治疗小儿肺炎和上呼吸道感染等疾病。近年来,由于环境因素长期影响、品种纯度不高以及优良品种选育工作滞后等原因,很大程度上限制了穿心莲的品质提升。在穿心莲药材质量评价中,穿心莲内酯的含量是一项非常重要的指标,通过解析穿心莲内酯生物合成的分子机制及积累规律,有助于提升穿心莲药材质量。该文综述了穿心莲内酯的生物合成途径与分子调控机制,穿心莲内酯的生物合成主要分为两大阶段,即穿心莲内酯前体的合成阶段和穿心莲内酯合成的修饰阶段,其中前体合成研究已经较为清楚,但有关穿心莲内酯合成修饰阶段的途径和关键酶的挖掘还处于空白水平,需进一步研究。通过从环境因素和栽培措施两个层面对穿心莲内酯合成积累的关键影响因子进行挖掘,有利于建立完善的高品质穿心莲种植体系。此外,对调控穿心莲内酯生物合成的研究进展进行总结和展望,可为穿心莲药材品质提升提供参考。; 张龙张龙李静宇徐世强孙铭阳胡学博王继华; 关键词：穿心莲穿心莲内酯生物合成环境因素栽培措施

穿心莲分子生药学研究进展被引量：1: 2024年; 分子生药学是一门新兴的交叉学科,以分子生物学和中药学为基础,旨在研究药用植物的次生代谢产物合成和分子调控功能。穿心莲Andrographis paniculata是一种传统大宗中药材,具有保肝利胆、清热解毒和抗菌消炎等重要功效。穿心莲生产过程中受品种、产地环境、种植技术等原因造成的品质不稳定是穿心莲产业持续发展的重要限制因素,基于分子生药学的研究手段,采用现代组学技术进行穿心莲次生代谢产物调控研究已成为解决其品质问题的关键方法。该文总结了近年来穿心莲分子生药学领域的研究成果,包括资源的分子鉴定、遗传多样性、多组学技术、有效成分生物合成和种质创新等,并对该领域的发展趋势进行了展望。深入推动穿心莲分子生药学研究将为进一步开发其药用价值提供更加科学和有效的技术支持,为穿心莲新品种培育提供新思路,有效推动穿心莲产业的高质量可持续发展。; 张龙李静宇徐世强王继华; 关键词：穿心莲分子生药学种质创新

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张龙