张克云
- 作品数：43 被引量：166H指数：7
- 供职机构：南京农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学天文地球医药卫生更多>>
- 基于转录组学分析Xenorhabdus bovienii肽基脯氨酰异构酶ppia-l20基因的表达调控
- 2024年
- [目的]前期从广谱抗菌的Xenorhabdus bovienii NN6菌株的胞外蛋白中分离出一种新型杀菌蛋白PPIA-L20,为肽基脯氨酰异构酶A类似物,该蛋白能够抑制尖孢镰刀菌西瓜专化型的孢子的萌发,致使孢子死亡。经过多次试验验证ppia-l20基因的表达水平不稳定,与发酵时间没有明显的相关性。本文旨在探寻调控ppia-l20基因表达的调控因子,进而推测ppia-l20基因表达调控的分子机制,为进一步提高抗菌蛋白的产量提供参考。[方法]对ppia-l20的转录水平进行Real-time PCR分析并与菌株生长曲线进行相关性分析,选择ppia-l20基因表达量差异显著的2个发酵时间点进行转录组学比较,并对表达差异显著的DEG(differential expressed gene)进行GO功能注释、KEGG富集通路和蛋白网络互作分析。[结果]4~84 h发酵菌体中的ppia-l20基因表达趋势不稳定,其转录水平与时间不相关。与ppia-l20低表达量的8 h发酵菌体相比,ppia-l20高表达量的12 h发酵菌体中有466个DEG,包括193个上调基因和273个下调基因。Real-time PCR验证表明基因表达差异趋势与转录组测序结果一致,证明测序结果可信。对差异表达的基因进行GO功能注释、KEGG富集分析,发现DEG的功能与膜形成相关,富集通路与双组分调节系统、磷酸转移酶系统和阳离子抗菌肽抵制通路相关。其中,双组分调节系统中的qseC基因和opmR基因表达量均上调2倍,ppia-l20基因位于阳离子抗菌肽抵制通路,该通路上的nlpE基因(负责编码外膜脂蛋白)显著下调。蛋白互作网络中,PPIA-L20蛋白与位于外膜的AMP结合蛋白TycC、GrsB有互作关系,NlpE蛋白与双组分调节系统中cpxR基因、cpxA基因表达的蛋白有互作关系。[结论]Xenorhabdus bovienii NN6菌株可能通过双组分调节系统通路、阳离子抗菌肽抵制通路上的关键基因nlpE和磷酸转移酶系统共同调控ppia-l20的表达。
- 孙静包浩然张克云
- 关键词：昆虫病原线虫共生菌转录组
- 中国对虾中抗菌短肽的分离纯化与功能分析被引量：9
- 2006年
- 以水产病害的病原菌为目标菌,从中国对虾(Penaeus chinesis)体液中分离筛选抗菌肽,通过Sephadex G-50、RP-HPLC等分离纯化技术,得到一种抑制水产病原菌的抗菌肽PC-V-2。经初步鉴定,该抗菌肽具有广谱抗性,不仅抗鲁克氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri),而且对金黄色葡萄球菌(Staphyloccus aureus)、枯草杆菌(Bacillus subttilis)等革兰氏阳性菌,大肠杆菌(Escherichia coli)等革兰氏阴性菌和白色念珠菌(Candida albicans)等真菌也有较强的抗性。另外,该抗菌肽还有一定的抑制凝血的活性,但没有检测到溶血和丝氨酸蛋白酶抑制活性。经MALDI-TOF质谱分析,其分子量为1 848 D。
- 安贤惠梁建国李卫国徐春花吕毅王旭董靖张崇星张克云
- 关键词：中国对虾抗菌肽分离纯化
- 基因年代表及其在历史生物学中的意义
- 基因年代表(genetic timescale)是利用隐藏在生物基因分子中的演化信息、运用计算分子进化速率、建立分子钟的方法,为生物谱系发育图建立的时间标尺。基因年代表研究的主要任务是,计算生物系统发育树(phyloge...
- 杨群李春香郝家胜张克云孙晓燕
- 关键词：生物类群化石记录分歧时间分子钟
- 文献传递
- COI基因在鉴定中华虎凤蝶中的应用
- 本发明公开了COI基因在鉴定中华虎凤蝶中的应用，与传统DNA条形码分析方法相比，本发明提供了多种分析方法，通过该方法筛选出来的条形码准确性更高。本发明还公开了评价中华虎凤蝶COI基因作为基因条形码适用性的分析方法，通过该...
- 张克云肖振华窦振国包浩然蔡亚非张威高国富
- 文献传递
- 一种沙雷氏菌属昆虫病原线虫共生菌
- 一种沙雷氏菌属昆虫病原线虫共生菌，属于生物技术领域。该微生物是从昆虫病原线虫崇明拟异小杆线虫(Heterorhabditidoides chongmingensis)肠道内分离的共生菌菌株DZ0503SBSH1－2，20...
- 张克云张崇星赖仞吕毅刘敬瑞阚飞刘辉
- 文献传递
- 白星花金龟(Protaetia brevitarsis)幼虫抗菌物质的分离纯化被引量：3
- 2008年
- 以药用昆虫白星花金龟(Protaetia brevitarsis)幼虫为研究对象,通过Sephadex G-50、RP-HPLC等技术分离纯化天然抗菌活性物质.经初步鉴定,该系列抗菌活性物质对枯草芽孢杆菌(Bacillus subttilis)表现出较强的抑菌活性.用MALDI-TOFMS对样品进行分析,检测到相对分子质量分别为2254.0459、2622.4438的两种抗菌活性物质.推测这些抗菌活性物质在白星花金龟幼虫抵御微生物的侵袭中起到重要作用.
- 徐明旭高国富杨寿运孙捷张崇星徐春花吕毅张克云
- 关键词：白星花金龟分离纯化抗菌活性
- 速足目主要类群系统发育的分子证据被引量：2
- 2007年
- 文章基于速足目现生主要类群18S rDNA、28S rDNA和COI基因序列,采用贝叶斯法、邻接法和最大简约法,尝试构建速足目的分子系统树;结合形态特征和化石记录,主要对速足目各超科级分类阶元的系统发育关系进行探讨。结果表明,速足目现生超科Bairdiacea、Darwinulacea、Cypridacea和Cytheracea均为单系群,支持形态学上关于上述4个超科的的界定;3种基因均支持形态学上Darwinulacea和Cypridacea具有较近的亲缘关系的观点。18S rDNA序列分析在较显著水平上支持Darwinulacea和Bairdiacea为姐妹群,Darwinulacea可能从Bairdia-cea中的一支演化而来;Bairdiacea和Darwinulacea组成的分支是Cypridacea的姐妹群,支持将三者合并为Bairdio-copina亚目的观点;Cytheracea是Cypridacea(Darwinulacea+Bairdiacea)的姐妹群,可提升为Cytheracopina亚目。
- 张克云徐明旭杨寿运孙捷杨群
- 关键词：介形类速足目分子系统发育
- 松材线虫RAPD-PCR反应体系的优化与分子鉴定标记的筛选
- 应用随机引物 S344、S356和 S360比较分析了 PCR 热循环复性温度、Mg浓度和模板浓度对松材线虫基因组 DNA 的 RAPD 扩增结果的影响,旨在建立松材线虫的最佳反应体系,并以此进行松材线虫的分子鉴定标记筛...
- 张克云张崇星吕毅徐春花王旭林茂松
- 关键词：松材线虫
- 文献传递
- 一种卡巴尼氏致病杆菌NN7及其应用
- 本发明公开了一种卡巴尼氏致病杆菌NN7，其保藏编号为CCTCC NO：M 2021760，于2021年6月24日保藏于中国典型培养物保藏中心。本发明还公开了卡巴尼氏致病杆菌<I>（Xenorhabdus </I><I>c...
- 张克云王浩柳李旺李瑞窦振国包浩然林建任润生赵鸿阳阿德勒·迪尔曼
- 文献传递
- 抑制多种植物真菌病害的昆虫病原线虫共生菌菌株及应用
- 本发明公开了抑制多种植物真菌病害的昆虫病原线虫共生菌菌株及应用，该菌株为伯氏致病杆菌的高毒力菌株NN6，保藏编号：CCTCC NO:M 2020097，2020年4月29日保藏于中国典型培养物保藏中心。本发明伯氏致病杆菌...
- 张克云张潘杰包浩然柳李旺窦振国王浩肖振华肖宇辉柳王亮林建徐良熊阳杰高国富阿德勒·迪曼
- 文献传递
