刘湘军
- 作品数:13 被引量:27H指数:2
- 供职机构:清华大学医学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部跨世纪优秀人才培养计划教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生农业科学文化科学更多>>
- 人类抑癌基因beclin 1在胃癌和直结肠癌中表达下调的研究(英文)被引量:12
- 2008年
- 人类抑癌基因beclin 1通过自噬作用调节细胞生长,但在胃癌和直结肠癌中其表达水平和调控机制仍不清楚.通过检测胃癌和直结肠肿瘤组织中beclin 1基因的表达水平,及DNA异常甲基化和杂合子缺失对其表达的影响,发现与癌旁组织相比,35%的胃癌标本和30%的直结肠癌标本中beclin 1基因表达显著下调.同时发现,beclin 1基因5′端存在一高密度CpG岛,在胃癌和直结肠癌中beclin 1的启动子区域和第二个内含子区域存在甲基化,而杂合子缺失仅在胃癌中发生.这些发现表明beclin 1基因的异常甲基化和杂合子缺失对其在胃癌和直结肠癌中的表达起调控作用.
- 李子东陈波武一清金峰夏永静刘湘军
- 关键词:胃癌直结肠癌转录调控
- 一种文本数据挖掘与可视化的新方法被引量:2
- 2008年
- 传统搜索引擎的搜索结果采用的是以一维列表的形式展现,随着文献数据的急剧增多,用户对于搜索结果的辨识和分析速度也在急剧下降。为了弥补传统工具的这一不足,本文开发了"语义图"(semantic map,SMAP),此工具对文献数据进行数据挖掘和可视化,包括关联匹配和聚类,将搜索结果以二维矩阵图的形式展示出来,方便用户理解数据之间的内部联系,并帮助用户迅速从整体上把握搜索结果。最后以蛋白质组学文献分析过程为例具体展示了此工具的应用。
- 宋驰刘青焱张颜蒋博徐振愚夏永静刘湘军
- 关键词:可视化语义图
- 芋头胰蛋白酶抑制剂的分离纯化及性质研究
- 刘湘军
- 芋头胰蛋白酶抑制剂的分离纯化性质研究
- 刘湘军
- 关键词:胰蛋白酶
- 基因治疗被引量:2
- 2005年
- 基因治疗是一种主要用于修正疾病相关的缺陷基因的技术。截至2005年1月,全球共有1020个基因治疗临床试验。基因治疗由于尚存在药物生命周期短、给药途径、多基因病和免疫反应等方面的问题,目前还基本处于实验阶段,在临床试验还不是很成功。虽然如此,基因治疗具有经济、直接、高效的优点。在科学家未来的不断努力下,前景十分光明。
- 刘湘军
- 关键词:基因治疗生命周期给药途径免疫反应基因病科学家
- 大规模单核苷酸多态性位点验证的集群解决方案
- 2007年
- 随着高通量的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测技术的发展,世界各地的实验研究积累了大量的SNP数据,但是目前尚无一个全面综合的SNP数据库。SNP在致病基因发现、司法鉴定、个体化医疗等方面的应用得到了极大的关注和发展,因此有必要建立一个整合的人类SNP数据库。在整合中需要进行大规模的单核苷酸多态性位点的验证,该工作通过一个自主开发的、健壮的、用户友好的生物信息学集群计算工具包EasyC luster在集群系统上得以高效完成。
- 刘青焱庄海滨夏永静刘湘军
- 关键词:单核苷酸多态性集群计算OSCARPBS
- 人类全基因组范围的CpG岛的预测与分析被引量:2
- 2006年
- CpG岛的甲基化是表观遗传中基因表达调控的重要机制。虽然目前已存在几个从DNA序列判别CpG岛的标准,但如何在标准中选择合适的参数仍是研究的焦点。文章通过分析比较两种经典CpG岛判定标准与三种预测方法,提出了改进的CpG岛预测方法——CpGISeeker。应用该预测方法,结合判定标准中的三个基本参数组合出的13组组合参数,在人类全基因组范围内进行了CpG岛预测,并统计分析了CpG岛的重复序列组成以及相对于基因转录起始位点的位置分布情况。分析结果表明CpGISeeker具有更精确判定CpG岛的特性;同时还提示,随着判定标准严格性的增加,CpG岛的重复序列含量降低,与基因转录起始位点的相关性提高。将CpG岛最小尺寸为500bp、GC含量为60%、CpG出现率达到0.65的组合参数作为标准,是目前预测CpG岛的最佳方式。
- 庄海滨朱景德刘湘军
- 关键词:CPG岛甲基化表观遗传学
- 药物基因组学的研究现状
- 单核苷酸多态性(SNP)是人类遗传差异的主要表现形式,SNP研究是药物基因组学研究的关键环节.本文介绍了SNP的定义、SNP作为标记发现致病基因的方法、国际上大规模SNP研究的主要机构和进展.
- 刘湘军
- 关键词:药物基因组学单核苷酸多态性致病基因
- 文献传递
- SARS冠状病毒的一种膜蛋白及其编码基因与应用
- 本发明公开了一种SARS冠状病毒膜蛋白及其编码基因与应用,目的是提供一种SARS冠状病毒膜蛋白SCM及其编码基因scm。本发明所提供的SARS冠状病毒膜蛋白SCM是序列表中SEQ ID №:1的氨基酸残基序列或将SEQ ...
- 刘湘军魏国柱乔立安
- 文献传递
- 生物信息学的研究现状
- <正> 随着人类基因组序列测定工作的基本完成和基因组学研究的蓬勃发展,以及转录体组学研究、蛋白质组学研究和大规模高通量药物开发的次第展开,各种各样复杂的生物信息大量涌现,并直接促进了一门崭新的学科——生物信息学——的诞生...
- 刘湘军
- 文献传递