刘亚男
- 作品数：7 被引量：22H指数：2
- 供职机构：福建师范大学化学与化工学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金福建省教育厅资助项目更多>>
- 相关领域：理学文化科学生物学更多>>
- β-叠氮基丙氨酸二肽振动光谱研究
- 开展分子动力学模拟,探索了β-叠氮基丙氨酸二肽(β-azidoalanine dipeptide,AAD)在重水中的全原子运动轨迹.将溶剂所产生的静电作用与叠氮基在气/液相中振动频率的频移值相关联,拟合并建立叠氮基振动频...
- 刘亚男郑轩蔡开聪
- 关键词：振动光谱分子动力学模拟
- 氮甲基乙酰胺中酰胺-Ⅰ带振动频率的静电转换图
- 开展分子动力学模拟,在飞秒到纳秒的尺度上获取了蛋白质模型分子一氮甲基乙酰胺(NMA)在不同极性溶剂环境下(重水,二甲基亚砜)的全原子运动轨迹.将溶剂所产生的静电作用投影至分子骨架酰胺单元中,拟合溶剂作用产生的频率红移,建...
- 蔡开聪杜芬芬刘亚男刘佳
- 关键词：蛋白质振动频率
- 文献传递
- Gaussian软件在红外光谱学教学中的应用被引量：17
- 2014年
- 探讨了Gaussian软件在红外光谱学教学中的具体应用,帮助学生在课堂上对分子的三维空间结构、振动光谱的理解、振动模式的指认与归属等方面有更加感性的认识,从而提高课堂趣味性,使得教学内容更为形象生动.
- 蔡开聪杜芬芬刘佳刘亚男林汇秋申延凤林深
- 关键词：红外光谱分子结构振动形式
- β-叠氮基丙氨酸二肽振动光谱研究
- 2016年
- 开展分子动力学模拟,探索了β-叠氮基丙氨酸二肽(β-azidoalanine dipeptide,AAD)在重水中的全原子运动轨迹。将溶剂所产生的静电作用与叠氮基在气/液相中振动频率的频移值相关联,拟合并建立叠氮基振动频率图,实现了溶液相中叠氮基振动频率的快速预测,从而借助叠氮基探针振动光谱实现对多肽分子动态结构的实时监测。
- 刘亚男郑轩蔡开聪
- 关键词：振动光谱分子动力学模拟
- 甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ带光谱与结构相关性被引量：1
- 2016年
- 系统探索了蛋白质二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在气相与水溶液中的结构与光谱特性。从分子动力学轨迹中提取具有代表性结构的GLYD-D_2O聚集体的瞬态结构开展简正模式分析,获取了对蛋白质二级结构敏感的酰胺-Ⅰ带的振动光谱参数,建立起振动光谱与特征基团结构间的相关性。将溶剂作用以静电势场的形式投影至二肽分子骨架中,与酰胺-Ⅰ带在气/液相中的频率差相关联,并引入酰胺-Ⅰ带简正模式随二级结构变化的规律,将各个构象态可能存在的振动耦合包含在内,构建具有二级结构敏感性的静电频率转换图,实现溶液相中多肽骨架酰胺-Ⅰ带的快速准确预测。
- 蔡开聪郑轩刘亚男留珊红杜芬芬
- 关键词：振动光谱
- 叠氮振动吸收带对多肽二级结构的敏感性研究
- 利用从头算方法系统研究了叠氮基振动吸收带对β-叠氮丙氨酸二肽二级结构的敏感性.研究结果表明,处于不同构象的β-叠氮丙氨酸二肽分子,其叠氮基振动吸收带的振动频率有着明显的差异.在天然氨基酸侧链引入叠氮基,将其作为结构探针能...
- 蔡开聪刘亚男
- 关键词：敏感性
- 文献传递
- 肉眼看微观世界:VMD软件在蛋白质结构教学中的应用被引量：6
- 2016年
- 主要探讨了VMD软件作为一个高效的可视化工具在蛋白质三维结构教学中的应用。它帮助学生用一种更加直观、立体且富于互动的方式认识蛋白质分子不同的折叠方式及其二级结构特性。借助VMD软件还能对处于不停热运动中的分子瞬态结构进行统计分析,有助于学生深化对蛋白质倾向于形成的二级结构的认识。
- 郑荣珍严思仪刘亚男杜芬芬蔡开聪
- 关键词：蛋白质可视化
