任军方
- 作品数：6 被引量：116H指数：5
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室更多>>
- 发文基金：热带作物种质资源保护项目国家科技支撑计划国家科技基础条件平台建设计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- SSR等位变异数对普通野生稻居群遗传结构分析的影响被引量：9
- 2005年
- 运用矩阵相关检测及聚类分析比较相结合的方法,在对广西玉林普通野生稻居群进行遗传结构分析中,从260至60每降低20个等位变异进行梯度取样,研究了不同SSR等位变异相似系数矩阵与总等位变异相似系数矩阵之间的相关关系。结果表明:1)当等位变异数为200时,居群内个体间的遗传关系与总变异数为277时个体间遗传关系的相关系数高达99.5%,达到极显著标准;如果将等位变异数梯度降低到10,则所有4个群体分别在等位变异数为180、190、210和200时与总变异数为277时个体间遗传关系的相关系数达到99.5%。2)当等位变异数减少到60时,其相关系数也达到95.0%的显著相关。3)所有4个群体在其相似系数达到99.5%时的聚类图与总变异数为277时的聚类图基本一致,只有个别样品在聚类图中的位置略有变化,但其相似系数为95.0%时聚类图与总变异数为277时的聚类图差异非常明显。因此,在进行普通野生稻居群遗传结构分析时,选择均匀分布于基因组的SSR引物并得到200个左右的等位变异时就能精确地获得居群内个体间的遗传关系。由于水稻SSR引物在野生稻居群遗传结构分析中的平均等位基因数约为4,所以,50对引物即能反映居群内个体间的遗传关系。
- 杨庆文陈成斌张万霞时津霞任军方
- 关键词：普通野生稻居群微卫星等位变异
- 粳稻谷粒性状与垩白性状的相关分析被引量：5
- 2008年
- 利用大粒粳稻DL115与小粒粳稻XL005杂交后代F3和F4家系为试验材料,分析了粳稻谷粒性状和垩白性状的表型变异及其相关关系。研究结果表明,F3和F4家系谷粒的长、宽、厚、长宽比、千粒重及垩白性状均呈接近正态的连续分布,表现为由多基因控制的数量性状。F4家系谷粒性状值均小于F3,随着世代的增加,谷粒性状值趋于减小。F4家系垩白粒率和垩白度小于F3,而垩白大小基本相近。在F3和F4,谷粒千粒重与谷粒长、宽、厚、长宽比均呈极显著正相关;垩白性状与谷粒长、宽、厚、长宽比、千粒重呈极显著正相关。在不同大小的谷粒长、长宽比和千粒重范围内,谷粒性状值相对较大的群体垩白性状值明显大于谷粒性状值相对较小的群体;谷粒长和长宽比相对较小的群体内垩白性状与其谷粒性状的相关关系较谷粒长和长宽比相对较大的群体更为密切。
- 黎毛毛徐磊曹桂兰任军方贺浩华韩龙植
- 关键词：粳稻谷粒性状垩白性状
- 广东高州普通野生稻(Oryza rufipogon Griff)的遗传多样性和居群遗传分化研究被引量：36
- 2004年
- 利用 30对SSR引物对广东高州普通野生稻 3个群体进行了遗传多样性分析和居群遗传分化研究。结果表明 ,30对引物中只有 2 0对表现出多态 ,多态位点比率P为 6 6 7% ;在 2 0个多态位点中共检测出 81个等位变异 ,平均等位变异数(Ap)为 4 0 5个 ;3个群体总的遗传多样性 (Ht)为 0 6 1,其中 ,居群内的遗传多样性为居群间的遗传多样性的 3倍多 ,说明总的遗传多样性主要来自居群内 ;虽然居群间的遗传分化系数 (GST)较低 ,仅为 0 2 4 2 7,但当遗传相似系数临界值增加时 ,3个群体在聚类图上相对独立 ,说明 3个群体既存在着高度的遗传相似性 ,又具有一定程度的遗传分化 ,可以作为 3个居群进行原生境保护。
- 杨庆文张万霞时津霞任军方苗晗
- 关键词：居群普通野生稻等位变异多态位点遗传相似系数
- 云南元江普通野生稻(Oryza rufipogon Griff)遗传多样性分析及保护策略研究被引量：48
- 2004年
- 用SSR方法对云南元江普通野生稻 3个自然居群进行 30个位点的遗传多样性分析。结果表明 ,元江普通野生稻具有较高的遗传变异水平 (Ap =2 6 ,Hs=0 77) ,且群体遗传分化系数较大 ,GST为 4 1 0 8% ,即在遗传变异总量中 4 1 0 8%存在于居群间。本文还通过对云南元江普通野生稻遗传多样性特点的分析 。
- 杨庆文戴陆园时津霞张万霞任军方苗晗
- 关键词：自然居群SSR普通野生稻资源保护
- 东乡普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)原位保存群体的遗传分化和保护策略研究被引量：12
- 2007年
- 【目的】东乡野生稻是世界上分布最北的普通野生稻居群,研究其遗传分化不仅能够阐明居群的起源、演化规律,而且可为其保护提供理论依据。【方法】利用SSR(简单序列重复)分子标记对江西东乡普通野生稻仅存的2个原位保护居群进行了30个位点的遗传多样性分析和遗传分化研究。【结果】东乡野生稻2个居群内和居群间的遗传多样性指数分别为0.4120和0.0564,居群间遗传分化系数仅为0.1219,即87%以上的遗传变异存在于居群内。POPGENE聚类分析结果也显示,东乡野生稻的2个居群实际属于一个大群体,水桃树居群可看作庵家山居群的一个分支。利用同样方法对庵家山居群人为隔离的3个小群体进行的研究结果表明,虽然3个小群体间遗传分化系数也很低(0.0975),仍然属于同一居群,但人工隔离引起的小生境变化已使得3个群体发生了遗传分化。【结论】在建立东乡野生稻原生境保护点时,一方面,应以有效保护庵家山居群为重点,另一方面,对庵家山居群的保护应充分考虑原居群的生态环境,拆除原有围墙,进行生态恢复。
- 杨庆文余丽琴张万霞时津霞任军方苗晗
- 关键词：普通野生稻SSR原生境保护
- 原、异位保存普通野生稻种质资源的遗传多样性比较研究被引量：31
- 2005年
- 为了明确我国异位保存的普通野生稻是否能够代表原居群遗传多样性的完整性,利用SSR(简单序列重复)方法对江西省东乡县庵家山和水桃树2个普通野生稻居群的原、异位群体进行了遗传多样性比较研究。结果表明,庵家山居群原、异位保存群体的遗传多样性指数分别为0.5000和0.3555,异位保存群体的遗传多样性只有原位保存群体的71.1%,并且异位保存材料在聚类图中聚集在一起,仅为原位保护材料聚类图中的一个分支;虽然水桃树居群原、异位群体的遗传多样性指数分别为0.4100和0.4577,相差较小,并且原、异位保存材料在聚类图中混合聚类,似乎异位保存群体能够代表原居群的遗传多样性,但异位保存的14份材料在聚类图中有6份相邻的材料聚集在一起,说明异位保存取样时没有考虑野生稻植株的空间分布,属于重复取样,重复取样的比率高达42.9%。将2个分布点原、异位材料合并进行遗传多样性研究,结果与庵家山分布点的研究结果基本一致。据此推测我国保存的普通野生稻资源所包含的遗传变异相对较少,重复频率较高。建议进行普通野生稻遗传资源的再收集,并对已保存的野生稻种质资源进行全面鉴定,剔出重复样品。
- 杨庆文余丽琴张万霞陈大洲时津霞任军方苗晗
- 关键词：普通野生稻种质资源简单序列重复野生稻资源居群类图
