黄晓韵
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
- 供职机构：北京大学临床肿瘤学院更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 基于SAS的多元统计方法实现芯片数据挖掘被引量：5
- 2010年
- 利用SAS软件对GEO的一个肺癌芯片实验进行挖掘。采用非参数检验,判别分析和回归分析对该芯片实验中14个核受体的表达信息进行分析。结果表明,在0.05显著性水平下,ER1、VDR、RARα和RORα四个基因在腺癌和鳞癌表达具有统计学差异;RARβ在复发组和非复发组表达有差异。判别分析结果显示VDR和RORα表达量可以对病理类型进行预测,但是总误判率很高(0.2389);RARβ和PPARα对判别是否复发的总误判率更高(0.3457)。建立回归方程预测病理类型,入选模型的变量也是VDR和RORα,两者OR分别为0.126和4.452。可见,基于SAS的多元统计方法是芯片数据挖掘的一种潜在方法,一旦芯片实验标准化,利用SAS对不同芯片实验数据整合分析的结论将有益于推动假说形成。
- 黄晓韵曹波杨跃
- 关键词：数据挖掘芯片SAS
- Thy-1基因转染对肺腺癌细胞A549迁移性影响的实验研究
- 研究目的:验证Thy-1基因与肺癌细胞迁移潜能的关系,并探讨其作用机制。研究方法:利用真核表达质粒载体pcDNA3.0构建包含thy-1基因全长序列的重组表达质粒载体,转染A549细胞,G418筛选获得稳定克隆,采用RT...
- 黄晓韵孙璐陈晋峰王嘉赵威杨跃
- 关键词：THY-1A549细胞细胞迁移
- 文献传递
