陈要臻
- 作品数：4 被引量：41H指数：4
- 供职机构：四川大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金四川省“十一五”农作物及畜禽育种攻关项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 川芎简单序列重复间区多态性和扩增片段长度多态性分子标记技术多态性比较研究被引量：8
- 2009年
- 目的寻找川芎的高效分子标记。方法以四川崇州、都江堰、新都3个产地的川芎为材料,应用100条简单序列重复间区多态性(ISSR)引物、64对扩增片段长度多态性(AFLP)引物对30个川芎个体进行多态性筛选。结果筛选到简单序列重复间区多态性特异性引物共10条,扩增片段长度多态性特异性引物共6对;分别扩增出106和256条条带,多态条带百分率分别为22.64%和22.27%。平均标记指数AFLP的检测效率(1.78)明显高于ISSR(0.42)。两种标记基于遗传相似值聚类分析结果存在着一定的差异,但用Mantel测试对两种方法检测的遗传一致度进行相关性分析表明,它们之间存在着显著的相关性(r=0.6975,p=0.014)。结论川芎具有较低的遗传多样性,AFLP更有效于ISSR。
- 陈要臻王岚马逾英张正银樊哲仁唐琳
- 关键词：川芎扩增片段长度多态性
- 白芷ISSR-PCR反应体系的建立和优化被引量：11
- 2008年
- 目的：建立白芷的ISSR最佳反应体系及PCR扩增参数，为今后利用ISSR标记技术进行白芷鉴定及种质遗传多样性分析提供一个标准化程序。方法：以白芷基因组DNA为模板，分析了ISSR反应体系中模板DNA、Mg^2＋、dNTPs、引物浓度，TaqDNA聚合酶用量及退火温度对ISSR-PCR扩增的影响。结果：建立了重复性好，分辨率高的ISSR反应体系，即在25μL反应体系中，模板DNA浓度为10～30ng，2．5μL 10×PCR buffer（Mg^2＋ free），MgCl2 2．0mmol／L，dMTPs0．2mmol／L，Taq酶1．0U，引物0．6μmol／L；扩增程序为：94℃预变性5min；94℃变性30s，引物在筛选后的最佳退火温度退火45s，72℃延伸2min，共计39个循环，循环结束后在72℃延伸5min。结论：建立了适用于白芷的ISSR反应体系，为今后利用ISSR标记技术开展白芷遗传变异分析和构建遗传图谱奠定了基础。
- 郭丁丁马逾英唐琳陈要臻
- 关键词：白芷ISSR反应体系
- 白芷种质资源遗传多样性的ISSR研究被引量：21
- 2009年
- 目的应用ISSR分子标记技术分析中药白芷的遗传多样性。方法对4大类商品白芷及白芷近缘野生种兴安白芷共20个居群的白芷种质进行ISSR分析,利用NTSYS2.1e软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果9条引物共得到97条扩增条带,其中多态性条带37条,占38%;20个居群的样品聚为两大类。结论不同产地栽培白芷的遗传多样性水平较低,种质间的亲缘关系较近;而兴安白芷与4大类商品白芷存在遗传差异。
- 郭丁丁马逾英唐琳陈要臻吕强
- 关键词：白芷ISSR种质资源
- 白芷扩增片段长度多态性反应体系的建立及优化被引量：8
- 2008年
- 目的建立白芷扩增片段长度多态性(AFLP)反应体系及筛选出扩增条带丰富的引物。方法以12份白芷为试材,对AFLP分析过程中包括提取DNA的方法、DNA的提取质量和浓度、M seⅠ/EcoRⅠ酶切反应时间等进行了研究,从64对引物中筛选适合白芷的引物。结果改良的CTAB方法提取的DNA质量比较好,建立了一种适于白芷AFLP银染技术的优化体系:模板DNA的用量为400 ng,酶切体系中M seⅠ和EcoRⅠ反应时间为4 h,筛选出了7对适合白芷的引物。以引物E+AGC/M+CAA构建的白芷种质资源的AFLP指纹图谱,扩增带多,多态性强。结论建立了适用于白芷的AFLP反应体系,并筛选出了适合白芷的引物,为今后利用AFLP标记技术进行白芷鉴定及种质遗传多样性分析提供了标准化程序。
- 陈要臻郭丁丁马逾英陈雯王晓东唐琳
- 关键词：白芷
