董坤哲
- 作品数:18 被引量:48H指数:4
- 供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家绒毛用羊产业技术体系建设专项国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生理学更多>>
- 群体基因组学研究揭示EVI2A基因突变是绵羊肥尾性状的关键位点
- 蒋琳董坤哲杨敏宋伸马月辉
- 利用RNA-Seq技术筛选不同海拔地区山羊转录组SNP被引量:2
- 2012年
- 动物和人类的高海拔环境适应性机制和作用途径一直是生物学、医学和疾病学等领域研究者热衷探讨的课题之一,而从转录组水平对于西藏绒山羊的高海拔环境适应性研究仍未开展。以处于不同海拔地区的西藏班戈绒山羊和辽宁绒山羊为研究对象,利用RNA-Seq(RNA sequencing)技术,对其转录组进行测序,共筛选出153654个班戈绒山羊品种内SNP位点,154815个辽宁绒山羊品种内SNP位点,以及5 391个两品种间SNP位点,为从转录组水平对西藏班戈绒山羊高海拔环境适应性研究提供基础数据。
- 姚娜张文广张兵赵倩君左清清董坤哲冯爱琴马月辉
- 关键词:RNA-SEQ山羊转录组SNP
- 基于基因互作网络视角挖掘藏猪高海拔环境适应性相关基因
- <正>环境适应性是一个极其复杂的生理过程,需要一系列的基因或通路的共同协调与参与。上位效应(Epistasis),即基因间的互作作用,在复杂性状中广泛存在,并以网络形式影响着性状的发生。因此,基于网络原理,挖掘具有重要拓...
- 董坤哲浦亚斌栾亦昭刘珂左晓宇饶绍奇马月辉
- 文献传递
- 德保矮马X染色体选择信号筛选
- (目的)德保矮马是世界上最矮的马种之一,身高只有伊犁马和蒙古马的68.6%和76.5%。目前,对小型马的矮小特性的研究报道较少,机理尚不清晰,而且大多数前期研究都集中在常染色体,性染色体相关研究很少。在矮马形成的过程中有...
- 刘雪雪阿地力江·卡德尔董坤哲王月月潘建飞蒲亚斌何晓红马月辉蒋琳
- 文献传递
- 辽宁绒山羊DLX3毛囊表达载体的构建及其转染成纤维细胞的研究
- 2014年
- 根据GenBank中已发表的DLX3基因(登录号:XM_005694267.1)序列设计引物,以辽宁绒山羊毛囊生长期皮肤组织cDNA为模板,采用RT-PCR方法,扩增出DLX3基因的CDS区,连接平末端载体并验证后与真核表达载体pIRES2-EGFP连接。真核表达载体经XhoⅠ和BamHⅠ双酶切鉴定后,通过脂质体法转染绒山羊耳源成纤维细胞,在荧光显微镜下观察细胞中增强型绿色荧光蛋白(EGFP)的表达,并通过RT-PCR和Western blotting技术检测目的基因转录、蛋白质表达情况。结果表明,成功克隆了绒山羊DLX3基因,并构建了真核表达载体pIRES2-EGFP-DLX3。重组质粒转染绒山羊成纤维细胞24h后在荧光显微镜下观察到绿色荧光,通过RT-PCR扩增909bp的转录产物,并利用Western blotting检测到32.87ku目的蛋白DLX3的表达。本试验结果为研究DLX3基因在绒山羊毛囊生长周期内的功能以及调控毛囊生长发育的机制奠定了基础。
- 舒国涛姚娜董坤哲康晔浦亚斌赵倩君何晓红马月辉
- 关键词:绒山羊成纤维细胞真核表达载体
- 与中国绵羊尾型性状相关的SNP分子标记及其应用
- 本发明涉及与中国绵羊尾型性状相关的SNP分子标记,该SNP标记位于绵羊第11号染色体第18295084碱基对。本发明还提供了用于检测该SNP标记的特异性引物和方法,所述特异性引物对的序列如SEQ ID NO.2‑3所示。...
- 蒋琳马月辉杨敏董坤哲
- 文献传递
- 猪原癌基因JunB的电子克隆及比较基因组学分析被引量:3
- 2012年
- 电子克隆了猪原癌基因JunB,并对其编码的蛋白基本理化性质、信号肽、疏水性、高级结构等进行了预测和分析。结果表明:猪JunB基因是一个cDNA全长为1 883 bp的单外显子基因,编码合成347个氨基酸的多肽;编码的蛋白分子量35 942.42 Da,属于亲水性蛋白,不含信号肽及跨膜结构,可剪切位点可能在第46个氨基酸残基处,可能是个非分泌性的蛋白,二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主;在成年关节囊、成年肾上腺、舌头、血液、小肠、肌肉等组织和细胞中表达。
- 冯爱芹何晓红叶绍辉姚娜董坤哲康晔马月辉
- 关键词:电子克隆比较基因组学
- 猪EPAS1基因的多态性研究
- EPAS1又叫缺氧诱导因子2α,是诱导低氧基因和修复细胞氧内环境稳定的一个核心调节因子,能够与HIF-β异源二聚化,形成有功能的HIF-2。在缺氧条件下与下游靶基因结合,促进靶基因的转录,使机体产生一系列缺氧适应反应,从...
- 董坤哲关伟军赵倩君傅宝玲马月辉
- 关键词:藏猪多态性
- 藏猪高海拔环境适应性分子机制探讨
- 藏猪是生活在我国青藏高原地区的古老地方猪种,对高海拔恶劣环境具有良好的适应能力。藏猪良好的环境适应性是长期人工及自然选择作用下形成的,其遗传学机理非常复杂,需要多个基因协调发挥作用。本研究采用猪的全基因组SNP芯片对生活...
- 董坤哲
- 关键词:藏猪全基因组扫描基因互作
- 猪EPAS1基因外显子12的序列变异分析
- 本研究以6个不同地方的中国地方猪种为材料,对猪EPAS1基因外显子12的序列变异情况进行了研究和分析。结果表明:H2, H6和H8三种单倍型相对频率较高,分别为34.4%, 19.4%和21.5%。
- 董坤哲康晔冯爱芹姚娜赵倩君马月辉
- 关键词:地方猪种