王卉
- 作品数：2 被引量：14H指数：2
- 供职机构：华中科技大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于多级优化的真核生物基因结构预测被引量：10
- 2004年
- 基因结构预测对于发现新基因、了解基因组结构规律具有重要作用,是各类基因组计划的重要内容.但对于真核生物,现有基因预测方法的效果仍不理想.为探讨多级优化的真核生物基因结构预测方法,在将复杂的多基因结构预测问题划分为基因级(单外显子基因、多外显子基因)、元件级(外显子、内含子等)和特征级(功能位点信号、密码子使用偏好等)等多个层次上的一系列较简单子问题的基础上,通过从简单到复杂进行逐级优化的策略,建立了基因结构预测的多级模型,设计了基因结构寻优的动态规划算法,开发了真核生物基因结构预测系统GeneKey(1.0).用广泛采用的数据集对该系统进行测试的结果表明,GeneKey(1.0)的预测精度在核苷酸、外显子和基因水平上均高于著名系统GENSCAN.Gene-Key(1.0)已提供网上服务(http://infosci.hust.edu.cn).
- 周艳红杨雷王卉陆枫万宏辉
- 关键词：真核生物DNA序列蛋白质编码区
- 基于特征挖掘与融合的剪接位点识别被引量：4
- 2006年
- 在基于保守序列这一信号特征识别剪接位点的基础上,挖掘了可用于剪接位点识别的其他多个特征(包括剪接位点上、下游序列的碱基组成,剪接位点信号和上、下游序列的碱基组成随位点邻近序列C+G含量的变化等统计特征),建立了描述这些特征的模型,设计了能有效融合这些特征对剪接位点进行识别的对数线性模型,开发了剪接位点识别程序SpliceKey.测试结果表明:SpliceKey识别剪接位点的精度不仅较WAM方法有显著的提高,而且也优于国际上最新发布的剪接位点识别软件DGSplice.SpliceKey已提供网络服务:http:∥infosci.hust.edu.cn/SpliceKey/.
- 周艳红王卉杨雷
- 关键词：剪接位点
