涂升斌 作品数:43 被引量:150 H指数:6 供职机构: 中国科学院成都生物研究所 更多>> 发文基金: 中国科学院西部之光基金 四川省产学研创新联盟合作项目 四川省国际科技合作与交流研究计划项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 经济管理 更多>>
一种可视化检测基因序列中单核苷酸多态性位点的反向探针、试剂盒及其检测方法 本发明公开了一种可视化检测基因序列中单核苷酸多态性位点的反向探针、试剂盒及其检测方法,反向探针包括H1序列、H2序列、P1序列和G‑四链体结构,H1序列为待检测序列SNP位点5’端的反向互补序列,H2序列为待检测序列SN... 涂升斌 莫邦辉 李辉 夏云 汪松虎 黄维藻 刘唤唤 左钦月作物抗旱机理及基因工程研究进展 被引量:9 2007年 综述了作物抗旱的生理学机制,从渗透调节、Lea蛋白,水通道和脱水素、氧化胁迫与耐受、基因的研究与开发及转录调节、ABA和生化处理6个方面介绍了作物抗旱基因工程的研究进展。以期为我国节水抗旱农业的研究提供一些新的思路和新的手段。 涂升斌 龙文波 栾丽 刘玉花 王兴 何涛关键词:作物抗旱 基因工程 节水农业 杂交水稻在海南的双季高产示范表现及栽培技术 被引量:1 2023年 2020年,袁隆平提出“杂交水稻双季产量22.5 t/hm^(2)”的目标,经过2021年的攻关,海南有3个示范点完成了目标,杂交稻双季产量分别为23.8、22.8和23.4 t/hm^(2)。早稻品种湘两优900表现为长势繁茂、整齐,有效穗和每穗总粒数多,抗稻曲病和稻飞虱能力强,抗倒、抗旱,耐热和耐肥性强;晚稻品种吉丰优1002表现为生长清秀、整齐,抗稻瘟病和白叶枯病能力强,耐涝性强。总结了杂交稻在海南的双季高产示范表现及栽培技术。 陈健晓 王效宁 涂升斌 林朝上 岑新杰 李建武 彭玉林 曹兵关键词:杂交水稻 栽培技术 同源四倍体水稻籼型突变体Wx基因序列分析及特异识别分子标记的建立 被引量:2 2008年 同源四倍体水稻突变株D4063-1直链淀粉含量比来源二倍体明恢63下降一半,即其直链淀粉含量为5.23%。为研究其直链淀粉含量下降的原因,根据普通水稻Wx基因设计引物,扩增测序获得了D4063-1Wx基因的全序列,并与已报道的Wx基因进行比对分析;同源四倍体水稻D4063-1Wx基因最显著变化为在外显子序列中发生碱基缺失,导致移码突变,在第9外显子终止密码子提前出现。D4063-1Wx基因碱基位点的变化还导致其序列上酶切位点的变化,对常用限制性内切酶位点分析结果表明,同源四倍体水稻相对于籼稻和粳稻多了2个sphⅠ酶切位点,相对于粳稻减少了6个AccⅠ,增加了4个XbaⅠ,1个XhoⅠ,1个PstⅠ和1个SalⅠ酶切位点。聚类分析表明D4063-1Wx基因序列与籼稻亲源关系较近,由此推测D4063-1Wx基因来源于籼稻的Wxa基因型。另外,根据D4063-1Wx基因的碱基差异,推测D4063-1Wx基因外显子碱基变化导致的RNA加工障碍是其直链淀粉降低的主要原因,并可能与其米饭较软等品质相关。本研究还根据D4063-1和籼稻、粳稻的序列差异及D4063-1在该片段上的特征序列位点设计了用于识别D4063-1的寡核苷酸片段,并作为PCR反应的引物命名为AUT4063-1,将该引物与作者设计的扩增普通籼稻、粳稻Wx基因的引物F5配合使用,建立了识别D4063-1的显性和共显性两种检测方式的分子标记,为快速、准确鉴别低直链淀粉含量突变体D4063-1创造了条件。 栾丽 陈英 王兴 龙文波 刘玉花 涂升斌 孔繁伦 李万明 肖小余关键词:直链淀粉含量 WX基因 特异引物 一种包含pOsOle18启动子的种子特异性干扰载体及其应用 本发明属于生物技术领域,具体涉及一种包含pOsOle18启动子的种子特异性干扰载体及其应用。具体提供了一种种子特异性干扰载体,所述载体为pOsOle18‑RNAi载体,其DNA序列如SEQ ID NO 9所示。利用所述p... 李辉 李鹏慧 涂升斌 黄维藻 汪松虎 蒋海波 刘阳轩 古袁扬 庄勇 刘志坚 魏明 唐钰莹 乐露 路龙祥 胡永志 喻兰同源四倍体与二倍体水稻Wx基因位点的遗传差异 被引量:7 2005年 测定了中国科学院成都生物所培育出的14种同源四倍体水稻及8种大面积推广的二倍体水稻的直链淀粉含量,并利用微卫星标记484/485,Wxup2/485及PCR-AccⅠ分子标记对同源四倍体及二倍体水稻进行扩增.发现直链淀粉含量发生变化的部分同源四倍体水稻Wx基因位点发生变异,表明微卫星标记与同源四倍体水稻直链淀粉含量之间存在相关性,并初步探讨了同源四倍体水稻Wx基因位点遗传变异的原因. 栾丽 涂升斌 孔繁伦 何涛关键词:直链淀粉含量 微卫星标记 WX基因 同源四倍体 同源四倍体水稻变异胚囊分类及结实性影响因素 被引量:4 2009年 以秋水仙素加倍的同源四倍体水稻三系株系具有高比率的变异胚囊.各种胚囊变异类型在抽穗前1-2d的主穗和第一分蘖穗中出现频繁,造成正常胚囊的比率大幅降低.按变异胚囊的结构特点和形成方式,变异胚囊分为4种类型:退化型、结构变异型、无融合生殖型和反足细胞增殖型.退化型胚囊包括小胚囊和完全退化胚囊,前者仍有较小的胚囊腔而后者胚囊腔缺失;结构变异包括八核七细胞结构的缺失、重复和位置异常,反映了蓼型胚囊典型结构不同形式的变异;无融合生殖胚囊发生比率极低,主要包括反足胚和卵细胞胚;反足细胞的增殖比较频繁,这导致四倍体胚囊的多样性进一步增加,也对结实性带来一定影响.相关分析表明,同源四倍体水稻结实主要来自3部分:正常胚囊、正常型小胚囊和反足细胞增殖型胚囊.这3种胚囊可能具有较好的育性,其对结实率的贡献程度分别为正常蓼型胚囊的72.44%,正常型小胚囊的15.12%,反足细胞增殖型胚囊的12.44%;完全退化型胚囊和位置异常型胚囊对结实率分别表现出显著和极显著的负相关,表明二者可能是结实性的抑制因素. 龙文波 王兴 陈英 涂升斌 栾丽 孔繁伦 何涛 刘怀年 肖小余关键词:同源四倍体水稻 结实性 用SSR标记检测杂交籼稻三系亲本的遗传差异 被引量:8 2009年 随机选用分布于水稻(Oryzasativa L.)12条染色体上的110对引物,共筛选出26对具有多态性的SSR引物,对24份杂交籼稻三系亲本材料进行遗传多样性和亲缘关系分析.全部24份亲本中共检测出116对等位基因,每个SSR引物可检测到的等位基因数目为2~7个不等,平均每对引物可以检测到4.4个等位基因.多态信息量(PIC)的变动范围为0.0689~0.8036,平均PIC值为0.6034;期望杂合度(He)的变动范围为0.0816~0.8298,平均值为0.6169;多样性指数(I)变幅为0.1732~1.7913,平均为1.1600.对供试亲本材料根据遗传距离进行UPGMA聚类分析,结果表明,SSR微卫星标记可以将24份亲本材料分为3个大群,各组亲本间的遗传差异较大.通过分子标记辅助育种,可以有效地鉴定供试亲本材料之间的亲缘关系,分析预测新种质材料的遗传差异,可作为选育强优势组合杂交水稻的重要参考指标之一. 陈英 邱琳 涂升斌 栾丽 王兴 龙文波关键词:SSR 聚类分析 高光效水稻鉴定筛选方法 被引量:2 2022年 高光效育种是提高水稻产量的重要手段.现有的高光效种质筛选体系多以光合作用指标作为重要依据,而室外田间光合作用测定操作难度大、稳定性较差,同时存在高光效材料不一定高产的问题.为探索出一种简便高效的高光效高产水稻种质资源筛选鉴定方法,从前期收集的300份籼稻资源中,筛选出18份高光效籼稻和6份低光效籼稻材料,并通过测定包括对照在内共计33份重点籼稻材料的苗期净光合速率,结合重要农艺性状以及田间产量数据进行高光效高产水稻种质的筛选鉴定.鉴定出6份高光效籼稻品种,PLOVDIV 24、E 2040、MAMORIAKA、TSAO SHENG LI 1、YONG JIN ZAO 3和KUTAI PAYA,其净光合速率在17-18μmol m^(-2) s^(-1)之间,单株产量在30 g左右,与明恢63、9311等品种相当.通过生物量与产量的相关分析发现,日均生物量与日均产量存在明显的正相关关系,相关系数为0.853;日均草重与日均生物量也存在正相关关系,相关系数为0.782.偏相关分析发现,日均草重与日均产量之间呈现负相关关系.上述结果表明可以将日均草重和日均生物量作为前期指标鉴定其光合能力,即前期看“早生快发”,后期通过经济产量数据鉴定其高产特性,从而探索出前期看“早发快生”、后期看“日均产量”的高光效、高产水稻种质筛选育种方法.(图4表1参50) 路龙祥 冀占东 刘志坚 庄勇 魏明 李辉 黄维藻 黄维藻 杜安平 汪德锋关键词:水稻 高光效育种 用SSR标记检测同源四倍体与二倍体水稻的遗传差异 被引量:25 2004年 随机选用分布于水稻 (OryzastativaL .) 12条染色体上的 15对SSR(simplesequencerepeats)引物 ,对 18种中科院成都生物所培育的四倍体水稻和 9种大面积种植的二倍体水稻进行了SSR多态性分析 .11对具多态性的引物共检测到 33条多态性条带 ,平均每对引物检测到 3个等位基因 .研究结果发现 ,所用同源四倍体水稻的基因组与二倍体水稻基因组大部分相同 ,只是在某些位点上具有差异 ,并筛选出部分SSR标记来区分二倍体与其同源四倍体 .本研究还对二倍体与同源四倍体之间遗传差异的原因进行了初步的探讨 .图 2表 2参 栾丽 孔繁伦 何涛 刘刚 涂升斌关键词:SSR 水稻 同源四倍体