梁建平
- 作品数：3 被引量：24H指数：3
- 供职机构：云南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：云南省应用基础研究基金云南省应用基础研究计划面上项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 福安水牛线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析被引量：11
- 2010年
- 采用PCR产物直接测序的方法对20头福安水牛的线粒体DNA(mtDNA)D-LOOP区全序列进行了测定,并对所得数据进行了比对和分析。结果共检测到16种单倍型,48个核苷酸多态位点,其中单一变异位点9个,简约信息位点39个。在所分析的序列中,T,C,A和G的平均含量分别为27.9%,25.6%,31.9%和14.6%,核苷酸多样度为0.019 46±0.002 88,单倍型多样度为0.957±0.032,序列间平均核苷酸差异数是17.238,结果显示福安水牛线粒体DNA遗传多样性丰富。系统发育和遗传距离分析显示:福安水牛与河流型水牛存在较大差异,其自身聚为支持率极高的两大支,即世系A和世系B,揭示福安水牛存在两个母系血统来源。
- 张瑞光梁建平陈云林斌陈诚苗永旺
- 关键词：福安水牛MTDNAD-LOOP遗传多态性遗传分化
- 黑色素皮质素受体1基因对水牛毛色遗传的影响被引量：10
- 2009年
- MC1R在很多动物的色素沉积过程中发挥关键作用.为了阐明MC1R基因是否与水牛毛色性状相关,本研究对216头遗传背景清楚的水牛进行了该基因编码区DNA序列测定.研究的样品包括49头黑色河流型水牛(包括摩拉水牛和尼里-拉菲水牛),136头毛色为灰色或白色的沼泽型水牛(包括德宏水牛、滇东南水牛、德昌水牛、贵州水牛和西林水牛)和31头尼里-拉菲水牛或摩拉水牛与沼泽型水牛的杂交后代.序列分析发现在水牛群体中存在3个单核苷酸突变位点(SNPs),其中SNP684是同义替换,而SNP310和SNP384为非同义替换,并分别导致p.G104S和p.M128I氨基酸的改变.只有基因型为河流型等位基因纯合子EBR/EBR的个体毛色表型为黑色.对黑色河流型水牛与灰色沼泽型水牛的杂交后代基因型和毛色表型的分析进一步揭示:河流型等位基因EBR或编码p.104S的等位基因对保证MC1R具有正常功能起重要作用.生物信息学功能分析显示,p.G104S和p.M128I两个氨基酸替换对MC1R的功能有显著影响,进一步支持EBR等位基因或编码p.104S的等位基因与水牛黑色性状相关.
- 苗永旺吴桂生王磊李大林汤守锟梁建平毛华明罗怀容张亚平
- 关键词：水牛毛色
- 利用mtDNA D-loop序列为遗传标记分析槟榔江水牛的群体遗传特征被引量：3
- 2011年
- 槟榔江水牛是近年在云南西部发现的中国第一个本土河流型水牛群体,具有较高种用价值,但其重要遗传背景信息还不清楚。本文采用PCR产物直接测序法对86头槟榔江水牛mtDNA D-Loop序列进行了突变检测,并以GenBank上已发表的70条河流型和112条沼泽型水牛mtDNA D-Loop序列为对照,对所得数据进行群体遗传和系统发育分析。结果在槟榔江水牛中检测到33种单倍型,112个多态位点。其中单一变异位点14个,简约信息位点98个。槟榔江水牛mtDNA D-Loop序列T,C,A,G的平均含量分别为28.43%,24.82%,31.96%,14.79%,单倍型多样度为(0.948±0.012),核苷酸多样度为(0.038 1±0.001 6),序列间平均核苷酸差异数为33.288,群体内平均遗传距离为(0.043±0.005)。系统发育、中介网络图和群体遗传关系分析表明,槟榔江水牛含有两个差异显著的母系世系组分,其中一个为河流型世系,在群体中占61.63%;另一个为沼泽型世系,在群体中占38.37%,而其沼泽型世系可进一步分为A,B,C 3个支系,其中,C为在水牛中新发现的支系,其频率极低。结果揭示了槟榔江水牛群体遗传多样性丰富,但该群体存在一定的沼泽型水牛基因渗入。
- 苗永旺李大林袁峰梁建平李卫真刘伟李卓然章纯熙
- 关键词：槟榔江水牛MTDNAD-LOOP遗传分化基因渗入
