李凤霞 作品数:35 被引量:140 H指数:7 供职机构: 中国农业科学院烟草研究所 更多>> 发文基金: 国家烟草专卖局基金 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 中国烟草总公司科技项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 轻工技术与工程 更多>>
烟草基因组学研究方法篇:3.烟草功能基因组学中的功能缺失与功能获得策略 2011年 功能基因组学研究中,常常通过改变基因的表达水平,然后观察其生物学性状、环境适应性以及生理或代谢途径等方面的变化来研究基因相应的生物学功能。这种研究策略包括强制性地沉默或升高特定基因的表达水平,即功能缺失(loss of function)和功能获得(gain of function)策略。 李凤霞关键词:功能基因组学 烟草 生物学性状 生物学功能 代谢途径 强制性 烟草重要基因篇:9.烟草雄性不育和育性恢复基因 被引量:3 2015年 植物雄性不育(male sterility,MS)既是植物生殖生物学研究中的一个重要植物学性状,也是研究作物杂种优势利用的一个重要农艺性状,在作物育种和分子生物学研究中具有重要地位。植物雄性不育可分为细胞核雄性不育(genic male sterility,GMS)和细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)。GMS由核不育基因控制,无正反交遗传效应;CMS由线粒体不育基因和核恢复基因(restorer of fertility,Rf)共同调控,线粒体基因导致不育,Rf能改变线粒体中不育基因的表达,使不育系恢复育性。 李凤霞关键词:STERILITY 植物生殖生物学 育性恢复基因 CYTOPLASMIC 核不育 烟草细胞质雄性不育系tab1-CMS特异性分子标记及其应用 本发明属于植物基因工程领域,涉及烟草细胞质雄性不育系tab1‑CMS特异性分子标记及其应用。本发明筛选得到了烟草tab1‑CMS品种的特异性分子标记,利用其可快速、准确地鉴定烟草tab1‑CMS品种,本发明对丰富烟草不育... 李凤霞 刘艳芳 刘志文 杨爱国 孙玉合文献传递 基于EST序列的烟草cSNP发掘 被引量:2 2012年 SNP标记是一类应用广泛的第三代分子标记。从GenBank下载普通烟草EST序列共计317 175条,用CAP3软件对序列进行拼接。设定SNP位点的冗余度大于2,采用AutoSNP软件检测cSNP。结合位点所在序列的文库和品种信息以及多个SNP位点的共分离分值来评价其可信度。结果表明,317 175条普通烟草EST拼接成重叠群中15 429个重叠群至少包含4个读长,鉴定出53 477个冗余度大于2的候选SNP,烟草中出现SNP的频率为0.34%。其中SNP的转换率大于颠换,插入/删除表现出A/T偏好。这些高质量SNP标记的发掘为开展烟草基因功能研究和分子育种奠定了良好的基础。 龚达平 王鲁 李凤霞 王卫锋 刘贯山 孙玉合关键词:单核苷酸多态性 单体型 烟草 烟草细胞质雄性不育线粒体基因sdh3和sdh4的生物信息学分析 被引量:8 2013年 线粒体基因异常可能导致烟草细胞质雄性不育。sdh3、sdh4是编码线粒体电子传递链复合体II亚基的重要基因,为探讨线粒体基因sdh3、sdh4与细胞质雄性不育的关系,从3个普通烟草不育系品种及其保持系中提取线粒体DNA,根据GenBank报道的烟草线粒体DNA序列设计特异引物扩增目的基因并克隆测序,应用生物信息学方法,分析烟草雄性不育系及保持系的sdh3、sdh4基因在其核苷酸、编码蛋白各结构层次上存在的差异。结果显示,不育系的sdh4基因第28位碱基发生了改变;不育系的sdh3基因发生10个碱基的缺失,以致其编码蛋白改变,这极可能成为干扰线粒体琥珀酸脱氢酶亚基3功能的关键因素,从而成为可能导致烟草CMS的根本原因之一。 张长静 李凤霞 贾兴华 李尊强 冯全福关键词:烟草 细胞质雄性不育 线粒体 鉴定烟草sua-CMS胞质雄性不育系的分子标记 本发明公开了一种鉴定烟草sua‑CMS胞质雄性不育系的分子标记,选自orf82、orf103、orf115<Sup>a</Sup>、orf100、orf115<Sup>b</Sup>、orf191,其核苷酸序列分别如SE... 李凤霞 杨爱国 郑业强 刘志文 孙玉合文献传递 辣椒属GRF基因家族全基因组鉴定和表达分析 被引量:10 2020年 生长调节因子(Growth-regulating factor,GRF)是一类植物特异的转录因子,其作用涉及植物的生长发育、胁迫和激素信号响应等各个方面。目前还没有关于辣椒GRF的相关报道。利用BLASTP和隐马科夫模型(HMM)在辣椒属(Capsicum)5个参考基因组数据库鉴定了52个GRF家族成员。通过分析发现辣椒GRF转录因子长度为200~745 aa,分子量23~81 kD,理论等电点5.9~9.5。保守结构域和基序分析发现,大多数辣椒GRFN端具有QLQ和WRC保守结构域,C端至少具有FFD、TQL和GGPL结构域之一;少数GRFN端仅具有WRC结构域,C端缺乏保守序列。系统进化分析发现,辣椒GRF转录因子分为5个群,位于同一群的GRF保守结构域位置、基序组成、基因结构相似,辣椒GRF与番茄GRF具有一一对应的进化关系。转录组数据分析表明,CaGRF8在辣椒果实发育早中期表达量高,CaGRF4在果实发育后期表达量较高;低温、干旱、盐和赤霉素处理后辣椒幼苗CaGRF表达量发生明显变化,CaGRF8受到赤霉素诱导表达量升高,而CaGRF4的表达被赤霉素抑制。 赵慧霞 李凤霞 郭瑞 陈禅友关键词:辣椒 GA3 烟草SSR荧光标记与毛细管电泳检测技术研究 被引量:23 2011年 将毛细管电泳荧光检测技术应用于烟草SSR标记分析,以期借助自动化、智能化的仪器设备加速对烟草遗传分析的研究进程。采用毛细管电泳荧光检测技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对9份烟草材料进行SSR位点分析,用相同的材料和引物,对这两种方法的检测结果进行比较,建立并优化了毛细管电泳荧光检测法应用于烟草SSR标记分析的技术体系。结果表明,荧光检测法克服了银染法的不足,具有简便、可靠及高通量的优点。同时对微卫星荧光标记技术中低成本、高通量多重PCR体系建立的一些技术问题进行了探讨。 陈雅琼 李凤霞 李锡坤 徐军 张磊 王绍美 孙玉合关键词:烟草 微卫星 SSR 毛细管电泳 植物细胞质雄性不育恢复基因的定位和克隆研究进展 被引量:7 2014年 植物细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)是作物杂种优势利用的重要途径,是由线粒体不育基因和相应的核编码育性恢复基因(fertility restorer gene,Rf)互作产生。随着分子生物学和分子遗传学的发展,许多植物的大量Rf基因被定位和克隆,尤其是近年来一些植物CMS及其育性恢复的机制也得到了阐明。本文概述了几种主要农作物中已经定位或克隆的Rf基因及其作用机制的最新研究进展,并对未来该领域的研究方向进行了展望。 丁安明 李凤霞 陈夏晔 孙玉合关键词:细胞质雄性不育 育性恢复基因 基于SSR荧光标记分析我国主要审(认)定烤烟及白肋烟品种遗传多样性 被引量:5 2013年 将毛细管电泳荧光检测技术应用于烟草SSR标记研究,分析我国审(认)定通过的63份烤烟与8份白肋烟种质的遗传多样性。选取36对SSR引物,共扩增产生多态性带205条。运用NTSYS-pc2.10e软件计算Dice遗传相似系数,结果显示71份烟草种质的遗传相似系数介于0.223-0.924之间,平均为0.658。表明我国审(认)定通过的烟草栽培种间的遗传基础狭窄、遗传多样性不丰富。 陈雅琼 王卫峰 丁安明 宗鹏 李凤霞 张磊 孙玉合关键词:烟草 SSR荧光标记