张磊
- 作品数:7 被引量:23H指数:2
- 供职机构:中国科学院青岛生物能源与过程研究所更多>>
- 相关领域:理学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 离子液体的性能及应用被引量:14
- 2009年
- 离子液体不仅可用作环境友好的"绿色溶剂",而且在生物合成和有机反应中能表现出特殊的催化、促进效应。在介绍离子液体种类、性质、合成方法的基础上,重点综述离子液体功能化方法、离子液体/超临界CO2体系和其在生物催化反应中应用的最新研究进展。
- 张磊何玉财仝新利孟鑫杨建明徐鑫咸漠
- 关键词:生物催化功能化离子液体超临界CO2
- 毛木耳漆酶基因的克隆、序列分析及其鉴定被引量:7
- 2008年
- 本文利用PCR和RACE技术首次从毛木耳AP4菌株中获得编码漆酶基因的cDNA及其基因组全长序列,基因组大小为2514 bp。通过比较该漆酶基因的cDNA和基因组DNA的全长序列,发现该基因包含14个外显子和13个内含子。cDNA序列的全长为1972 bp,其包含一个完整的ORF,长度为1860 bp,编码619氨基酸,推测的分子量大小为68 kD,等电点pI为5.15。在氨基酸序列的氨基末端存在一个信号肽序列,同时该基因还包括含铜氧化酶的三个功能结构域KOG1263、SufI和pfam00394。氨基酸序列与GenBank中登录的真菌漆酶蛋白序列比对表明:该氨基酸序列与其它真菌漆酶蛋白序列有较高的同源性,氨基酸序列相同性最高达41%,相似性为58%,并且含有真菌漆酶的四个保守的Cu-bind结构域。将获得的漆酶基因lac1与毕赤酵母表达载体pPIC9K连接,构建重组质粒pYH3660,将其转化到毕赤酵母中,经甲醇诱导该基因在第10天产酶高达123 IU/L,并通过Native SDS-PAGE电泳获得预期大小的漆酶蛋白条带。结构分析和功能验证均表明:本研究获得的基因lac1为漆酶基因。
- 杨建明孟鑫徐鑫张磊李强咸漠潘迎捷
- 关键词:毛木耳漆酶基因RACE结构域
- 基于单细胞拉曼技术的益生菌活菌测量方法及其试剂盒
- 本发明公开了单细胞拉曼技术的益生菌活菌测量方法及其试剂盒。该测量方法包括(1)将样品稀释10‑100倍获得稀释后的样品;(2)将稀释后的样品接种至含100%重水的培养基孵育4小时后回收并稀释菌体;(3)使用单细胞拉曼光谱...
- 张佳任立辉朱鹏飞徐腾张磊陈荣泽马波徐健
- 文献传递
- 基于单细胞拉曼技术鉴定非结核分枝杆菌的方法研究被引量:2
- 2021年
- 非结核分枝杆菌(NTM)是除结核分枝杆菌复合群(MTC)和麻风分支杆菌以外的分枝杆菌总称。近年来NTM导致人类感染的发病率不断上升,其感染的临床症状与MTC感染极为相似,但两者治疗方案却存在差异,临床亟须快速、准确的鉴定方法用于诊断NTM感染。单细胞拉曼光谱技术(SCRS)具有非标记、免培养、快速、准确、低成本等优势。据此,我们提出了一种基于显微共聚焦单细胞拉曼光谱技术鉴定NTM的方法。通过对临床常见的六种NTM(脓肿分枝杆菌、戈登分枝杆菌、偶发分枝杆菌、土分枝杆菌、鸟分枝杆菌以及堪萨斯分枝杆菌)的拉曼光谱进行处理比较,并结合峰位注释进行分析。采用无监督低维可视化的t-分布式随机邻域嵌入方法展示六种NTM的拉曼数据结构,证明其数据在低维空间上的可分性后,比较分类中常用的六种分类器[支持向量机分析(SVM)、K最近邻分类算法(KNN)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)、随机森林(RF)、线性判别分析(LDA)、XG Boost]的效果。SVM和LDA在NTM分类中效果最好,分别达到了99.4%和98.8%的测试准确率;SVM仅对于堪萨斯分枝杆菌(97.96%,48/49)的分类准确性略低,其余均为100%;LDA对于脓肿分枝杆菌(95.65%,22/23)和戈登分枝杆菌(96.30%,26/27),其余也均为100%。因此,单细胞拉曼检测结合SVM分类器为NTM快速准确鉴定提供了富有潜力的新工具。
- 阮真朱鹏飞张磊陈荣泽李洵融付晓婷黄正谷周刚籍月彤廖璞
- 关键词:非结核分枝杆菌
- 一种利用缬氨酸途径合成丙烷的大肠杆菌及其构建方法
- 本发明公开了一种利用缬氨酸途径合成丙烷的大肠杆菌及其构建方法,属于基因工程技术领域。本发明所提供的大肠杆菌敲除了9种醛还原酶基因以及乳酸脱氢酶基因、延胡索酸还原酶基因、甲酸裂解酶基因和全局转录因子基因。同时过表达乙酰乳酸...
- 吕雪峰张磊谈晓明吴伟
- 文献传递
- 基于单细胞拉曼技术的益生菌活菌测量方法及其试剂盒
- 本发明公开了单细胞拉曼技术的益生菌活菌测量方法及其试剂盒。该测量方法包括(1)将样品稀释10‑100倍获得稀释后的样品;(2)将稀释后的样品接种至含100%重水的培养基孵育4小时后回收并稀释菌体;(3)使用单细胞拉曼光谱...
- 张佳任立辉朱鹏飞徐腾张磊陈荣泽马波徐健
- 微生物单细胞种类鉴定方法、装置、介质及设备
- 本发明涉及一种微生物单细胞种类鉴定方法、装置、介质及设备,方法包括将采集的单细胞拉曼光谱数据和参考图谱数据库中的拉曼图谱数据进行比较分析,筛选出符合条件的拉曼光谱数据;将筛选出的拉曼光谱数据作为样本,根据光谱数据样本中特...
- 任立辉李远东张磊孙利军籍月彤马波徐健
- 文献传递