韩长志
- 作品数：163 被引量：519H指数：14
- 供职机构：云南省森林灾害预警与控制重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学生物学经济管理更多>>
- 全基因组预测枯草芽孢杆菌BEST195的分泌蛋白被引量：8
- 2016年
- 枯草芽孢杆菌BEST195作为纳豆菌的一种,是纳豆生产的重要菌株之一。利用Signal P、Prot Comp、TMHMM、Phobius、Lipo P、Tat P等预测程序对该菌中4 456条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点等性质进行分析。结果表明:枯草芽孢杆菌含有分泌蛋白102个,其氨基酸长度、信号肽长度与植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌BEST195分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点。
- 任文来韩长志刘通夏秀芹
- 关键词：枯草芽孢杆菌分泌蛋白信号肽
- 植物病原卵菌RxLR效应基因功能研究进展被引量：7
- 2014年
- 植物病原卵菌包括致病疫霉、大豆疫霉、橡树疫霉以及樟疫霉、拟南芥霜霉等,其与寄主之间的相互作用基本符合Zigzag理论。该理论认为,病原菌为了操控寄主植物防卫反应,分泌和转运一些效应分子进入植物细胞中,从而抑制PTI,同时,植物中识别病原菌效应分子的防卫基因得到激活,引发ETI,随着病原菌与植物的互作类似于"军备竞赛"的不断升级,植物和病原菌在遗传上实现协同进化。卵菌基因组中包含有数百个高度分化的RxLR效应基因,现从功能多样性、冗余性以及转运机制等方面对已经报道的该类基因功能进行综述,以期为进一步研究效应蛋白的转运机制、毒性功能,以及开展对植物病原卵菌致病机理的深入研究提供重要的理论依据。
- 韩长志
- 植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体的预测方法对比研究
- 2023年
- 植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体(GPCR)在实现外界信号感知和传递过程中发挥着重要作用。基于GPCR蛋白所具有的典型7个跨膜保守结构域及非典型保守结构域,通过总结前人已报道的候选GPCR的同源比对方法,对其跨膜结构域数量预测方法及跨膜结构蛋白数据库进行对比,明确TOPCONS是目前预测GPCR跨膜结构域的较好方法。然后,选择NCBI数据库中223个不同真菌的GPCR蛋白序列通过TOPCONS和TMHMM进行对比分析,结果显示,2种软件对GPCR跨膜结构域数量的预测结果不尽相同,TOPCONS预测结果的准确度较高;进一步对上述GPCR蛋白序列的氨基酸数目进行分析,明确具有7个跨膜结构域的GPCR蛋白氨基酸数目为200~1406个。该研究可为进一步开展植物病原丝状真菌GPCR蛋白的结构预测及其功能研究提供参考。
- 韩长志薄淑文
- 关键词：G蛋白偶联受体
- 不同营养方式真菌中分泌蛋白数量及其功能对比研究被引量：1
- 2021年
- 【目的】分泌蛋白在植物病原真菌致病过程中发挥着重要的作用,前人多以单种菌株分泌蛋白预测分析,尚未见多种类型真菌中分泌蛋白的预测及对比研究报道。【方法】本研究基于多种不同营养方式真菌的全基因组序列,根据分泌蛋白所具有的基本特征,采用在线分析程序(主要包括SignalP v5.0、ProtComp v9.0等)对模式生物、死体营养型真菌、半活体营养型真菌及活体营养型真菌共19种菌株的分泌蛋白开展预测及功能分析。【结果】在上述真菌约13万条蛋白序列中,分泌蛋白所占比例为0.74%–4.83%,其中,活体营养型真菌所具有的分泌蛋白数量占比最高,平均为3.51%,而死体营养型真菌和模式生物平均比例最低,平均为1.36%。同时,活体营养型真菌具有的功能种类最多,为433种,其次为半活体营养型真菌,为266种,而模式生物具有的功能种类最少,为100种,其中,功能为假设蛋白和非特征蛋白的蛋白数量最多。【结论】该研究为深入解析分泌蛋白在实现不同营养方式真菌的致病机制方面提供理论依据。
- 覃悦韩长志
- 关键词：真菌营养方式分泌蛋白
- 大豆疫霉效应分子的功能研究
- 大豆疫霉(Phytophthora sojae Kaufman & Gerdman)引起的根腐病是大豆生产上的主要病害之一。大豆疫霉在形态上同真菌相似,呈丝状生长,但在进化上与真菌相差甚远,和藻类进化关系较近,属于茸鞭生...
- 韩长志
- 关键词：效应分子过敏性反应大豆疫霉
- 文献传递
- 褐环乳牛肝菌的研究进展被引量：5
- 2016年
- 褐环乳牛肝菌是重要的外生菌根菌之一,对松科植物生长提供必要的营养物质。同时,该菌可增加根际微生物数量,改善土壤条件等。现从褐环乳牛肝菌的分类地位、形态学特征、分布地区、发酵生物学、对根际微生物的影响、代谢途径关键酶等方面进行了综述,在此基础上认为应从褐环乳牛肝菌外生菌根菌复合菌剂开发、分泌蛋白功能以及关键代谢酶功能等方面开展深入研究,以期为进一步利用该菌奠定坚实的基础。
- 韩长志任雪敏
- 关键词：褐环乳牛肝菌外生菌根菌
- 蘑菇属中国新记录种——松林蘑菇被引量：1
- 2016年
- 根据形态特征及基于ITS序列的系统发育分析,作者对采自云南丽江老君山大型真菌标本ZRL2014261进行了研究,经鉴定为蘑菇属(Agaricus)一新记录种——松林蘑菇(A.cupressophilus Kerrigan)。该种最初描述于美国。该文对该种的形态学特征进行了详细描述,并附有相关形态特征照片。标本保存于中国科学院微生物研究所菌物标本馆。
- 苏胜宇贺茂强韩长志
- 关键词：新记录种
- 核桃炭疽病菌侵染核桃叶片的细胞学观察分析
- 核桃作为世界四大重要坚果树种之一,广泛种植于中国、美国等地。2017年底,中国核桃产量192.5万t,产量约占世界核桃产量的一半。云南省是我国核桃种植的第一大省,全省129个县(市)中有110多个县(市)种植核桃,201...
- 祝友朋韩长志
- 关键词：核桃细胞学观察
- 文献传递
- 褐环乳牛肝菌磷酸盐转运蛋白PHO84的生物信息学分析被引量：2
- 2015年
- [目的]褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌,为宿主植物提供着重要的营养元素和水分,然而,对于该菌为宿主植物提供磷营养元素的机制尚不清楚。磷酸盐转运蛋白PHO84参与磷酸盐的调控系统,在磷酸盐转运过程以及细胞信号转导过程中发挥着重要作用。[方法]基于酿酒酵母中已经报道的PHO84序列,对褐环乳牛肝菌蛋白质数据库进行Blastp比对以及关键词搜索,以及生物信息学分析。[结果]该菌中存在3个PHO84,上述PHO84含有9~12不等的跨膜结构域,均为疏水性蛋白,均定位于细胞质膜上。[结论]该研究为进一步解析外生真菌为宿主植物提供磷营养的机制提供理论支持,也为进一步开展其他磷酸盐转运蛋白的研究提供理论指导。
- 韩长志
- 关键词：褐环乳牛肝菌生物信息学分析
- 高校新生信息道德现状调查与分析被引量：1
- 2013年
- 随着计算机技术的普及以及网络的全面覆盖，上网已经成为高校大学生生活的重要组成部分。目前，网络中充斥着大量的信息资源，大学生信息道德水准的高低直接影响着其对信息处理的得当与否。为了明确高校新生信息道德水准现状，充分了解高校新生处理信息情况，本研究以西南林业大学2012级部分新生为例，对其信息道德现状进行问卷调查，得出新生信息道德水平整体表现令人满意，而在合理利用信息方面有待进一步提高等结论。
- 王溪李娅韩长志
- 关键词：信息道德实证调查高校新生
