贾瑞宗
- 作品数：26 被引量：54H指数：4
- 供职机构：中国热带农业科学院热带生物技术研究所更多>>
- 发文基金：转基因生物新品种培育专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 马铃薯(Solanum tuberosum)潜在内源性致敏蛋白的生物信息学筛选与分析被引量：2
- 2018年
- 当接触特定食物时所复发产生的一种特定的、不利于健康的免疫效应称为食物过敏。马铃薯作为世界第四大粮食作物而被广泛食用,随着基因组学的发展以及马铃薯过敏原信息的逐渐积累,它的致敏性引起高度关注。为探究马铃薯致敏性发病机理,本研究将马铃薯全蛋白基因组与致敏数据库收录的致敏序列进行比对,然后对所筛选出来的致敏蛋白进行保守结构域、生物学功能、系统发育以及染色体定位分析,结果显示:筛选出167条潜在内源性致敏蛋白中发现有11条马铃薯致敏原被数据库收录;分析它们的保守结构域发现,72个蛋白家族主要分布在Chloroa_b-bind、Hsp70和Tryp_alpha_amyl等家族中;通过GO注释对预测马铃薯致敏蛋白进行生物学功能描述;对Hsp70和Tryp_alpha_amyl家族蛋白进行系统发育分析表明马铃薯在遗传进化上具有多样性;预测致敏蛋白多以成簇分布在马铃薯染色体上。本研究为马铃薯蛋白致敏以及后基因组学提供了参考依据。
- 黄静贾瑞宗贾瑞宗朱方超郭运铃徐林
- 关键词：马铃薯致敏性交叉反应性
- 基于RNAi抗PRSV番木瓜株系的培育及其分子特征验证被引量：5
- 2017年
- 根据RNAi原理构建的抗海南番木瓜环斑病毒(PRSV)植物表达载体p CAMBIA2300-35S-CP-RNAi-OCS,通过基因枪法将载体导入番木瓜的愈伤组织中,经卡那霉素抗性筛选后再分化成为植株。描述转化植株的分子特征同时进行抗病毒试验分析其抗病性。实验结果显示:转基因株系474为单拷贝插入的杂合子,插入位点在第7号染色体supercontig_61的717 141位置;抗病毒试验中,在接种病毒后28 d内非转基因株系1280有高浓度的病毒积累并很快表现出明显的病症,而转基因株系474基本无病毒积累且无发病症状。表明转基因株系474具有较好的PRSV抗性,有待于进一步田间试验。
- 黄静贾瑞宗孔华郭静远王绪朋郭安平
- 关键词：番木瓜环斑病毒番木瓜RNAI
- 水稻(Oryzasativa L.)潜在内源性致敏原的生物信息学筛选与分析被引量：2
- 2015年
- 食物中的蛋白质是最常见的食入性致敏原。为了对水稻中的内源性致敏原有一个全面的认识和了解,本研究利用全序列比对的方法比较了水稻蛋白与已知致敏原之间的序列相似性,获得了水稻潜在致敏原,并对其保守结构域、分子功能、系统发育和染色体分布进行了分析和描述。结果一共发现了122个水稻潜在致敏蛋白,其中包括了22个已被数据库收录的水稻致敏原;保守结构域分析显示它们分别属于37个蛋白家族,其中的HATPase_c_3(Histidine kinase-,DNA gyrase B-,and HSP90-like ATPase,PF13589)结构域未在已知致敏原中发现;系统发育分析则分别揭示了水稻Prolamin蛋白超家族和Dna K蛋白家族的多样性;而且潜在致敏蛋白在水稻染色体上有成簇状分布的趋势。
- 朱方超贾瑞宗徐林郭运玲孔华郭安平
- 关键词：水稻致敏原保守结构域交叉反应性
- 一种快速早期鉴定番木瓜性别的方法
- 本发明提供一种快速早期鉴定番木瓜性别的方法，包括以下步骤：在番木瓜杂交群体中筛选获得性别决定分子标记Sex79，根据性别决定分子标记Sex79的核苷酸序列设计引物；采用该引物进行PCR扩增，检测，结果判定。本发明提供单一...
- 贾瑞宗郭安平朱芸魏卿
- 木薯淀粉分支酶活性测定方法比较研究被引量：2
- 2016年
- 旨在找到木薯淀粉分支酶活性有效测定方法。以成熟期的木薯块根为材料,对现有的淀粉分支酶活性测定方法从酶液提取液、酶液浓度、反应体系、反应时间和酶反应终止方式作了比较和改进。木薯淀粉分支酶活性测定的有效方法:取0.5 g成熟木薯块根,加入提取液研磨成浆,离心后上清为粗酶液,粗酶液稀释后加0.5%可溶性淀粉,37℃恒温水浴中保温10 min后置沸水浴中终止反应,再加碘液显色反应10 min后测定波长660 nm处吸光度值,每降低一个百分率的碘蓝值即为木薯淀粉分支酶SBE的一个活性单位(U)。改良后的淀粉分支酶活性测定方法能很好的区分木薯不同株系淀粉分支酶活性差异,实验重复性好,操作简单、快捷。
- 郭运玲孔华左娇黄启星贾瑞宗郭静远周霞郭安平
- 关键词：木薯淀粉分支酶活性
- 用Golden Gate法构建广谱抗番木瓜环斑病毒海南株系的CRISPR/FnCas9植物表达载体被引量：3
- 2018年
- 分子生物学育种是目前防治番木瓜环斑病毒(PRSV)最有效的方法。早期转基因番木瓜抗病毒的策略是根据"致病菌衍生的抗病性"(PDR)原理,将病毒来源的基因全长序列,转入番木瓜并获得抗性。PDR策略最主要特点依赖于靶目标病毒基因序列相似性,不能有效解决海南的番木瓜环斑病毒遗传多样性复杂的株系。本研究着眼于创制广谱的抗PRSV新策略,用最新的CRISPR/FnCas9基因编辑技术和Golden Gate载体构建系统,依据不同PRSV株系的保守序列分析结果,将5个sgRNA(2个CP sgRNA,2个Nib sgRNA和1个HC-Pro sgRNA)串联在一个载体上,实现一个载体可识别剪切5个位点,从而达到广谱抗PRSV的效果,应对海南地区PRSV株系复杂的问题。目前载体已经进行了测序验证,并在番木瓜上进行了叶片局部瞬时表达,初步表现出对PRSV的抑制效果,这为获得广谱抗番木瓜环斑病毒的番木瓜品种奠定良好基础。
- 王绪朋赵辉贾瑞宗孔华郭运玲郭安平
- 关键词：番木瓜CRISPR番木瓜环斑病毒
- 双波长法测定木薯的直链和支链淀粉含量被引量：15
- 2016年
- 直链淀粉和支链淀粉含量及其比例是木薯淀粉品质的重要指标。采用双波长法对30个木薯株系的直、支链淀粉的含量进行了测定,根据碘分别与直链和支链淀粉反应生成复合物的吸收光谱,我们最后确定了直链淀粉的和支链淀粉的参比波长和测定波长分别是609和469.5 nm、542和721 nm。根据回归方程得到了30个木薯株系的直链淀粉和支链淀粉的含量。本实验中用于测定木薯的直链淀粉浓度在0～26μg/m L,支链淀粉浓度在0～100μg/m L范围内符合比耳定律。结果表明：SC8不同株系的直链淀粉含量变化范围：14.879%～21.905%,支链淀粉含量变化范围：47.864%～56.955%;SC6不同株系的直链淀粉含量变化范围：15.494%～24.726%,支链淀粉含量变化范围44.292%～57.465%。该方法准确性高、重复性好、效率高,工作量小,适于批量木薯样品分析。
- 郭运玲孔华左娇贾瑞宗黄启星郭静远周霞郭安平
- 关键词：木薯双波长法直链淀粉支链淀粉
- 用于质谱鉴定的革兰氏细菌蛋白质处理方法及其缓冲溶液
- 本发明公开了一种用于质谱鉴定的革兰氏细菌蛋白质处理方法及其缓冲溶液，其中，缓冲溶液配方包括0.01mol/L～0.1mol/L？NaCl，1mmol/L～10mmol/L？Tris-HCl，0.1mmol/L～2mmol...
- 贾瑞宗魏卿郭运玲郭安平
- 文献传递
- 数字PCR和荧光定量PCR检测转基因番木瓜中外源基因拷贝数方法的建立及其应用
- 2024年
- 传统的检测转基因植物中外源基因拷贝数的方法是Southern杂交,该方法成本高、周期长,难以满足高通量检测外源基因拷贝数的育种需求,因此,本研究旨在建立快速且高通量检测转基因番木瓜中外源基因拷贝数的方法。本研究从番木瓜基因组中筛选出2个单拷贝基因Cpa03g018830和Cpa03g018770,以已知外源基因为单拷贝整合的转基因番木瓜为参照,利用数字PCR鉴定其拷贝数,进一步以其为内参基因,以番木瓜转基因育种常用的筛选标记基因NPTⅡ为外源目的基因,建立利用数字PCR和荧光定量PCR技术检测转基因番木瓜中外源基因拷贝数的方法。结果表明:Cpa03g018830和Cpa03g018770均为单拷贝基因;建立的数字PCR方法对转基因番木瓜中的外源基因拷贝数的检测准确可靠,而荧光定量PCR对转基因番木瓜中外源基因单低拷贝整合的检测准确度较高,对外源基因多拷贝整合的检测准确度则较低,因此,荧光定量PCR适合用来在大量转基因植株中初筛出单低拷贝整合的植株。本研究鉴定的单拷贝基因Cpa03g018830和Cpa03g018770可作为转基因番木瓜中外源基因拷贝数检测的内参基因,且建立的利用数字PCR和荧光定量PCR技术检测转基因番木瓜中外源基因拷贝数的方法,操作简单,速度快,适合批量检测,可为番木瓜转基因抗病育种中单低拷贝株系的选育提供新的方法。
- 谢秀菊夏启玉刘帅麦贤俊贾瑞宗郭安平徐志胜李峰孔祥义赵辉
- 关键词：转基因番木瓜拷贝数内参基因荧光定量PCR
- 番木瓜赖氨酸基序类受体激酶LysM-RLK基因家族鉴定及生物信息学分析被引量：1
- 2023年
- 本研究采用生物信息学方法在番木瓜全基因组范围系统鉴定了7个LysM-RLK家族基因,并解析了其染色体分布特征、基因结构特征、蛋白理化性质和亚细胞定位信息。基因家族进化分析表明番木瓜的7个LysM-RLK基因可划分为3个亚组(Lym-II,Lym-III,Lym-IV),并分布于4条染色体上。基因复制是番木瓜LysM-RLK家族进化的主要驱动力,基因复制分析鉴定得到7对复制基因。启动子序列调控元件分析发现其包含多个光响应元件及参与低温应答和逆境相关激素信号应答的元件。大规模比较转录组分析系统地解析了LysM-RLK在番木瓜生物胁迫、非生物胁迫条件下及不同组织中的基因表达模式,揭示其特异性的表达模式及潜在的生物学功能。复制基因对的表达分化、结构域组成差异和蛋白质三级结构的变化,暗示其在进化过程中的亚功能化现象。生物和非生物胁迫条件下的核心共表达网络分析鉴定了27个与LysM-RLK3强关联的核心基因,揭示了LysM-RLK3潜在的转录调控模式。相关结果为番木瓜LysM-RLK家族起源演化、功能分化及其在逆境响应和生长发育过程中的角色提供重要依据。
- 郭盼孔华孔华戴云素贾瑞宗周瑶贾瑞宗纪长绵马春花
- 关键词：番木瓜生物信息分析
