谭敏菊
- 作品数:32 被引量:276H指数:11
- 供职机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家重点基础研究发展计划艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学天文地球更多>>
- 2013~2014年度中国H3N2亚型流感病毒病原学特征分析被引量:41
- 2015年
- 为分析2013-2014流感监测年度中国大陆地区H3N2亚型流感病毒的抗原性和基因变异情况,本文选择了本监测年度中国分离的H3N2亚型流感病毒,利用标准雪貂抗血清进行抗原性分析,利用Sanger测序法进行病毒基因测序,采用邻位相临法(Neighbor-Joining,N-J)方法进行种系进化分析,分析我国H3N2亚型流感病毒的变异情况,进一步比较其与疫苗株的匹配性。抗原分析显示,本监测年度H3N2亚型流感病毒大部分为疫苗株A/Victoria/361/2011细胞株的类似株(99.6%),但以A/Texas/50/2012鸡胚株为参考抗原,只有15.1%为类似株,仅有11.9%与中国流行株的鸡胚分离株A/Shanghai-Changning/1507/2012抗原性类似。HA基因特性分析显示我国毒株均位于同一大分支,NA基因没有发现与耐药性相关的氨基酸位点突变。总之,2013-2014流感监测年度我国H3N2亚型流感病毒在流行过程中未发生明显变异,但病毒在鸡胚中传代会导致关键氨基酸位点变异。应及时分析并发现我国病毒的抗原性和基因特性变异情况,推选出更适合我国的疫苗株。
- 李希妍成艳辉谭敏菊黄维娟郭俊峰隗合江肖宁蓝雨赵翔杨磊王钊王大燕舒跃龙
- 关键词:流感病毒H3N2亚型抗原性基因特性
- Sanger法测定季节性H3N2亚型流感病毒全基因组序列被引量:3
- 2016年
- 目的对流行的季节性甲型H3N2亚型流感病毒进行全基因组测序。方法本文对甲型H3N2亚型流感病毒测序过程中的PCR扩增引物进行优化及精简,同时对PCR产物纯化方法进行了改进。使用优化后的34对PCR引物和优化后的纯化方法,对194株甲型H3N2亚型病毒进行了测序。结果利用优化后的测序方法,可保证获得甲型H3N2亚型流感病毒的8个片段全基因组序列,而且大大缩短了实验时间,节约了实验成本和人力。结论我们应大力开展A(H3N2)亚型流感病毒的序列测定工作,及时发现病毒变异情况,以推选出与人群中的流行株更为匹配的疫苗株。
- 李希妍赵翔谭敏菊蓝雨成艳辉黄维娟王大燕舒跃龙
- 关键词:流感病毒H3N2亚型全基因组
- 2007-2010年湖南省B型流行性感冒病毒基因特性分析被引量:4
- 2012年
- 目的了解湖南省2007-2010年B型流行性感冒(简称流感)病毒基因变异情况。方法选取2007-2010年湖南省流感监测网络实验室分离到的42株B型流感病毒毒株,对其血凝素重链区(HAl)及神经氨酸酶(NA)基因进行RT-PCR,扩增产物纯化后进行序列测定,测序结果与2007-2010年WHO北半球流感疫苗株序列进行同源性比对,绘制基因进化树并进行分子特征分析。结果HAl基因进化树中,在Victoria系分支中,2007-2009年的毒株在V1分支中,与疫苗株Malaysia/2506/2004类似;2010年的毒株在V2分支中,与疫苗株Brisbane/60/2008类似;在Yamagata系分支中,2007年的毒株在Y1分支中,与2008-2010年的毒株(Y2分支)在进化树上距离较远。NA基因进化树中所有病毒均在Yamagata系分支中,为Yamagata系来源。对2010年的7株病毒全基因序列分析显示,病毒为基因型2和15型。HAl分子与WHO推荐的流感疫苗株进行比较,Victoria系的同源性:2007年为98.6%-99.1%、2008年为98.6%-99.1%、2009年为98.1%-99.1%、2010年为97.6%-99.1%。Yamagata系:2007年为97.9%-98.5%、2009年为97.9%-98.5%、2010年为97.9%-98.2%。2007年毒株的主要突变位点为:R48K,K88R,P108A,D197N和S230G。而2009-2010年毒株的突变主要集中在:K88R,S150I,N166Y,D197N和S230G。结论2007-2010年湖南省人群中流行的B型流感病毒持续发生着变异。
- 刘运芝赵翔黄一伟陈长李芳彩高立冬李希妍李文超胡世雄谭敏菊张恒娇张红
- 关键词:流感病毒B型序列同源性抗原变异
- 2013~2014年流感流行季节中国大陆B型流感病毒对NAI的敏感性被引量:12
- 2015年
- 为了解近期我国大陆流行的B型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂类药物的敏感性,本文对2013年10月至2014年3月流感流行季节期间中国大陆分离的884株B型流感病毒进行了生物学耐药监测。884株B型流感毒株中所有毒株均对oseltamivir敏感,检测到2株(0.23%)对zanamivir敏感性降低的毒株,其他毒株均对zanamivir敏感。其中38株B/Victoria系毒株中B/Shandong-Kuiwen/1195/2014对zanamivir的IC50值为1.78nM,较药物敏感参考株的IC50平均值(0.34nM)高5.12倍,表明对zanamivir的敏感性降低,在NA基因上没有发现存在已知耐药位点变异,但有D35G,N59D和S402T(N2编码分别为39、64和399位)氨基酸位点的变异;846株B/Yamagata系毒株中B/Hunan-Lingling/350/2013对zanamivir的IC50值为2.72nM,较药物敏感参考株的IC50平均值(0.34nM)高7.99倍,表明对zanamivir的敏感性降低,NA基因发生了D197N(N2编码为198位)氨基酸位点的变异。根据结果可以推断目前我国流行的B型流感毒株对神经氨酸酶抑制剂类药物敏感。
- 黄维娟李希妍谭敏菊隗合江成艳辉郭俊峰王钊肖宁王大燕舒跃龙
- 关键词:B型流感病毒神经氨酸酶抑制剂敏感性
- 2015-2016监测年度中国H3N2亚型流感病毒变异情况分析
- 成艳辉隗合江谭敏菊赵翔肖宁黄维娟李希妍王大燕
- 2016年中国大陆B型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂药物的敏感性分析
- 黄维娟李希妍隗合江成艳辉谭敏菊肖宁赵翔王大燕
- 流感病毒对聚合酶抑制剂类药物敏感性的检测方法研究
- 2019年
- 流感病毒(Influenza virus,Ⅳ)是引起季节性流感流行和流感大流行的主要病原体。抗流感药物是控制流感病毒感染的重要方法,其中,流感病毒的聚合酶抑制剂是最有前途的药物之一。为了对聚合酶抑制剂类药物抗流感病毒药物敏感性的检测方法进行优化,本研究确定不同型别/亚型的季节性流感病毒在不同培养板进行空斑实验的培养时间和药物稀释梯度等条件,并比较免疫染色和结晶紫染色2种方法,在此基础上,利用空斑减少实验检测季节性流感病毒对T-705的敏感性。结果显示:在12孔板中,甲型流感病毒A/Beijing/2/2018(pdmH1N1)和A/Switzerland/8060/2018(H3N2)培养2d为最佳时间,乙型流感病毒B/Beijing/1/2018(B Yamagata)培养2.5d为最佳时间;在96孔板中,A/Beijing/2/2018(pdmH1N1)和A/Switzerland/8060/2018(H3N2)培养20h、B/Beijing/1/2018(B Yamagata)培养24h为最佳时间;0.5 log10为合适的药物稀释度。12孔板和96孔板均可用于季节性流感病毒对T-705的敏感性试验。在12孔板中,2种染色方法无显著性差异;96孔板只能使用免疫染色法。本研究提示,在进行流感病毒对聚合酶抑制剂类药物的敏感性检测中,需严格控制病毒的培养时间和药物的稀释度,12孔板或96孔板均可定量流感病毒以及测定病毒的药物敏感性,微孔板较传统大孔板具有通量高、可自动读取等优势。本研究为其他实验室开展类似检测提供了参考。
- 房琼琼李梓成艳辉黄维娟赵翔梦遥李多谭敏菊隗合江王大燕
- 关键词:药物敏感性
- 2012-2013流感监测年度中国大陆B型流感病毒抗原性及基因特性分析被引量:30
- 2014年
- 目的了解2012-2013流感监测年度中国大陆地区B型流感的流行状况,分析B型流感病毒的抗原性和基因变异情况。方法选择2012-2013年我国分离的B型流感病毒,利用标准雪貂抗血清进行抗原性分析。利用Sanger测序法进行病毒基因测序,采用Neighbor-Joining方法进行种系进化分析,通过基因进化树比较国内流行株与疫苗株的差异。结果 2012-2013监测年度内,B型流感病毒占所有流感病毒的9.93%,其中以B型Victoria系流感病毒为主。B型Victoria系流感病毒的抗原性与上一年度WHO推荐的疫苗株B/Brisbane/60/2008(83.5%)以及我国代表株B/Chongqing-Yuzhong/1384/2010(94.7%)的抗原性类似;而B型Yamagata系流感病毒绝大多数为WHO疫苗株B/Wisconsin/01/2010(99.3%)、WHO疫苗种子株B/Hubei-Wujiagang/158/2009(98.0%)的类似株;基因特性分析显示有1株B-Victoria系病毒发生了HA与NA基因分支间的重配,有1株B-Yamagata系病毒B/Sichuan-Gaoxin/1110/2012的NA基因位于Victoria系病毒的NA进化分支,也表明发生了种系间的基因重配。结论 2012-2013流感监测年度我国B型流感病毒活动水平较低,主要以Victoria系为主,而WHO推荐的疫苗组分是B-Yamagata系病毒,可见部分B型流感流行株与疫苗株并不匹配。
- 李希妍成艳辉谭敏菊王钊黄维娟郭俊峰隗合江肖宁蓝雨赵翔杨磊王大燕舒跃龙
- 关键词:B型流感病毒抗原性基因特性
- 云南省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒病原学特征分析被引量:10
- 2022年
- 2020年云南发现了首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1(EA H1N1)猪流感病毒,针对分离到的A/YunnanMengzi/1462/2020(H1N1v)病毒分析其血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)氨基酸变异位点、生物学耐药、受体亲和力及抗原性变异特征,并对2020-2021年度季节性流感疫苗对该病毒的交叉保护效果进行评价。结果显示,EA H1N1猪流感病毒A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)与世界卫生组织推荐的疫苗株A/Hunan/42443/2015(H1N1v)HA和NA氨基酸位点同源性分别为97.9%和97.4%;A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)病毒对神经氨酸酶抑制剂敏感,以结合人流感病毒唾液酸受体α2,6为主,与疫苗株抗原性存在8倍以上差异。接种季节性流感疫苗的儿童、成人和老年组人群针对季节性流感疫苗株A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019(H1N1pdm)抗体滴度≥40者占比分别为80.0%、76.7%和63.3%;而对A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)抗体滴度仅为13.3%、26.7%和6.7%。本研究提示接种季节性流感疫苗后产生的抗体对G4基因型EA H1N1病毒不能提供有效保护,该病毒与目前EA H1N1病毒疫苗株在氨基酸位点和抗原性上存在显著差异,并且保持了结合人流感病毒唾液酸受体的特性,研究结果提示需要构建新的疫苗株。
- 李梓赵晓南黄维娟杨磊成艳辉谭敏菊李希妍刘佳陈志肖隗合江伏晓庆王大燕
- 2015-2016监测年度B型流感病毒流行趋势与抗原性变异分析
- 谭敏菊成艳辉隗合江赵翔肖宁黄维娟李希妍王大燕