许明辉
- 作品数:94 被引量:636H指数:18
- 供职机构:云南省农业科学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金云南省自然科学基金国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 抗生素G418胁迫条件下转基因水稻种子发芽特性及应用被引量:17
- 2003年
- 在不同浓度的抗生素G418胁迫条件下对抗稻瘟病转基因水稻纯系材料D2-1-2及其受体对照中花9号进行了发芽试验。培养7d的结果表明:不同浓度抗生素处理对两个材料萌动无显著的影响;随抗生素浓度的上升,两个材料发根种子数、种子根长、芽长均受到不同程度的抑制;当抗生素浓度达100mg/L时,转基因材料D2-1-2仍可正常长根(平均1.45cm),但中花9号明显受到抑制(平均0.27cm),二者存在明显差异;根据这一特性,从中花9号和D2-1-2混合群体中筛选出来的长根(大于0.5cm)种子经PCR检测88.46%是转基因个体。
- 许明辉唐祚舜赵丰萍田文忠
- 关键词:水稻种子发芽特性转基因水稻
- 稻瘟病菌阅读框架中SSR频率、分布及所在基因功能被引量:16
- 2005年
- 在对稻瘟病菌基因组中SSR分布进行了系统分析的基础上,对由1~6个碱基为重复单元的SSR在基因的蛋白质编码区中的分布进行了分析.结果表明,该病原菌的2 378个基因的编码区中共分布有3 240个SSR序列(标准是15bp以上,匹配值为80%).在已经有注释的4 732个基因中,861个基因的编码区中有SSR.编码区中的SSR以三碱基重复和六碱基重复为主,其他类型的SSR则很少在编码区中出现.SSR在这些基因中很少有保守性,表明这些基因的高度变异,或者起源是较晚的.含有SSR的基因多为转录蛋白、信号传导的细胞调节基因这一现象表明,SSR在物种形成过程中有重要作用.利用基因编码区中丰富的SSR序列信息及其变化带来的功能变化的信息,将可以在该菌功能基因组的研究中发挥十分重要的作用.
- 李成云李进斌周晓罡张绍松董爱荣许明辉
- 关键词:SSR稻瘟病菌蛋白质编码区物种形成基因功能功能基因组
- 滇寻1号A中可育株的RAPD分析
- 2003年
- 首次用RAPD技术分析了滇寻1号A与其大田中自然产生的可育株的差异。在所用的33个随机引物中,引物OPA-13在不育系和可育株间可扩增出差异性片段,不育系与可育株的DNA在个别位点上存在差异。初步认为此差异与育性相关,不育系中的可育株是由基因回复突变引起的。
- 龙雯虹许明辉张树华
- 关键词:可育株RAPD分析水稻不育系
- 贵州地方水稻品种抗稻瘟病基因Pita功能区段序列变异分析被引量:1
- 2018年
- 为了揭示贵州水稻地方品种Pita基因序列变异类型和地理分布特点,以贵州省收集到的91份地方水稻品种为供试材料,设计抗稻瘟病Pita基因特异引物对Pita基因第二编码区功能位点区段进行PCR扩增及测序分析。研究表明,91份贵州地方水稻均持有抗稻瘟病Pita基因,DNA序列存在6个变异位点,氨基酸序列存在4个变异位点,归为7种DNA单倍型和5种蛋白型,其中Pita-H1(63.74%)、Pita-H2(18.68%)的频率较高,是贵州的优势单倍型,其他单倍型频率较低。携带Pita抗性基因(编码区第2 752位功能位点碱基为G)的品种仅6个,占供试材料的6.59%,且与越南抗性品种Tetep序列一致。Pita抗性基因在贵州省广泛分布不平衡,且频率较低。本研究为挖掘和利用贵州地方稻种的抗稻瘟病基因资源提供了参考。
- 杨奕马继琼孙一丁许明辉
- 关键词:测序分析
- 利用SSR分析滇型杂交稻亲本籼粳分化与杂种优势的关系被引量:7
- 2012年
- 以滇型杂交稻不育系4个、恢复系31个及其组配的31个杂交种为试验材料,利用SSR籼粳特异引物研究亲本籼粳分化程度及与杂种优势的关系。结果表明,在所检测的18个位点上,4个不育系均以粳稻血缘为主,31个恢复系总体上偏粳,但含有不同成分的籼稻血缘,其籼性比率Pi为0~27.8%。亲本SSR遗传距离、籼粳差异与杂种优势相关分析表明,亲本SSR遗传距离与小区产量超父优势等7个性状相关显著;亲本的籼粳分化差异与百粒重超父优势等4个性状显著相关;亲本SSR遗传距离、籼粳差异与小区产量竞争优势相关不显著,说明SSR遗传距离、亲本籼粳分化差异与产量竞争优势无线性关系,但籼粳分化差异适中的亲本杂交,容易得到正向优势极端组合,可从中筛选出杂种优势强的组合。
- 李亚莉马继武杨晓曦许明辉赵丰萍
- 关键词:籼粳分化杂种优势SSR
- 水稻过氧化物酶基因OsPOX1遗传变异分析
- 2015年
- 本研究对来自世界不同稻区的29份亚洲栽培稻和7份野生稻过氧化物酶基因Os POX1编码区序列进行了分析。结果表明Os POX1编码区序列中存在6个变异位点,Tajima's D检验表明符合中性进化规律,所有供试材料可归为六种单倍型。籼稻和粳稻均有优势单倍型,粳稻优势单倍型是H1,籼稻优势单倍型是H3,两个亚种在此位点上已发生明显的遗传分化;所有热带粳稻与温带粳稻共同享有单倍型H1,不存在明显的分化,Os POX1位点的变异与温度并不存在明显的关联;多数香稻(ARO)和AUS型品种具有H1单倍型,偏粳稻;4份O.nivara共享籼稻的优势单倍型H3,而3份O.rufipogon分别独享3个H4、H5、H6单倍型,与栽培稻不同,表明O.nivara与栽培稻亲缘关系更近,而与O.rufipogon较远。进化树分析表明H2单倍型与其他单倍型存在显著的差异。各单倍型编码蛋白并不存在差异,表明该基因功能在水稻进化中比较保守,与各水稻类型的分化形成无关。
- 李程鹏孙一丁刘辉曾千春王炎炎马继琼许明辉
- 关键词:亚洲栽培稻野生稻OS
- 粗糙脉孢菌基因组中的微卫星序列的组成和分布被引量:16
- 2004年
- 利用已经公布的粗糙脉孢菌基因组测序结果,对该真菌基因组中的微卫星(SSR)序列进行了系统分析。结果表明,在已经公布的38.0 Mb 的基因组序列中,共有14 788 个以1~6个核苷酸为基序的 SSR序列(长度大于15 bp,匹配值大于80%),其碱基总数占整个基因组碱基数的 0.95%,平均2.57 kb 就分布有一个大于15 bp的SSR。其中数量最多的三碱基 SSR,数量达到 4 729个,其次为六碱基 SSR (2 940个)和单碱基 SSR(2 489 个),这3 类SSR 总数达10 158 个,占 SSR总数的68.7%。数量最少的是二碱基SSR,只有691 个。在可读框(ORF)中的SSR总数为 4 094个,共分布于2 373个 ORF中,其中只有1 个SSR 的ORF为 1 056个。与其它生物内 SSR的分布类似,在基因编码区中,以三碱基SSR和六碱基SSR占绝对优势,分别为基因组中三碱基和六碱基SSR总数的54.1%和48.8%,由于ORFs和编码区的碱基总数分别为该菌基因组碱基总数的约46%和38.3%, 所以这两种长度的SSR在编码区中的密度高于基因组中的平均密度。ORF上下游300 bp调控区域内是各类SSR相对的富集区。尤其是上游区域中的五碱基SSR,为平均密度的3倍,二碱基SSR和四碱基SSR的密度也是基因组中平均密度的2倍多。在下游调控序列中,五碱基、四碱基、二碱基、单碱基 SSR的密度,也大大超过了在基因?
- 李成云李进斌周晓罡张绍松许明辉
- 关键词:粗糙脉孢菌基因组微卫星序列病原菌
- 烟草主要农艺性状的杂种优势及亲子关系分析被引量:33
- 1997年
- 通过对25个杂种F1,7个农艺性状优势指数分析知:烟草杂种F1不仅具有中亲遗传现象,也存在正负杂种优势,杂优大小顺序是叶数、腰叶长宽比、株高、节距、茎粗、叶宽、叶长;亲子相关分析知杂种F1株高、节距、叶数、叶长宽比与双亲值正相关,与中亲值正相关,与双亲差异无关,而其余性状双亲对F1效应方向不一致,F1与双亲差异负相关;叶片有柄对无柄、小叶耳对大叶耳、心脏形对椭园形为显性;
- 许明辉吴渝生
- 关键词:烟草杂种优势亲子相关
- 烟草数量性状遗传距离与杂种优势关系的研究被引量:32
- 1999年
- 利用8个数量性状计算了生成分遗传距离,对15个烟草品种进行了聚类,在437的阀值下可将15个亲本分为5大类,分类结果与品种地理来源无必然的联系,而与品种的血缘关系有一定的联系,可将烤烟和晒晾烟分开,在一定程度上反映了品种的遗传差异。F1产量杂种优势指数(F1/MP)与亲本间遗传距离(D2)相关系数不显著,二者呈抛物线关系。在D2<5.63的范围内,二者呈一直线关系,二者相关系数为0.511**,达极显著水平,在此范围内随D2增大,优势指数增大,杂种优势增大,当D2>5.63时,亲本间D2增大,优势指数呈下降趋势。建议在杂种优势利用中选择遗传距离中等偏小的品种做亲本。
- 许明辉
- 关键词:烟草数量性状杂种优势
- 一种抗稻瘟水稻鉴定方法和基因的标记方法及其应用
- 本发明属于农作物分子遗传育种学领域,具体涉及一种抗稻瘟水稻鉴定方法和基因的标记方法及其应用,包括如下步骤:检测待测水稻第6号染色体中Pid2基因序列FJ915121.1序列及其同源序列5’末端起第5352和5353碱基处...
- 孙一丁许明辉马继琼杨奕李进斌