汪小芬
- 作品数:5 被引量:3H指数:1
- 供职机构:上海师范大学更多>>
- 发文基金:上海市科学技术委员会资助项目国家自然科学基金河北省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学理学化学工程农业科学更多>>
- 鲫鱼GABAARβ_3亚基生物信息学分析与同源建模被引量:1
- 2014年
- A型γ-氨基丁酸(aminobutyric acid,GABA)是一类配体门控离子通道型受体,亦为脊椎动物和非脊椎动物的中枢神经系统内最主要的抑制性神经递质GABA的受体,其离子通道上存在氟虫腈等杀虫剂的作用靶点,是医药和农药工作者研究的重点。通过RACE—PCR技术成功获取新基因鲫鱼GABAARβ3的全长(GenBank登录号:KC964110)。序列分析显示该基因核苷酸序列共2767bp,含有1个由502个氨基酸残基组成的开放阅读框,编码蛋白分子量约为56KD。报道了该基因的生物信息学分析和三维结构模拟及其与氟虫腈作用情况,BLAST结果表明,氨基酸序列与其他已知GABAAR岛基因家族成员间序列相似性介于76%~89%之间,并与其他亚族蛋白基因存在很高的同源性。以线虫体内对阿维菌素敏感的谷氨酸门控氯离子通道受体蛋白的a亚基(PDBID:3RHW)作为模板,用DS(Discovery Studio)模拟鲫鱼GABAA鼠亚基的同源五聚体结构,优化结构模型,与农药配体分子做分子对接,计算作用模式和结合能力。研究鱼类GABAAR亚基与农药分子的作用。
- 秦菠张博周艳芬汪小芬曹振龙任天瑞王振山
- 关键词:鲫鱼污染克隆
- 青蒿素类化合物-转铁蛋白加合物对癌细胞的增殖抑制研究
- 本文通过简便快捷的药物-配体自组装方法制备了高靶向、低毒副作用的青蒿素类化合物(ARTs)-转铁蛋白(Tf)加合物ART-Tf、DHA-Tf与ATS-Tf.且与ART-Tf相比,DHA-Tf和ATS-Tf加合物有显著的靶...
- 杨艳张晓敏余波汪小芬任天瑞王丰
- 关键词:转铁蛋白加合物抗癌活性
- 氟虫腈与斑马鱼GABAA及果蝇RDL受体作用的差异性研究被引量:2
- 2014年
- 采用同源建模的方法构建了斑马鱼γ-氨基丁酸A型(GABAA)受体和果蝇RDL(resistance to dieldrin)受体跨膜区的三维结构,研究了氟虫腈在两个受体中作用位点的差异;采用分子对接和分子动力学方法,探讨了氟虫腈与斑马鱼GABAA受体和果蝇RDL受体的结合模式,并比较了氟虫腈与两个受体作用的差异性。结果表明:斑马鱼 GABAA受体和氟虫腈作用位点的结构与果蝇RDL受体和氟虫腈作用位点的结构存在一定的差异,果蝇 RDL 受体中的 Ala301对应斑马鱼GABAA受体α1亚基中的Val284和γ2亚基中的Ser306,氨基酸构象的差异较大;氟虫腈与斑马鱼GABAA受体的结合位点靠近胞内区一端,而与果蝇RDL受体的结合位点则位于受体第二跨膜区的Ala301~Leu308区域内。复合物分子动力学模拟结果表明,在模拟过程中,两个受体与氟虫腈复合物体系的势能可很快达到平衡状态。斑马鱼GABAA受体与氟虫腈之间形成4个氢键,其中概率大于60%的氢键有2个;而尽管果蝇RDL受体与氟虫腈形成了6个氢键,但只有1个氢键的概率大于50%,其复合物结合的稳定性比前者低。
- 汪小芬任天瑞姚建华
- 关键词:氟虫腈
- 鲫鱼γ-氨基丁酸受体β_3亚基基因克隆及其分析
- 2014年
- γ-氨基丁酸受体(GABAR)主要存在于脊椎动物和非脊椎动物的中枢神经系统(CNS),是氟虫腈、阿维菌素、硫丹和林丹等杀虫剂的作用靶标。为了阐明GABAR拮抗剂类农药影响鱼类安全性的分子作用机理,并研究其与农药分子的亲和作用,运用生物信息学方法,在NCBI基因组数据库中找到已经公布的同源的GABAARβ3亚基基因序列,通过多序列同源比对寻找高度保守区,再根据高度保守区设计特异性引物,通过RT PCR和RACE PCR技术,成功地克隆了鲫鱼GABAR A型β3亚基基因的全长cDNA序列(GenBank登录号:KC964110),该基因长2 767 bp,开放阅读框(ORF)为1 506 bp,编码502个氨基酸,与已知的其他物种β3亚基具有高度的保守性。应用qRT-PCR扩增,检测到该基因在鲫鱼不同组织器官的差异性表达。
- 秦菠张博周艳芬汪小芬曹振龙任天瑞王振山
- 关键词:鲫鱼Γ-氨基丁酸基因克隆
- 青蒿琥酯-转铁蛋白复合物抑制癌细胞增殖的初步研究
- 2013年
- 采用简单、快捷的药物配体自识别的方式制备了青蒿琥酯(ATS)-转铁蛋白(Tf)复合物(ATS-Tf).紫外-可见光谱分析表明:在正常生理条件(pH=7.4)下,ATS与Tf易自组装形成稳定的ATS-Tf复合物(结合常数K f为3.4×105L/mol);而在酸性条件(pH=5.5)下,结合能力相对变弱(K f=1.7×104L/mol),ATS易与Tf分离,具有良好的pH敏感性.同时研究了该复合物对细胞增殖的抑制作用,结果表明:ATS-Tf复合物对正常肝细胞L-02的毒性较低,而对人肺腺癌细胞A549、肝癌细胞HepG2和胃癌细胞MGC-803的增殖具有显著的抑制作用,表现出良好的靶向杀伤性,有望开发成新型靶向抗肿瘤药物.液相色谱法证实Tf增强了癌细胞对ATS的摄取能力.进一步通过分子对接模拟和荧光光谱分析对ATS与Tf的结合模式和机理进行了研究,提出了ATS-Tf靶向抑制癌细胞增殖的可能机理.研究为青蒿琥酯靶向抗肿瘤药物的研发提供了理论支持和实验依据,在癌症治疗领域具有良好的应用前景.
- 杨艳张晓敏汪小芬赵晓梅余波任天瑞王丰
- 关键词:青蒿琥酯转铁蛋白分子对接光谱分析抗癌活性