李洁
- 作品数：9 被引量：18H指数：3
- 供职机构：中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程国家麻类产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：生物学文化科学农业科学医药卫生更多>>
- 腾冲嗜热厌氧杆菌6-磷酸-β-葡萄糖苷酶的表达与结晶及其功能鉴定被引量：7
- 2008年
- 6-磷酸-β-葡萄糖苷酶(PbgL,EC3.2.1.86)催化由磷酸烯醇式丙酮酸-糖磷酸转移酶系统(PEP-PTS)转运入胞内的某些磷酸化二糖水解.一段来自腾冲嗜热厌氧杆菌(Thermoanaerobacter tengcongensis)编码PbgL(436个氨基酸残基)的开放阅读框(ORF TTE0337)被成功克隆,并在大肠杆菌BL21(Escherichia coli BL21)中有活性地表达.序列分析显示,该6-磷酸-β-葡萄糖苷酶属于糖基水解酶家族4(GH4),与枯草杆菌(Bacillus subtilis)的LicH,海栖热袍菌(Thermotoga Maritima)的BglT的一致性分别为62%和40%.纯化后的重组PbgL(rPbgL)经SDS-PAGE分析,为1条分子量约50kD的蛋白条带,与推测的分子量大小一致.该酶需要Mn2+、NAD+和还原剂为辅因子,能专一性地水解pNPβG6P,并在85℃达到最高酶活性.Western免疫印迹实验,利用针对rPbgL的多克隆抗体血清,能从腾冲嗜热厌氧杆菌胞内检测到PbgL的表达.此外,rPbgL的蛋白晶体已被筛选获得,并收集到2.4分辨率的衍射数据.采用分子置换法的结构解析目前仍在进行中.
- 尹捷刘一苇李洁马延和向华严景华高福
- 关键词：耐热性
- 产甲烷古菌及其群感效应在污水处理中的应用
- 产甲烷菌是唯一产甲烷的生物，是地球甲烷的重要贡献者.产甲烷菌是严格厌氧的古菌，广泛分布于地球的无氧环境中，是有机物厌氧降解产甲烷过程的末端功能类群.甲烷即是第二大温室气体，又是被广泛应用的可再生能源，因此产甲烷菌是重要的...
- 李凌燕李洁郑欣周立光张桂山祝金星东秀珠
- 腾冲嗜热杆菌反向旋转酶的功能研究
- 反向旋转酶(Reverse Gyrase)是高温菌(70℃以上)的标志性蛋白,能在DNA分子中引入正超螺旋。我们在大肠杆菌中克隆表达并纯化了腾冲嗜热杆菌的反向旋转酶,在体外检测了其活性,并分别检测了盐离子浓度、温度、pH...
- 李洁刘景方向华
- 文献传递
- 甲烷古菌的群感效应及其调控的生理过程
- ＜正＞高丝氨酸内酯（AHL）介导的群感效应是20年前发现的、革兰氏阴性细菌受细胞密度调控的生理过程和基因表达机制。然而这种密度依赖的细胞间信息交流机制在其它生命形式中所知甚少。我们经过数年研究,发现甲烷古菌的群感效应及其...
- 张桂山张凡李洁东秀珠
- 文献传递
- 人肠道梭菌和甲烷马赛球菌协同代谢甜菜碱和胆碱产甲烷研究
- 2023年
- 【目的】根据人肠道富含胆碱和甜菜碱,同时肠道微生物组中具有裂解胆碱和还原甜菜碱产三甲胺的细菌,以及利用三甲胺产甲烷的古菌,本研究探讨肠道细菌与古菌协同代谢甜菜碱和胆碱产甲烷的可能性。【方法】调查不同年龄段人群粪便中的16S rRNA基因多样性,分析肠道中古菌的菌群组成;利用定量PCR(quantitative PCR,qPCR)定量甲烷马赛球菌(Methanomassiliicoccus)特异的甲醇甲基转移酶基因mtaB和甲烷八叠球菌(Methanosarcina)及细菌的16S rRNA基因拷贝数,分析肠道中甲基营养型产甲烷古菌及总细菌的含量;宏基因组组装基因组(metagenome-assembled genomes,MAGs)分析携带甜菜碱还原酶基因grdH和胆碱裂解酶基因cutC的细菌组成。从粪便中分离代谢甜菜碱及胆碱产生三甲胺的细菌,并与分离自人肠道的甲烷马赛球菌构建共培养物,测定其协同转化甜菜碱和胆碱产甲烷的能力。【结果】年轻人粪便中含有甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae,82.16%)的甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter,49.18%)和甲烷杆菌属(Methanobacterium,33.34%)、甲基营养型的甲烷八叠球菌科(Methanosarcinaceae,5.67%)的甲烷八叠球菌属(Methanosarcina,5.70%),以及甲烷马赛球菌科(Methanomassiliicoccaceae,3.13%)的甲烷马赛球菌属(Methanomassiliicoccus,3.14%)。而中老年人粪便中的甲烷古菌多样性较低,也未检测到甲烷马赛球菌。qPCR定量分析显示年轻人比中老年人肠道的总古菌含量高3.11倍,其中甲烷马赛球菌高6.53倍、甲烷八叠球菌高5.52倍,总细菌含量高2.90倍。宏基因组分析组装了229个细菌基因组,其中42个携带基因grdH和cutC,这些细菌属于毛螺菌科(Lachnospiraceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)和梭菌科(Clostridiaceae)等。从粪便中分离到恶名梭菌(Clostridium malenominatum)B8,菌株B8与卢米尼甲烷马赛球菌(Methanomassiliicoccus luminyensis)B10共培养物可降解47.03%的甜菜碱和25.83%胆碱,并�
- 田栩萍李凌燕李洁李洁邓锴东秀珠
- 关键词：人粪便甜菜碱胆碱梭菌
- 真菌群落构建机制研究进展被引量：2
- 2023年
- 真菌是真核生物中生物多样性最丰富的类群之一,广泛分布于自然界,在生物多样性的分布与维持、群落构建以及物质与能量循环过程中发挥着重要的生态功能。近年来随着DNA高通量测序技术和生物信息学的发展,极大推动了真菌多样性分布格局与群落构建机制的研究进展。本文概述了基于生态位理论(niche theory)和中性理论(neutral theory)的选择(selection)、扩散(dispersal)、成种(speciation)和漂变(drift)等过程与生态模型的定量分析确定性过程和随机性过程对群落构建贡献的机制,及其在真菌群落构建中应用的最新研究进展。
- 李洁李杏春郭良栋
- 关键词：真菌生态模型
- 不同根际促生菌对亚麻镉砷富集及植株生长的影响被引量：3
- 2021年
- 为研究植物根际促生菌(plant growth promoting rhizobacteria,PGPR)对亚麻(Linum usitatissimum.L)植株富集和转移重金属污染农田中Cd、As元素效率的影响,取湖南省浏阳市永和镇矿山周围农田土壤进行盆栽试验,研究4种根际促生菌处理下亚麻株高、根长、茎粗和干茎、根重等表型指标的变化情况,以及Cd、As的富集和转移特征。结果表明:4种植物根际促生菌对亚麻的株高和根长均有不同程度的促进作用,对茎粗没有显著影响。GY16对亚麻根长、茎粗、植株鲜重和株数、干重等指标的促进效果较其他菌更显著;施菌处理下亚麻根部对Cd、As的富集量显著增高。这2种菌可联合使用作为亚麻-根际促生菌联合修复污染土壤的候选菌剂。研究表明,根际促生菌的加入提高了亚麻对重度Cd、As污染农田的修复效果。
- 王元昌李洁王玉富赵信林邱财生龙松华郭媛
- 关键词：亚麻CD植物修复
- 腾冲嗜热厌氧杆菌ECFσ因子TtRpoE1启动子识别特异性及其热激反应
- ECF(Extracytoplasmic function)σ因子是一类重要的与环境压力相关的转录因子,属于σ家族,它通过膜上与之相互作用的anti-σ因子感知环境信号的变化,指导RNA聚合酶从转录水平上实现对环境的适应...
- 刘景芳李洁裴华东周坚向华
- 文献传递
- 探秘生命的第三种形式——我国古菌研究之回顾与展望被引量：6
- 2019年
- 古菌是生命的第三种形式,蕴含着生命演化早期的信息.古菌广泛分布于地球上的各种环境(包括极端自然环境),遗传与代谢多样性极为丰富,是元素生物地球化学循环的重要驱动者.同时,古菌及其代谢产物也展现出了独特的生物技术开发潜能.20世纪70年代,我国科学家即开始研究古菌.世纪之交以来,我国古菌研究队伍迅速壮大,如今已经成为国际古菌领域的一支主要研究力量.他们在古菌系统发育与进化、生物地球化学作用、基本生物学过程、病毒与宿主免疫、开发利用等方面开展了系统的工作,取得了一系列具有国际水平的研究成果,为提升对古菌的认知做出了重要贡献.本综述简要介绍了我国科学家在古菌研究中取得的主要研究成果,并对学科的未来发展方向进行展望.
- 东秀珠李猛向华向华王风平徐俊王风平申玉龙张臻峰韩静李洁
- 关键词：古菌生物地球化学作用生物技术应用
