宋时英
- 作品数：20 被引量：23H指数：2
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- 龙虾D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶四方晶型结构被引量：1
- 2000年
- 用座滴汽相扩散法培养出龙虾 (Palinurusversicolor)D 甘油醛 3 磷酸脱氢酶(holo GAPDH)的四方型晶体 ,空间群为P42 12 ,晶胞参数为a =1 5 .49nm ,c =8 0 3nm ,不对称单位含两个亚基 .应用分子置换法测定了 0 .34nm分辨率晶体结构 .最后的晶体学Rfree和R因子分别为 0 2 74和 0 2 6 2 ,与标准键长和键角的均方根偏差分别为 0 0 0 2nm和 2 33°.不对称单位的两个亚基不仅三维结构相似而且平均温度因子也接近 ,这一结果说明以前报道的C2晶型中亚基平均温度因子的显著差别很可能是由于两个亚基处于不同的晶体学环境引起的 ,进一步支持了holo GAPDH分子具有良好的 2 2 2对称性 .
- 沈月全宋时英林政炯
- 关键词：磷酸脱氢酶龙虾晶体结构GAPDH
- SNAD+-GAPDH的分子不对称性
- D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)发挥其催化作用时,辅酶NAD(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)是不可缺少的氢受体,同时不同来源的GAPDH与NAD的结合时表现出不同的协同性.辅酶类似物在结构上与NAD类似,但与GAPDH结...
- 宋时英沈月全张雅群林政炯
- 文献传递
- 广西眼镜王蛇蛇毒酸性磷脂酶A2的三维结构与功能
- 磷脂酶A2(PLA2)专一性催化水解磷酸甘油三酯的sn-2位酯键,来源于蛇毒的PLA2还表现出丰富多样的生理和药理性质.心脏毒性是PLA2的重要药理性质之一.目前还没有关于具有心脏毒性的PLA2的晶体结构报道.从广西眼镜...
- 许素娟张海龙王秋雁舒雨雁宋时英林政炯
- 关键词：眼镜王蛇酸性磷脂
- 文献传递
- 甘油醛-3-磷酸脱氢酶三维结构与功能
- 宋时英李军沈月全林政炯邹承鲁周筠梅张发明高义贵王兆捷许义斌梁树坚
- 该项成果测定了中国南海龙虾尾肌甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）及其修饰物、衍生物和复合物的中等或高分辨率三种晶型共10种晶体结构。holo-GAPDH和apo-GAPDH结构研究提供了第一个高分辨率肌肉型GAPDH结...
- 关键词：
- 关键词：GAPDH晶体结构
- X射线辐射引起的APO-GAPDH酶晶体衍射谱的反常变化
- 高义贵宋时英梁树坚
- 关键词：X射线晶体学
- 龙虾甘油醛-3-磷酸脱氢酶结构中的氢键被引量：1
- 1997年
- 甘油醛－３－磷酸脱氢酶（ＧＡＰＤＨ）是一种具有别构作用的寡聚酶。根据Ｘ射线晶体学研究得到的中国南海龙虾Ｐ．ｖｅｒｓｉｃｏｌｏｒｈｏｌｏ－ＧＡＰＤＨ高分辩率三维结构显示复杂的氢键结构，对各种类型氢键的分布和几何性质进行了统计分析。这个寡聚蛋白氢键的特性总体上与单体蛋白类似。几乎所有位于亚基间界面的极性侧链都能形成氢键。
- 宋时英林政炯
- 关键词：龙虾磷酸脱氢酶晶体结构氢键
- 甘油醛-3-磷酸脱氢酶结构的保守性被引量：12
- 1998年
- 对中国南海龙虾等五种种属的甘油醛－３－磷酸脱氢酶晶体结构进行了比较，结果显示该酶三维结构的高度保守性。结构类似性包括酶活性中心、与辅酶结合部位、二级结构、结构域组织、亚基排列以及许多有序水结构。位于分子中心的Ｓ－ｌｏｏｐ区存在两种略有差别的构象，分别对应于耐热酶与不耐热酶。对其它细小的结构差别也进行了分析与讨论。
- 宋时英郭剑李军林政炯
- 关键词：晶体结构GAPDH
- 龙虾D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶与辅酶类似物结合的晶体学
- 2000年
- 与辅酶不同，辅酶类似物ＡＤＰ－ｒｉｂｏｓｅ和ＳＮＡＤ与Ｄ－甘油醛－３－磷酸脱氢酶（ＧＡＰＤＨ）的结合不表现协同性．用共晶方法和座滴汽相扩散技术培养出中国南海龙虾（Ｐａｌｉｎｕｒｕｓ ｖｅｒｓｉｃｏｌｏｒ）ＧＡＰＤＨ与ＡＤＰ－ｒｉｂｏｓｅ和ＳＮＡＤ复合物的晶体．Ｘ射线衍射数据分析表明它们的空间群均为Ｃ２，并具有类似晶胞参数，分别为 α＝ １５．２８０ ｎｍ， ｂ＝ １０．０３５ ｎｍ， ｃ＝ １２．８３１ ｎｍ， β＝１１０．２８°和α＝１５．３４１ ｎｍ，ｂ＝１０．０５１ ｎｍ，ｃ＝１２．８４４ｎｍ，β＝１１０．４８°．估算不对称单位合１个分子即４个亚基．与ＧＡＰＤＨ全酶和酶蛋白晶体比较，属于不同晶型．这个结果提示着辅酶类似物的结合产生了比较大的酶构象变化，而且这个构象变化不同于辅酶结合引起的构象变化．旋转函数计算结果表明，这两种辅酶类似物复合物的四聚体也具有明显的２２２分子对称性．它们的结构分析并与全酶和酶蛋白比较将为了解酶的协同性机理提供一些有益的线索．
- 沈月全王兆捷宋时英周筠梅林政炯
- 关键词：磷酸脱氢酶龙虾GAPDH晶体学
- 江浙蝮蛇毒碱性磷脂酶A_2正交晶型Ⅰ——0.25nm分辨率晶体结构
- 1999年
- 江浙蝮蛇毒碱性磷脂酶A2 具有强烈的溶血及抗凝血活性 .运用刚体修正技术获得了正交晶型Ⅰ中分子的精确旋转与平移参数 .采用非晶体学二重对称性制约的最小二乘修正方法在 0 .6～ 0 .2 5nm分辨率范围内进行了结构精化 .最终的晶体学R因子为 2 0 .1 % ,键长、键角与标准值的均方根偏差分别为 0 .0 0 1 3nm和 1 .5 5° .与正交晶型Ⅱ结构比较表明 ,二者除了β -折叠部位与Ca2 +结合部位构象存在小的差别外 ,磷脂酶A2 分子主体构象极其相似 .2种晶型由不对称单位中 2个分子形成的二体也是类似的 .但是 ,二体中 1个单体分子的相对取向有 5 .5°的差别 ,提示二体结合面有一定柔性 .晶型Ⅰ二体较晶型Ⅱ二体在晶胞中的堆积更紧密 .
- 赵克浩宋时英林政炯周元聪
- 关键词：磷脂酶A2晶体结构蛇毒
- 酶活性部位关键残基的晶体学温度因子被引量：2
- 1999年
- 从 1995年以前的蛋白质数据库中选出了 3 7套不同酶的晶体学数据 ,分别对其活性部位关键残基和整个分子的晶体学温度因子 (B)进行了统计分析 .结果显示 ,3 7种酶中有 2 6种酶的活性部位关键残基相对于分子整体而言具有较低的B因子 ,只有 7种较高 .这表明 ,在晶体状态下 ,大多数天然酶的活性部位关键残基可能具有比分子整体更稳定的构象 .对酶活性部位在变性剂的作用下表现出柔性的原因进行了讨论 .
- 张海龙宋时英林政炯
- 关键词：晶体学活性部位
