周云涛 作品数:15 被引量:51 H指数:5 供职机构: 四川大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 四川省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 自然科学总论 更多>>
甘蓝型油菜(Brassica napus)中一个未知功能蛋白基因的cDNA克隆 2005年 According to the sequence of a 352bp fragment-M17 from the suppression subtractive hybridization library of the mutant line Cr3529 of Brassica napus,primers were designed and a 1000bp upstream fragment was cloned by 5’-RACE,which was joined with the original piece and composed a 1343bp sequence.According to the 3’ and 5’ ends sequences,a pair of primers were designed and the encoding region sequence of this unknown protein was amplified and cloned.Sequence analyzing showed that it had 80.1% identity with an unknown-protein-encoding gene from Arabidopsis thaliana.Swiss-model was used to predict the structure of the induced protein,and a potential transmembrane helix from site 46 Leu to 66 Phe was identified.GLOBE prediction of globularity showed that this protein possessed a compact globular domain. 邱峰 王茂林 刘阳 周云涛 赵云 张帆关键词:甘蓝型油菜 蛋白基因 CDNA 克隆技术 甘蓝型油菜Toc33基因编码区的分离及蛋白序列的比较 2004年 以甘蓝型油菜新鲜嫩叶为实验材料提取其总DNA,以其为模板,根据拟南芥Toc33基因编码区序列设计引物,PCR扩增甘蓝型油菜叶绿体外膜蛋白转运机器的构件蛋白基因Toc33,得到两条扩增带,测序结果显示克隆到的两个片段分别长1370bp、1490bp,将这两个片段分别命名为BnToc33-1,BnToc33-2,序列比较发现它们之间的同源性为78%,其中外显子的同源性为96%,而内含子的同源性仅为60%.为研究Toc33与同一基因家族的Toc34基因功能间的关系,对拟南芥、油菜、诸葛菜等植物的Toc33、Toc34蛋白序列进行比较分析并构建了分子系统进化树. 胡远辉 王茂林 周云涛 蔡雪飞 李华鹏 赵云关键词:甘蓝型油菜 叶绿体 蛋白转运 分子进化 甘蓝型油菜MADS-box基因家族APETALA3基因编码区的克隆与序列分析 被引量:5 2004年 周云涛 王茂林 胡远辉 赵云关键词:MADS-BOX基因 基因编码区 花发育 甘蓝型油菜 金鱼草 花器官 甘蓝型油菜Scu无花瓣突变体可溶性蛋白及过氧化物酶同工酶分析 被引量:2 2007年 为了分析甘蓝型油菜(Brassica napus)Scu无花瓣突变体花器官的生理和生化变化,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳对其花器官可溶性蛋白表达和过氧化物酶同工酶活性差异进行分析.结果表明:在早期花发育过程中,甘蓝型油菜和无花瓣突变体花器官可溶性蛋白基本相同,而二者的过氧化物酶同工酶存在明显差异;在花蕾成熟阶段,二者的可溶性蛋白谱带差异明显,而过氧化物酶谱带特征基本相同,成熟花瓣器官的消失可能导致了可溶性蛋白表达的改变,而没有影响过氧化物酶的谱带特征. 周云涛 王茂林 蔡雪飞 胡远辉 赵云关键词:甘蓝型油菜 花器官 过氧化物酶 可溶性蛋白 一个与油菜黄化相关的未知功能基因克隆及表达 被引量:2 2008年 以构建的油菜幼叶黄化突变体Cr3529消减文库中一个未知功能的差异表达基因片段为基础,应用RACE-PCR技术,扩增并克隆到两个cDNA全序列,分别命名为BnCr4和Bn-Cr4-1.测序结果显示,BnCr4编码区序列大小为1395 bp,编码465个氨基酸,而BnCr4-1编码区序列长1311 bp,编码437个氨基酸.BLAST结果表明它们与拟南芥中的一个未知功能基因的cDNA同源性分别为87%和80%.功能预测显示它们含有与蛋白质的修饰作用有关的多个活性位点,如磷酸化、糖基化、酰胺化以及磷酸泛酰巯基乙胺结合位点,可能是一种新的与cAMP介导的蛋白质磷酸化与去磷酸化作用有关的蛋白.Northen杂交结果显示该基因在Cr3529子叶期和幼叶期的表达高于野生型油菜,显示该基因的表达与突变性状紧密相关.最后,原核表达了BnCr4,得到了与预计分子量相同的融合蛋白. 张珍勇 刘阳 周云涛 王茂林 赵云关键词:甘蓝型油菜 原核表达 甘蓝型油菜突变体Cr3529抑制性消减文库的构建 被引量:10 2005年 应用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建了甘蓝型幼叶黄化油菜突变体Cr3529和其野生型3529品系幼叶期的正、反向消减文库.经菌落PCR检测,正向消减文库的有效重组率为55.5%;反向消减文库的有效重组率为76.5%.为进一步克隆消减文库中的差异表达基因和研究这些基因的功能奠定了基础. 刘阳 王茂林 邱峰 周云涛 赵云 张帆关键词:抑制消减杂交 消减文库 菌落PCR 油菜矮化突变体茎段伸长初期茎尖差异表达基因的初步分析 被引量:2 2007年 采用抑制性消减杂交技术,以甘蓝型油菜矮化突变体"NDF-1"及野生型"3529"为材料构建与植株高矮性状关系最为密切的茎尖差异表达抑制消减cDNA文库。所建cDNA文库插入片段大小主要集中在100~500 bp之间。斑点杂交筛选得到30个阳性克隆,序列测定和同源性对比分析表明,所得克隆功能涉及到第二信使、转录因子、激素代谢、蛋白质降解及转运等多个方面。并对其中几个差异表达基因的功能进行了初步分析,为进一步认识油菜植株矮化机理奠定了基础。 周增光 周云涛 高勇 王茂林关键词:甘蓝型油菜 抑制消减杂交 CDNA文库 矮化 甘蓝型油菜矮化突变体抑制消减cDNA文库的构建及初步分析 被引量:14 2006年 采用抑制性消减杂交(suppressionsubtraetivehybridization,SSH)技术,以甘蓝型油菜矮化突变体“NDF—1”为实验方(tester),野生型“3529”为驱动方(driver)构建植株差异表达的抑制消减cDNA文库。所建eDNA文库的插入片段大小主要集中在100-1000bp之间。斑点杂交筛选得到了32个阳性克隆,序列测定和同源性对比分析表明,其中的12个克隆功能未知,其余涉及到激素信号转导、第二信使、光合作用、脂肪酸代谢及衰老等多个方面。还对部分差异表达基因的功能进行了分析。为进一步认识油菜植株矮化的机理奠定了基础。 李小艳 赵云 周云涛 李熠毅 王茂林关键词:甘蓝型油菜 抑制消减杂交 CDNA文库 无花瓣油菜Apet33-10花器官形态发生及差异表达基因分析 Apet33-10/(Brassica napus/)是一个单基因控制的无花瓣甘蓝型油菜突变体。形态学观察结果显示,在花器官原基形态发生、分化阶段,无花瓣油菜和有花瓣油菜之间没有形态学的差异;而当花器官原基进入生长、增殖... 周云涛关键词:甘蓝型油菜 无花瓣 花器官 实时定量PCR 酵母双杂交 转基因 文献传递 油菜APETALA3基因5′调控序列的克隆及分析 被引量:2 2009年 利用单引物PCR方法获得了甘蓝型油菜APETALA3重复基因拷贝BnAP3-3和BnAP3-4的5′调控序列。分析结果表明,两段调控区序列一致性为80.43%,大多数的保守功能元件如TATA盒和CAAT盒没有明显差异,都含有一些应对环境胁迫及诱导的元件,如MYB1AT、GATABOX和DOFCOREZM等。少数顺式作用元件存在较大差异,其中CGACGOSAMY3、CArG box、CARGCW8GAT及CAREOSREP1为BnAP3-3的5′调控序列所特有,而BnAP3-4的5′调控序列则含有GT1CONSENSUS。半定量RT-PCR显示,BnAP3-3表达量远高于BnAP3-4,可能与二者调控区某些功能元件序列差异有关。 石红杰 周云涛 左丽娟 王茂林 赵云关键词:甘蓝型油菜 克隆 顺式作用元件