王明辉
- 作品数：9 被引量：33H指数：4
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科技兴农重点攻关项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术机械工程更多>>
- 生物医学文本中命名实体识别研究被引量：7
- 2010年
- 生物命名实体识别是对生物医学文本进行信息处理的关键技术。准确的生物命名实体识别工具是对文本进行后续工作如信息提取或文本分类等的先决条件。经过多年的研究,生命科学领域生物命名实体识别取得了一定的进展。本文总结了生物命名实体的特征,分析了基于不同方法的生物命名实体识别系统,及生物命名实体识别方法在提取蛋白质互作等方面的丰富应用,并展望了未来的发展趋势。
- 张向喆王明辉赵洪波王起山潘玉春
- 关键词：生物信息学生物医学文献
- 哺乳动物MT基因的进化选择与功能分歧被引量：5
- 2010年
- 利用生物信息学的方法,使用PAML和DIVERGE等软件对金属硫蛋白进行研究,发现哺乳动物MT基因主要受到纯化选择及中性选择作用,而且其在进化历史中曾经受到过正选择作用。同时利用PAML软件检测到了4个受到正选择的氨基酸位点,利用DIVERGE软件检测到5个Ⅰ型功能分歧位点和2个Ⅱ型功能分歧位点。这些正选择位点和功能分歧位点为进一步研究金属硫蛋白的结构与功能提供了参考和依据。
- 姬广超王明辉高会江潘玉春
- 关键词：金属硫蛋白分子进化
- 亲缘系数聚类法及其在浦东白猪遗传结构分析中的应用被引量：10
- 2009年
- 王起山赵洪波王明辉潘玉春沈大德储野根
- 关键词：亲缘系数聚类法白猪
- 基于SMA超弹性的恒力结构设计及其在人工括约肌的应用
- 人工器官与周围组织的生物力学不匹配将导致组织萎缩、缺血坏死或植入体失效,是基于力学作用实现功能替代的人工器官保持其远期性能需要解决的关键问题。本文以治疗便失禁的人工括约肌为对象,研究在大变形范围实现恒力稳定夹持的技术原理...
- 王明辉
- 关键词：形状记忆合金
- 文献传递
- 生物医学文本中命名实体识别研究
- 命名实体识别是对生物医学文本进行信息处理的关键技术。准确的命名实体识别工具是对文本进行后续工作如信息提取或文本分类等的先决条件。经过多年的研究，生命科学领域命名实体识别取得了一定的进展。本文总结了生物命名实体的特征，分析...
- 张向喆赵洪波王起山王明辉潘玉春
- 关键词：生物信息学命名实体识别生物医学文献信息处理文本分类
- 文献传递
- 叉头框基因家族结构域分析及O亚家族的进化研究
- 叉头框/(forkhead box:Fox/)基因编码一类转录因子家族。研究发现,许多后口生物都有该家族的成员,且其功能呈多样性,包括细胞增殖、胚胎发育、组织分化、参与应激抵抗和免疫调节等等。但对功能为何呈多样性,目前尚...
- 王明辉
- 关键词：系统发育树真菌
- 文献传递
- 丙酸通路基因多态性与猪肉质及胴体性状的关联分析被引量：7
- 2012年
- 为了挖掘新的猪肉品质及胴体性状的候选基因,揭示猪肉质及胴体性状的遗传机制,文章将丙酸代谢通路作为候选通路,将通路内基因与猪肉质及胴体性状进行关联分析。实验采用37头三元杂交商品猪作为研究对象,首次针对丙酸通路中7个基因的36个SNP位点利用SNaPshot方法进行基因分型,分别用最小二乘模型及MB-MDR模型与肉质及胴体性状进行关联分析。结果发现,基因PCCB、MUT、MCEE及ACSS2上的4个SNP位点分别与肌内脂肪含量、背膘厚等性状显著相关(P<0.05),ACSS2与猪脂肪含量显著相关;MCEE及MUT与猪的背膘厚显著相关;PCCB基因与脂重显著相关。通过MB-MDR方法检测到多个SNP位点具有互作效应,并与背膘厚、水分含量、脂肪含量显著相关(P<0.05)。另外,丙酸代谢通路中的基因间的互作效应对猪肉品质有显著影响。
- 杨帆王琼萍何侃王明辉潘玉春
- 关键词：多态性肉质品质SNAPSHOT
- 基于小鼠表达谱芯片和比较基因组学分析猪生长发育相关候选基因集
- 2012年
- 为了在更宽、更深的层面上研究猪生长发育机制,得到以通路为单位的候选基因集以克服传统单基因分析方法的缺点。试验利用模式生物小鼠中的芯片技术,通过基因集富集分析方法(GSEA法)分析基因芯片,确定候选通路。对候选通路成员与猪生长发育相关的数量性状基因座(QTL)数据库进行映射,缩小其作用跨度区域,找出作用的关键基因集。结果表明:得到了56个与猪生长发育相关的候选基因集。
- 王琼萍杨帆王明辉何侃俞沛初潘玉春
- 关键词：生长发育性状
- 候选基因集法及IGF1-FoxO通路与猪生长发育的关联研究
- 猪的生长发育影响增重速度、饲料转化效率以及胴体组成等诸多性状,进而影响经济效益。然而至目前为止,对于猪的生长发育调控机理仍不是十分清楚,以致严重制约了猪种的遗传改良。近些年来,候选基因分析、全基因组扫描以及全基因组关联分...
- 王明辉
- 关键词：生长发育
- 文献传递
