张鲁燕
- 作品数：11 被引量：102H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所更多>>
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- QTL与环境互作的完备区间作图方法研究
- QTL与环境互作是决定数量性状表现型的重要因素,QTL与环境互作分析对遗传和育种具有重要意义。完备区间作图方法(inclusive composite interval mapping,ICIM)利用逐步回归的结果修正表...
- 李珊珊王建康张鲁燕
- 文献传递
- 针对多个双亲衍生后代群体的联合完备区间作图方法
- 本发明涉及针对多个双亲衍生后代群体的联合完备区间作图方法，包括：获得多个双亲衍生后代群体的基因型数据，并构建其整合连锁图谱；对各群体分别构建标记基因型的正交指示变量，建立表型与标记基因型间的线性关系模型；基于建立的单个群...
- 张鲁燕王建康
- 数量性状基因定位研究中若干常见问题的分析与解答被引量：94
- 2010年
- QTL作图是基因精细定位、克隆以及有效开展分子育种的基础,在利用QTL作图开展数量性状基因定位研究的过程中经常会碰到一些问题,与统计方法有关的一些问题包括LOD的统计学意义是什么?检测QTL的可信度和LOD临界值的关系是什么?如何评价不同的QTL作图方法?提高QTL检测效率的途径有哪些?与遗传参数估计有关的一些问题包括QTL的贡献率是如何计算出来的?如何确定QTL有利等位基因的来源?选择基因型分析的有效性如何?复合性状是否适宜于QTL作图?与作图群体及遗传图谱有关的一些问题包括QTL作图群体中表型数据是否要求服从正态分布?加密标记是否可以显著提高QTL检测功效?缺失分子标记对QTL作图有什么影响?奇异分离标记对QTL作图有什么影响?文章试图结合笔者多年研究工作对这12个有共性的常见问题做出分析和解答,以供科研工作者参考。
- 李慧慧张鲁燕王建康
- 关键词：数量性状QTL作图似然比检验
- QTL作图中零假设检验统计量分布特征及LOD临界值估计方法被引量：10
- 2013年
- 研究QTL作图中零假设检验统计量分布特征,可以帮助我们选取合适的LOD临界值,以控制全基因组显著性概率水平下犯第一类错误的概率。本文利用模拟方法,研究了QTL作图中单个扫描位点的似然比检验(LRT)统计量在零假设下的分布特征、影响最大LOD统计量累积分布的因素以及不同群体在不同标记密度下有效独立检验次数与染色体长度的关系。结果表明,在定位加显性效应QTL的一维扫描和定位上位性互作QTL的二维扫描中,单个扫描位置上的LRT统计量均服从卡方分布,其自由度等于检测QTL遗传参数的个数;染色体个数、群体大小和表型测量误差方差对零假设下检验统计量的分布没有影响,即不影响LOD临界值的选取,而群体类型、标记密度和染色体长度有明显影响,BC1、RIL和F2三种类型的群体中,BC1群体的临界值最小,F2群体的临界值最大,标记越密染色体越长,对应的LOD临界值越大;QTL一维扫描中有效独立检验次数与染色体长度呈正比,二维扫描中有效独立检验次数与染色体长度呈二次幂关系。借助Bonferroni矫正,给出了全基因组显著性水平与单个扫描位点显著性水平间的关系,因此,研究者可根据作图群体的群体类型、标记密度和基因组长度,很方便地确定特定全局显著性概率水平下的LOD临界值。
- 孙子淇李慧慧张鲁燕王建康
- 关键词：QTL作图似然比检验
- 新一代模块化遗传育种智能计算机仿真模拟平台Blib
- 【研究背景】模拟预测既是科学研究的一个重要手段,也是科学化决策的一种方法。育种是一个复杂和长期的过程。不同育种家采用不尽相同的育种方法,理论上或通过田间试验比较不同方法的育种成效是十分困难的。采用模拟方法可以建立较为真实...
- 张鲁燕李慧慧王建康
- 关键词：遗传育种仿真模拟计算机平台
- 基因定位与育种设计
- <正>目前国内外都存在遗传研究和育种实践脱节的现象。与创建的丰富遗传群体和发掘的大量基因信息相比,遗传群体和基因信息还没有在育种中发挥应有的作用。花费大量时间,精力和经费创建的遗传研究群体,往往随着一些基因的发现和论文的...
- 王建康李慧慧张鲁燕孟磊
- 文献传递
- QTL与环境互作的完备区间作图方法研究
- QTL与环境互作是决定数量性状表现型的重要因素,QTL与环境互作分析对遗传和育种具有重要意义。完备区间作图方法(inclusive composite interval mapping,ICIM)利用逐步回归的结果修正表...
- 李珊珊王建康张鲁燕
- 八亲衍生纯系遗传群体数量性状基因定位方法模拟的比较研究
- 【研究背景】随着遗传研究的深入,传统的双亲群体已经不能完全满足复杂性状的遗传解析。利用多个亲本进行交配设计、开展遗传研究的重要性日益突出。在过去的十多年中,多亲本遗传交配设计的兴起为植物遗传研究提供了很大的帮助。与双亲群...
- 史金卉王建康张鲁燕
- 文献传递
- 一种基于连锁不平衡度的基因分型错误检测和纠正方法
- 本发明涉及一种基于连锁不平衡度的基因分型错误检测和纠正方法，包括：获取全基因组标记基因型数据并转换为ABH格式；将所有标记按物理位置进行染色体划分和排序；对每条染色体上的标记依次进行错误基因型检测；每个标记的检测包括：针...
- 张鲁燕王建康张恒益
- 多亲本杂交衍生的多种类型群体的遗传分析方法研究
- 与双亲遗传群体相比，多亲本杂交衍生的后代群体中包含更丰富的等位基因变异。近年来，利用多个亲本进行交配设计、开展遗传研究的重要性日益突出，但多亲群体中遗传连锁分析、基因定位方法和分析软件还不完善。在作物育种中涉及四个亲本时...
- 张鲁燕孟磊张思梦王建康
- 关键词：基因定位
