刘立
- 作品数:20 被引量:32H指数:2
- 供职机构:上海理工大学更多>>
- 发文基金:上海市自然科学基金国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域:化学工程自动化与计算机技术医药卫生理学更多>>
- Bukn还原型硫辛酸抗氧化活性的理论研究
- 2015年
- 硫辛酸是一种强抗氧化剂,本文运用量子化学计算,模拟了还原型硫辛酸即二氢硫辛酸(DHLA)和谷胱甘肽(GSH)在真空、水和四氯化碳3种溶剂环境中发生氧化反应的过程,来研究它们在这3种溶剂条件下的抗氧化活性。以GSH作对比,分析得出DHLA上的巯基抗氧化活性较强,且其作用机理为2个S-H键同时发生断裂。此外,通过对比分析真空和溶剂环境中的键解离焓、质子解离焓和HOMO、LUMO能级差值,发现溶剂环境极性越大,越容易发生电子转移反应:极性越小,越易发生自由基反应。
- 柴培李代禧陈雯霞刘立潘琦余华星王丹丹
- 关键词:抗氧化谷胱甘肽巯基
- 维生素C和羟基酪醇抗氧化性的理论研究被引量:3
- 2015年
- 运用量子化学计算,模拟了维生素C和羟基酪醇在真空、非极性溶剂(四氯化碳)和极性溶剂(水)3种环境下发生氧化反应的机理,探究了其在3种环境下的抗氧化活性。通过分析维生素C和羟基酪醇的自由基解离焓、质子解离焓、绝热电离电位、最高占有轨道(HOMO)和最低空轨道(LUMO),我们得到维生素C的抗氧化性稍强于羟基酪醇。表现为不论在真空、极性溶剂,还是在非极性溶剂中,质子解离焓均远大于自由基解离焓,这说明二者抗氧化性的机理均为自由基反应,而且都是两个羟基同时均裂的协同反应。在不同的溶剂环境中,二者的自由基解离焓均相差不大,这表明溶剂环境的极性对于其抗氧化能的影响不大,证明维生素C和羟基酪醇是一类以自由基均裂反应为主的优良抗氧化剂。
- 潘琦李代禧柴培刘立余华星刘宝林
- 关键词:抗氧化维生素C
- 氨基酸对胰岛素单体活性结构的干燥保护作用研究
- 2014年
- 热敏性蛋白药物日益在疾病的预防、诊断和治疗方面表现出重要的作用。然而,热敏药物的不稳定性给它们的推广和应用带来巨大难题。本文拟以氨基酸为干燥活性保护剂研究其对热敏性胰岛蛋白活性结构的保护作用,利用Gromacs软件和Gromos96(53a6)简化分子力场,通过REMD分子模拟方法详细研究了氨基酸对胰岛蛋白药物的干燥活性保护效果。研究结果表明,相对于没有保护的干燥胰岛蛋白样品,氨基酸的保护有效防止了胰岛蛋白在干燥过程中的亲疏水表面翻转。添加氨基酸保护剂后,胰岛蛋白不仅三维整体结构得到了很好的保持,而且二级结构改变也很小。由此可见,氨基酸是一种很好的干燥活性保护剂。
- 李代禧翟振郭柏松刘宝林张燕余华星刘立杨春生
- 关键词:氨基酸人胰岛素分子模拟
- 干燥过程中LEA-motif蛋白特征重复片段对POPE膜结构的保护研究被引量:1
- 2014年
- 通过分子动力学模拟的方法,模拟了1-棕榈酰基-2-油酰基磷脂酰乙醇胺(1-Palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine,POPE)生物膜在添加胚胎发育晚期丰富蛋白(Late embryogenesis abundant proteins,LEA蛋白)特征重复片段(LEA-motif)前后两种体系在低温下的干燥过程,对比分析了干燥过程中两种体系在POPE生物膜结构、扩散系数、侧链有序性及分子间氢键数目的变化,从微观角度揭示了POPE生物膜因干燥失水导致的结构变化以及添加LEA-motif之后LEA-motif与POPE生物膜的相互作用.结果表明,LEAmotif在脱水干燥过程中能够有效地稳定膜的结构,从而保护生物材料的生物活性.
- 翟振李代禧张燕陈正隆刘宝林刘立余华星
- 关键词:分子动力学模拟
- 海藻糖对胰岛素干燥保护的分子动力学模拟
- Biopharmaceuticals are proteins with a crucial role in the treatment of many diseases. However, these protein ...
- 刘立李代禧余华星潘琦柴培王丹丹郭柏松杨春生刘宝林
- 关键词:胰岛素海藻糖分子动力学
- 文献传递
- 含巯基小分子药物抗氧化活性及机理研究
- 2015年
- 本文利用量子化学方法,分别对R型硫普罗宁,S型硫普罗宁,青霉胺,N-乙酰半胱氨酸和半胱氨酸,这5种含巯基小分子药物,在极性溶剂(水)和非极性溶剂(四氯化碳)下的抗氧化活性进行比较研究。在B3LYP/6-311++G(d,p)基组下,得到5种化合物的优化结构、解离焓(BDE)、质子解离焓(PDE)、键长、前线轨道能级。通过计算,发现虽然巯基的抗氧化性会随着溶剂极性的变化有一定的改变,但无论是极性还是非极性溶剂下,含巯基小分子药物消除自由基的反应机理仍主要倾向于S-H键断裂的自由基反应,5种含巯基小分子药物的抗氧化活性强弱顺序依次为:R型硫普罗宁>S型硫普罗宁>D-青霉胺>半胱氨酸>N-乙酰半胱氨酸。通过S-H键键长分析,发现S-H键键长的结果与解离焓结果具有较高一致性,说明S-H键键长可用于含巯基药物的抗氧化活性研究。
- 刘立李代禧潘琦余华星柴培陈正隆刘宝林
- 关键词:巯基密度泛函理论抗氧化活性
- As^(3+)与DNA4种碱基相互作用的理论研究被引量:1
- 2015年
- 砷在进入生物体后,可通过对基因损伤和基因表达等多方面的影响而发挥其毒性。本文运用量子化学计算,研究了As3+与DNA4种碱基的配位作用。从理论上确立了As3+与4种碱基的配合特征和各种配合物的相对稳定性以及As3+对4种碱基配合的选择性。当As3+与碱基结合时,最多能与3个碱基配体形成稳定构型,我们共得到17个稳定的三配体配合物。其中,As3+与O和N所形成配位键As-O和As-N的键长范围分别为(1.76~1.85)?和(1.88~2.01)?。As3+与4种不同碱基作用时,倾向与鸟嘌呤发生配位反应,且易于结合位点羰基O处发生反应。
- 柴培李代禧潘琦徐斐余华星刘立袁敏
- 关键词:砷中毒分子识别鸟嘌呤
- 血液透析过程中用瓜环去除尿素的可行性研究
- 2014年
- 瓜环因其特殊的空腔结构特征,可以包合其它的小分子,在主客体化学以及药物缓释等方面具有潜在的价值。本文旨在探索瓜环这种结构性质应用在血液透析过程中的可行性。首先利用分子力学方法初步判断和筛选出0 K下稳定的尿素-瓜环包合物;然后,进一步用分子动力学模拟研究这些包合物在常温(300 K)下的包合稳定性:最后,对常温下稳定的尿素-瓜环包合物再用Gaussian量子化学计算研究它们在常温下的动态结构稳定性和热力学稳定性。瓜环[5]与尿素分子具有较大的空间位阻,能形成较多的氢键,但是形成的包合物不够稳定;相反,瓜环[6]与尿素分子具有较小的空间位阻,形成的氢键较少,但是能自发形成的较为稳定包合物。可见对于尿毒症患者血液中过量尿素的清除,瓜环[6]可能是最好的吸附剂。可见,用瓜环[5]和瓜环[6]共同作用来清除尿毒症患者血液中过量的尿素是可行的。
- 郭柏松李代禧张燕翟振刘宝林刘立余华星
- 关键词:瓜环尿毒症分子模拟
- 依达拉奉-β-环糊精包合物的分子模拟研究被引量:1
- 2012年
- 环糊精主客体包合物在药剂学方面具有众多的应用,药物分子形成环糊精包合物后具有缓释、控释、提高疗效和降低毒副作用等功能。为了消除普通依达拉奉药物的不良反应,本文用分子动力学模拟和量子化学计算2种方法模拟了依达拉奉的β-环糊精包合物的动态稳定性,并分析了该包合物的相对稳定结构。通过对分子模拟结果的分析,揭示了依达拉奉的2种β-环糊精包合物的相对稳定性,得出了依达拉奉的β-环糊精包合物的最稳定结构为:依达拉奉分子的杂环位于β-环糊精的窄口处。根据量子化学计算对单体和包合物的化学热力学分析,进一步得出了包合物的稳定能和优势稳定结构,并对分子动力学模拟的结果进行了验证。
- 翟振李代禧张燕刘立余华星
- 关键词:依达拉奉Β-环糊精分子模拟包合物主客体相互作用
- LEA蛋白特征重复片段、海藻糖及蔗糖对胰岛素的低温干燥保护研究
- 胰岛素是一种重要的蛋白质激素,其主要用于糖尿病的治疗。目前,胰岛素的给药方式主要为皮下注射给药,但该给药方式易给患者在使用过程中带来不便和不适感。因此,胰岛素的非注射给药方式成为研究热点。其中肺部吸入给药被认为是药物吸收...
- 刘立
- 关键词:胰岛素海藻糖蔗糖冷冻干燥分子模拟
- 文献传递