贾二惠
- 作品数：21 被引量：17H指数：3
- 供职机构：公安部第一研究所更多>>
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- 相关领域：自动化与计算机技术政治法律医药卫生理学更多>>
- 基于动态规划的DNA碱基识别峰匹配方法的设计与实现
- 2020年
- 待检DNA序列预测峰与各碱基通道信号识别峰的匹配是碱基识别过程中的最复杂、最关键部分。本研究结合DNA测序荧光光谱信号的实际特点,根据预测峰和识别峰的特征信息,将动态规划的思想应用到实际DNA测序数据处理中,通过设计改进的匹配得分标准,动态规划可以最大限度的将识别峰和预测峰进行匹配,尽量做到不错配、不漏配。经理论分析和仿真实验证明,该方法适用于DNA测序动态匹配与碱基识别,能确定高准确度的待检DNA序列的碱基排序结果。
- 贾二惠李晓张涛李彬赵丽华常海龙金川
- 关键词：动态规划DNA测序
- 国产遗传分析仪测序模块优化设计研究
- 2024年
- 本文使用国产24道遗传分析仪搭配国产36 cm毛细管阵列,解决无胶筛分毛细管电泳技术为基础的遗传分析仪在测序中荧光信号校正、运行电压、迁移校正问题。以24道遗传分析仪原始光谱荧光信号为基础,建立光谱校正模型,获得基线噪声阈值。通过运行电压与峰间距值绘制标准曲线,利用测序分析软件计算清晰片段长度,确定最佳运行电压和峰间距,进而计算迁移偏移值,建立碱基大小与迁移时间的线性模型,实现碱基的准确识别。研究表明,在合适的光谱校正和基线噪声阈值限制下,当运行电压设置为10 kV,峰间距为13.05帧时,分析仪的最长清晰片段检验能力最强,为561 bp。通过迁移修正值的补偿,建立碱基大小与迁移时间的线性模型,碱基G、A、T、C的R2(标准曲线)值分别从0.9927、0.9927、0.9945、0.9879提高到0.9996、0.9998、0.9996、0.9997,且修正后,各个荧光标记的碱基均能得到正确标记,无漏标和错标,清晰片段长度延长到621 bp。本研究可以指导国产遗传分析仪测序模块的优化和设计,使分析仪的DNA碱基识别功能更高效和准确。
- 管桦张建张建阮德林张涛张涛张宁杰闫梁贾二惠
- 关键词：运行电压
- 一种用于LIF&CE有效分离DNA片段的定量分析方法被引量：3
- 2012年
- 为正确评估激光诱导荧光检测毛细管阵列凝胶电泳(LIF&CE)有效分离DNA片段及确保后续DNA鉴定的准确性,本文从实际电泳过程出发探索DNA片段长度与电泳迁移率的函数关系,研究解决因众多影响因素而造成的电泳迁移率实时变化问题,基于毛细管电泳迁移修正模型而设计了一种局部Southern方法。经理论分析和仿真实验结果证明,该方法非常适合于LIF&CE分离DNA片段的定量分析,可用于进行内标分子量定标与DNA片段大小识别,是一种稳定可靠、准确有效的定量分析方法。
- 贾二惠张涛李彬赵怡鹤
- 关键词：DNA片段
- 一种强荧光背景拉曼谱图基线校正方法被引量：1
- 2020年
- 针对新精神活性物质拉曼谱图信号特性与数据特征,通过归纳、逻辑分层与统计分析,利用几何辅助线、切线斜滑及多层搜索判断等技巧,设计了一种强荧光背景拉曼谱图基线校正方法。该算法的设计思想更加直接快捷,可解析分离各种不同程度的重叠簇峰。经验证该方法在仿真及实际应用中快速准确、实用有效。
- 贾二惠贾二惠郝凤龙李彬张涛
- 关键词：几何辅助线
- 基于拉曼光谱的危险液体自动识别方法
- 拉曼光谱作为分子指纹谱，是进行危险液体定性鉴别的较好途径，本文基于对危险液体拉曼光谱特征的研究，设计了一套拉曼光谱危险液体自动识别方法，测试乙醇、丙酮、冰醋酸、甲苯等危险液体表明，该方法在拉曼光谱满足一定信噪比条件下，能...
- 张涛史艳宁贾二惠李彬
- 关键词：拉曼光谱自动识别信噪比
- 用离散小波变换对格网DEM数据压缩中的关键技术(英文)被引量：3
- 2008年
- DEM数据具有不稳定、相关性差的特点,用离散小波变换对格网DEM数据进行压缩处理时,其边界问题将更为突出,主要表现在边界失真非常严重。这种现象不可避免地导致重建DEM数据精度的损失严重。为了最大限度地减弱边界问题的影响、提高压缩比,在进行格网DEM数据压缩时,作者将二维离散小波变换的边界问题转换为一维离散小波变换的边界问题,大大减小了边界失真区域,提高了重建DEM数据的精度。进而,用相应的算法进行了DEM压缩实验,结果表明:可获取高压缩比且高精度的重建DEM数据。
- 常占强贾二惠吴立新
- 关键词：数字高程模型离散小波变换压缩比
- DNA测序首段信号数据特别处理方法研究
- 2024年
- 针对荧光标记毛细管电泳DNA测序开始一段序列的信号杂乱特性以及不同碱基通道信号间的相对偏移问题,提出了一种用于首段信号特别处理的电泳迁移率自适应校正方法。分析设计基于四通道首段信号间峰重叠程度估计的运筹决策目标函数,通过目标函数动态寻优计算确定不同碱基通道信号的相对偏移系数,从而实现DNA测序首段信号的相对偏移校正,为提高首段信号碱基的合理判读及后续DNA精准排序提供了可靠的过程数据。
- 贾二惠张欣欣管桦李明
- 关键词：DNA测序毛细管电泳数据处理目标函数动态寻优
- 一种基于随机信号处理的基线调整方法
- 本发明涉及一种基于随机信号处理的基线调整方法，该方法根据原始信号分别设定参数BaselineType、WindowSize和StdThreshold；判断数据窗口是否限定在原始信号范围内；如果是，则计算当前数据窗口的信号...
- 贾二惠张涛李彬赵怡鹤陈学亮
- 荧光光谱解析中矩阵病态对检测结果的影响被引量：1
- 2014年
- 在工程数据处理中,经常要进行矩阵变换,矩阵病态性影响计算结果的稳定性,而矩阵的条件数与矩阵病态性密切相关.针对荧光光谱原始信号,通过分析解谱矩阵的条件数,给出通过解谱矩阵进行信号解谱时,解谱矩阵病态性对解谱数据结果的影响以及在提取解谱矩阵时如何减少矩阵病态性的方法.实验结果表明,数据突变会导致矩阵病态性增加,同时带来荧光光谱结果失真,在实际解谱矩阵提取及数据处理过程中,需重视并增强荧光染料谱图的平滑性.
- 李彬赵怡鹤张涛贾二惠
- 一种基于特征分子量内标定量分析的DNA荧光光谱采集方法
- 本发明公开了一种基于特征分子量内标定量分析的DNA荧光光谱采集方法，所述方法为：一边对同时包含内标加样分子量标准物DNA片段和未知DNA片段长度信息的检测样品进行数据采集，一边对正在采集到的原始数据进行实时处理。首先进行...
- 贾二惠张涛李彬赵怡鹤
- 文献传递
