胡琼英
- 作品数:14 被引量:43H指数:4
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- 发文基金:国家高技术研究发展计划四川省卫生厅科研基金四川省卫生厅研究基金更多>>
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- 应用SELDI-TOF-MS技术分析清热解毒凉血化瘀对内毒素肝损伤大鼠蛋白质表达的影响被引量:5
- 2011年
- 目的应用SELDI-TOF-MS技术分析清热解毒凉血化瘀对内毒素肝损伤大鼠蛋白质表达的影响。方法采用腹腔注射内毒素(LPS)复制内毒素肝损伤模型,大鼠随机分为正常对照组、模型组、中药高剂量组、中药低剂量组,用SELDI-TOF-MS技术分析大鼠血清差异表达蛋白。结果样品血清中共获得与芯片结合的11个有效蛋白质峰。其中相对分子质量为4200道尔顿的蛋白峰在中药干预组的血清中高表达,相对分子质量为8 984道尔顿、9005道尔顿的蛋白峰在中药干预组低表达。结论蛋白峰的变化,可能是清热解毒凉血化瘀中药干预内毒素肝损伤大鼠的重要的分子基础。各组大鼠的血清内确实存在着差异表达蛋白,这可能有助于内毒素肝损伤的进一步研究。
- 刘鹏文海花王开正张囡囡胡琼英王杜娟
- 关键词:凉血化瘀内毒素血症肝损伤蛋白质组学
- 原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究被引量:6
- 2011年
- 目的建立早期有效检测原发性肝癌的实验指标。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)检测435份血清蛋白质谱数据,并将其分为训练集和验证集两组。训练集用于筛选原发性肝癌的差异蛋白标志物并建立ANN诊断模型,验证集用于模型诊断效度的盲法验证。结果共发现7个有明显表达差异的标志蛋白。用其建立ANN诊断模型对原发性肝癌进行盲法验证,诊断的灵敏度和特异度分别为84.00%和81.25%,受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.847,阴性预测值94.20%,阳性预测值58.33%,准确度为81.90%。结论原发性肝癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,据其建立的人工神经网络模型可为原发性肝癌的诊断提供新方法,有重要的参考价值。
- 胡琼英王开正谭小林李小琼丁银环严莉
- 关键词:表面增强激光解析电离飞行时间质谱人工神经网络蛋白标志物受试者工作特征曲线
- 胰腺癌血清差异蛋白的筛选及其临床应用
- 目的以血清蛋白质谱指纹技术为基础和运用人工神经网络(ANN)模型为数据挖掘工具,建立一种新的胰腺癌实验诊断方法。方法利用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laserdesorption/...
- 胡琼英王开正丁银环雷正明付文广郑旅芳梁双花严莉
- 关键词:胰腺癌表面增强激光解析电离飞行时间质谱人工神经网络蛋白标志物
- 文献传递
- 血清低分子量差异蛋白质组在食管癌诊断和分期中的作用研究
- 2011年
- 目的:研究食管癌癌变过程中血清低分子量蛋白的细微变化,探索食管癌发生的机制、寻找食管癌早期诊断的生物标志物和方法。方法:应用表面激光解析电离飞行时间质谱技术对食管癌患者和健康对照血清进行蛋白质谱指纹图谱检测,通过Biomarker Wizard软件筛选差异蛋白,使用人工神经网络软件建立食管癌早期诊断模型并用盲法验证其诊断效果;将食管癌早期和中晚期食管癌患者血清质谱图进行比对分析,寻找各期差异蛋白,并建立分期诊断模型。结果:发现食管癌和正常人差异蛋白5种,早期食管癌和中晚期食管癌差异蛋白3种。通过早期食管癌组和健康对照组建立早期诊断模型的灵敏度87.88%,特异度91.43%,准确度89.71%,经过盲法验证结果为灵敏度95.83%,特异度89.13%,准确度91.43%。建立的分期诊断模型中,早期食管癌和中晚期筛选的差异蛋白建立的分期诊断模型灵敏度75.76%,特异度79.17%,准确度77.19%。结论:表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)联合人工神经网络技术操作较为简便,在食管癌的诊断和分期上具有可行性。
- 任兴军谭小林杨成虎李小琼冯峰胡琼英丁银环戴天阳王开正
- 关键词:食管癌蛋白组学SELDI-TOF-MS
- 清热解毒凉血化瘀对内毒素肝损伤大鼠蛋白质表达的影响被引量:2
- 2010年
- 目的:探讨清热解毒凉血化瘀对内毒素肝损伤大鼠蛋白质表达的影响。方法:采用腹腔注射内毒素(LPS)复制内毒素肝损伤模型,大鼠随机分为正常对照组、模型组、中药高剂量组、中药低剂量组,用SELDI-TOF-MS技术分析大鼠血清差异表达蛋白。结果:样品血清中共获得与芯片结合的11个有效蛋白质峰。其中相对分子质量为4200道尔顿的蛋白峰在中药干预组的血清中高表达,相对分子质量为8984道尔顿、9005道尔顿的蛋白峰在中药干预组低表达。结论:内毒素肝损伤模型大鼠血清内确实存在差异表达蛋白,这可能有助于内毒素肝损伤的进一步研究。
- 刘鹏文海花王开正张囡囡胡琼英王杜娟
- 关键词:凉血化瘀内毒素血症肝损伤蛋白质组学
- 血清低相对分子质量差异蛋白质组在食管癌诊断和分期中的作用
- 2010年
- 目的:研究食管癌癌变过程中血清低相对分子质量蛋白的细微变化,探索食管癌发生的机制,寻找食管癌早期诊断的生物标志物和方法.方法:应用表面激光解析电离飞行时间质谱技术对食管癌患者血清和健康对照血清进行蛋白质谱指纹图谱检测,通过Biomarker Wizard软件筛选差异蛋白,使用人工神经网络软件建立食管癌早期诊断模型并用盲法验证其诊断效果;将食管癌早期和中晚期食管癌患者血清质谱图进行比对分析,寻找各期差异蛋白,并建立分期诊断模型.结果:发现食管癌和正常人差异蛋白5种,早期食管癌和中晚期食管癌差异蛋白3种.通过早期食管癌组和健康对照组建立早期诊断模型的灵敏度87.88%,特异度91.43%,准确度89.71%,经过盲法验证结果为灵敏度95.83%,特异度89.13%,准确度91.43%.早期食管癌和中晚期筛选的差异蛋白建立的分期诊断模型灵敏度75.76%,特异度79.17%,准确度77.19%.结论:表面增强激光解析离子化飞行时间质谱联合人工神经网络技术操作较为简便,在食管癌的诊断和分期上具有可行性.
- 任兴军谭小林杨成虎李小琼冯峰胡琼英丁银环戴天阳王开正
- 关键词:食管癌蛋白组学表面增强激光解析离子化飞行时间质谱
- 胰腺癌血清差异蛋白的筛选及其临床应用被引量:3
- 2009年
- 近年来胰腺癌发病率明显增高,其发病隐匿,早期在临床上缺乏特异表现,恶性程度高,极易出现转移,就诊时80%的患者已失去根治手术的机会,5年生存率不足5%。导致胰腺癌患者预后极差的原因很大程度上与缺乏早期诊断的可靠方法有关。近年来,蛋白质组学技术为胰腺癌的研究提供了新的手段。
- 胡琼英王开正丁银环雷正明付文广郑旅芳梁双花
- 关键词:胰腺癌患者差异蛋白蛋白质组学技术血清癌发病率
- 鳞癌与腺癌患者血清差异蛋白质组分析被引量:4
- 2011年
- 目的为鉴定鳞癌与腺癌的血清标志物和病理分型提供依据。方法采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)对254份血清(鳞癌120份、腺癌82份,健康人52份)进行蛋白质谱指纹图分析,筛选鳞癌与腺癌的差异蛋白。结果 254份血清共筛选出83个差异表达的蛋白,其中5个差异表达最明显的蛋白质峰的质荷比(m/z)分别为2953、3285、6625、6646、9257。对5个峰强度分别进行F检验,P均<0.05。结论鳞癌、腺癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,为癌症的诊断和病理分型研究提供了新思路。
- 胡琼英彭瑛王开正郑旅芳丁银环谭小林李小琼严莉
- 关键词:鳞癌腺癌表面增强激光解吸电离飞行时间质谱蛋白标志物
- 运用内标校准法提高表面增强激光解吸电离飞行时间质谱检测中的重复性被引量:16
- 2009年
- 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)具有高灵敏度、高通量、高效率等优点,是近年来疾病蛋白组学研究的先进技术,但该技术检测结果的重复性较差。因此,建立SELDI—TOF—MS检测流程的标准化至关重要。我们将色谱分析常用的内标法引入SELDI—TOF—MS技术,采用合成多肽分子作为内标物,建立内标校准法以校准SELDI—TOF—MS质谱图的横坐标和纵坐标,以提高该方法检测蛋白质分子量和丰度的重复性。
- 丁银环胡琼英梁双花姜伟周明术严莉王开正
- 关键词:飞行时间质谱内标法校准SELDI
- SELDI—TOF—MS二维内标法的建立和应用被引量:4
- 2009年
- 目的探索表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)二维内标校准方法,解决SELDI—TOF—MS的准确度和重复性较差的技术瓶颈。方法采用人工合成纯化的多肽分子促肾上腺皮质激素(ACTH,MW:2465.75Da)作为内标物质,加入待测样品中进行SELDI—TOF—MS检测,通过内标物质在质谱图中横坐标(质荷比)和纵坐标(丰度)响应值校准,消除因操作条件的波动对分析结果产生的影响,以提高结果的准确度和重复性。结果加入终浓度为4.055μmol/L的ACTH对血清蛋白质谱图无明显影响;加入内标物浓度和其质谱峰丰度呈直线关系(P=0.9763);分子量检测变异系数平均降低5.36倍(P〈0.001);质谱峰丰度检测平均变异系数降低5.19倍(P〈0.001)。结论二维内标法显著提高了SELDI—TOF—MS测定蛋白分子量和丰度的准确度和重复性,是该技术进行质量控制和标准化的有效措施。
- 丁银环胡琼英姜伟郭建红周明术梁双花严莉王开正
- 关键词:蛋白组学内标法