潘宇曦
- 作品数:3 被引量:9H指数:1
- 供职机构:上海交通大学更多>>
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- 相关领域:生物学更多>>
- 利用支持向量机预测生物膜蛋白类型被引量:9
- 2004年
- 利用统计学习理论中的支持向量机(SVM),基于氨基酸组分含量预测生物膜蛋白类型.使用文献中2059个训练集和2625个检验集膜蛋白序列数据,运用统计预测中的校准检验,留一法交叉检验和独立数据集检验方法进行分类预测.结果表明,SVM对膜蛋白类型预测具有明显的优越性,该算法对当前已有方法起到重要的补充作用.
- 郭宗明张治洲潘宇曦黄振德冯国鄞贺林
- 关键词:支持向量机氨基酸组分
- 运用小波分析对蛋白质进行亚细胞定位预测(英文)
- 2008年
- 基于传统的以20种氨基酸在蛋白质序列中的组分来预测蛋白质亚细胞定位的方法,运用了"离散小波变换"(Discrete Wavelet Transform,DWT)的数字信号处理技术,对蛋白质序列中氨基酸排序的特征进行提取,并与氨基酸百分组成相结合,对蛋白质亚细胞定位进行了预测.通过观察预测结果发现,引入氨基酸的排列顺序特征后,蛋白质亚细胞定位的预测正确率有了显著的提高.
- 潘宇曦喇玉娟冯国鄞贺林
- 关键词:数字信号处理离散小波变换生物信息学蛋白质组学
- 运用数字信号处理技术对蛋白质进行亚细胞定位预测
- 蛋白质通过某种机制进入细胞器或亚细胞器,这个过程为完成它们各自特殊的功能提供了一个适合的环境。因此,蛋白质的功能与其亚细胞定位之间有着密切的联系,确定一个蛋白质的亚细胞定位对于研究该蛋白的功能往往能够提供重要的线索。尽管...
- 潘宇曦
- 关键词:数字信号处理蛋白质亚细胞定位氨基酸组分
- 文献传递