目的:本研究应用蛋白质组学技术建立化疗敏感性不同的结直肠癌组织总蛋白双向凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)图谱,并鉴定部分差异表达蛋白,以发现与结直肠癌化疗敏感性有关的蛋白。方法:收集临床诊断为晚期结直肠癌的病例,肠镜活检获取新鲜结直肠癌标本后液氮保存备用,根据肿瘤药物敏感实验分为化疗高敏感组和化疗低敏感组。提取组织总蛋白,采用双向凝胶电泳技术得到各组凝胶图谱;采用PD-quest7.3软件进行图像的合成、对比和差异分析,识别化疗高敏感组和化疗低敏感组之间差异表达的蛋白斑点;选取差异蛋白质点,胶内酶解后行肽指纹图分析及网上数据库检索,鉴定差异蛋白质;应用Western印迹法检测部分差异蛋白的表达情况。结果:建立了化疗高敏感组和化疗低敏感组的双向凝胶电泳图谱,多数蛋白质点集中于pH4~8、相对分子质量为(20~100)×103。高敏感组和低敏感组的电泳图谱中平均蛋白质点数分别为(842±23)个和(793±19)个,2组平均匹配率为90.7%,2组间差异表达蛋白质点数为(79.00±13.56)个;选择30个差异蛋白质点进行质谱分析,经数据库查询鉴定出9个差异表达蛋白。结论:在化疗敏感性不同的结直肠癌中存在蛋白质表达的差异,这些差异表达蛋白可能与化疗敏感性有关,并可能用于化疗敏感性的预测。