曹凯鸣 作品数:48 被引量:175 H指数:9 供职机构: 复旦大学生命科学学院生物化学与分子生物学系 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 重庆市自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 文化科学 更多>>
水稻OsGSTL1启动子的分离和表达分析(英文) 2006年 从水稻基因组文库中筛选得到一个水稻GST基因,命名为OsGSTL1。半定量RT-PCR分析表明OsGSTL1基因的表达不受绿磺隆、乙烯利、脱落酸、水杨酸和茉莉酸甲酯的诱导,因此该基因可能与植物抗逆性无关。为了研究OsGSTL1启动子在植物体内的表达特性,将OsGSTL1起始位点5′端上游不同长度的调控序列与报告基因GUS融合,并在洋葱表皮瞬间表达和拟南芥中稳定表达。研究表明:在洋葱表皮细胞中,160bp及更长的上游调控序列均能启动GUS基因的表达;而在转基因拟南芥中,含有2155bp的上游序列的PGZ2.1::GUS具有时空表达的特性,在转基因的早期幼苗中GUS基因在子叶中特异性表达,但在根中没有表达;而在幼苗生长的后期,根、茎、叶中都有少量的表达。但包含1224bp的上游序列的PGZ1.2::GUS却表现为组成型表达的特性。由此推测,OsGSTL1启动子启动的基因表达可能与幼苗的营养代谢相关;而OsGSTL1启动子的时空表达相关元件可能位于OsGSTL1翻译起始位点5′端上游–2155bp至–1224bp范围内。 胡廷章 王维平 曹凯鸣 夏勉 王喜萍关键词:启动子 水稻 水稻基因组中U2snRNA基因的结构分析 2000年 对水稻(Oryza sativa)U2snRNA基因的结构分析结果表明单子叶植物水稻的U2snRNA基因以多基因家族的形式存在,且U2snRNA基因中存在连锁现象。3个新的水稻U2snRNA基因和已报道的FDRGU2-3一样,编码区上游除含有植物UsnRNA基因共有的USE和TATA元件外,还含有单子叶植物UsnRNA所特有的MSP元件,且具有保守的四茎环二级结构,基因成员间的同源性最低为85.1%。其中两对基因连锁,且转录方向相同,此外还发现一例假基因的存在。 王喜萍 冯征宇 董爱武 孙崇荣 曹凯鸣关键词:基因家族 水稻 基因组 水稻中一种RNA结合蛋白cDNA的筛选和结构分析 被引量:1 1997年 植物叶绿体基因组全结构的阐明,已充分揭示该遗传体系兼有原核生物和真核生物基因组的特征。在叶绿体基因中,除存在一些内含子结构外,还具有像rpl12这样复杂的分割式基因。同时,不同基因的转录速度也存在着显著的差异。这些都意味着叶绿体基因在转录后必然有着复杂的剪接加工过程。RNA结合蛋白是一类在RNA加工中起重要作用的蛋白。Li等首次从烟草叶绿体中分离到与RNA转录直接相关的RNA结合蛋白,并且证明它们是由细胞核编码,在细胞质中合成后再输入到叶绿体中去的。至今,已从烟草、菠菜以及拟南芥菜等植物中发现了约10种核编码的叶绿体RNA结合蛋白,它们有类似的构造特征。我们从水稻cDNA文库中首次筛选到一个RNA结合蛋白(cp28)的基因,其相应的肽链由264个氨基酸组成。和其他叶绿体RNA结合蛋白相仿,它也包含有两个RNA结合结构域(称为consensus sequence-type RNA-binding domain,即CS-RBD),其中各含有一个由8个氨基酸组成的高度保守的一致顺序(ribonucleoprotein consensus sequence,即RNP-CS)。N端区域的传送肽(穿膜信号肽)由60个氨基酸组成,其后是一段负电荷十分集中的酸性肽段,但传送肽和酸性肽段的氨基酸顺序与其他植物的RNA结合蛋白的同源性很低。根据全长肽链的同源性比较。 邢葵益 忻骅 曹凯鸣 孙崇荣关键词:RNA结合蛋白 CDNA 水稻 叶绿体 非特异性脂质转移蛋白的抗病作用研究 将水稻中两个编码非特异性脂质转移蛋白(LTP110和LTP144)的cDNA克隆到大肠杆菌表达系统Impact-CN中,在大肠杆菌中进行体外表达并纯化,得到的蛋白用于抗性研究.体外抑菌实验表明,这两种脂质转移蛋白对水稻病... 葛晓春 陈继超 林奕 孙崇荣 曹凯鸣文献传递 水稻类非特异脂质转移蛋白OSDIR的表达和纯化 被引量:1 2006年 通过PCR方法从水稻(O ry za sa tiva)染色体基因组中扩增一个编码非特异性脂质转移蛋白(nonspec ific lip id transfer prote in,nsLTP)类似蛋白的基因(OSd ir),将该基因片段克隆到硫氧还蛋白融合表达载体pET 32a(+)中后,在BL 21(DE 3)trxB-宿主菌中实现了融合蛋白的高表达,表达产物为包涵体。利用尿素溶解包涵体并复性后,再通过Sepharose N i2+-che lating fast flow柱亲和纯化融合蛋白,得到重组O SD IR蛋白。 刘晓灿 汪笑峰 葛晓春 曹凯鸣关键词:生物化学 非特异性脂质转移蛋白 纯化 非特异性脂质转移蛋白在几种大肠杆菌表达系统中的表达比较 非特异性脂质转移蛋白(nsLTP)分子较小(约10kD),分子内含有8个半胱氨酸,形成4个二硫键,高级结构测定可见其分子内有一个可以结合脂质分子的疏水结构域.由于它的结构的特殊性,使得它在一般的大肠杆菌中难以得到较高的表... 葛晓春 陈继超 王文漪 曹凯鸣 孙崇荣文献传递 烟草拟核小体组装蛋白cDNA的克隆、表达及其蛋白产物的纯化 被引量:1 2002年 从烟草BY2细胞cDNA文库中筛选到核小体组装蛋白1(Nucleosomeassemblyprotein1,NAP1)的cDNA,序列分析发现该NAP1的cDNA编码374个氨基酸,与已知植物来源的NAP1同源蛋白相比具有80%以上的同源性,而且一些具有重要功能的结构域是相当保守的,如核定位信号,核输出信号,酸性结构域及异戊烯化修饰位点,重要功能结构域的存在预示了NAP1蛋白潜在的多种功能.为了深入研究NAP1的功能,应用大肠杆菌表达体系高效表达了烟草NAP1蛋白,并对表达产物进行了分离纯化. 俞瑜 董爱武 朱炎 曹凯鸣 孙崇荣关键词:CDNA 克隆 烟草 纯化 OsCOI1,水稻中一个受茉莉酸甲酯和脱落酸诱导表达的F-box家族基因 被引量:10 2006年 利用Blast检索、EST分析和RT-PCR,在水稻中分离到一个与拟南芥COI1同源的新基因,命名为OsCOI1.OsCOI1编码595个氨基酸.推测的OsCOI1编码蛋白有一个F-boxmotif和16个富含亮氨酸的重复序列,这与拟南芥COI1相似.OsCOI1在氨基酸水平上和COI1有很高的同源性(74%).经半定量RT-PCR法和RNA印迹分析,表明水稻中OsCOI1表达水平在经茉莉酸甲酯和脱落酸处理后呈明显变化,但不受水杨酸和乙烯的影响,说明OsCOI1可能在茉莉酸信号途径和脱落酸途径中具有特定功能. 胡廷章 王维平 曹凯鸣 王喜萍关键词:水稻 F-BOX MOTIF 半定量RT-PCR 大豆KUNITZ型胰蛋白酶抑制剂的稳定性及抗虫性研究 被引量:23 2002年 大豆kunitz型胰蛋白酶抑制剂(SBTi A2)存在于种子中,2种kunitz型胰蛋白酶抑制剂Tia和Tid得到纯化,并对它们的pH稳定性和温度稳定性进行了比较研究,而且通过人工饲料喂养鳞翅目昆虫棉铃虫来研究SBTi A2的抗虫性.结果显示,棉铃虫的幼虫喂食含有Tia的人工饲料后,表现出生长延缓、体重减轻、羽化率降低、死亡率增加.由此显示了SBTi A2作为生物农药及利用转基因方法使作物提高抗虫性的应用前景. 谢可方 董爱武 忻骅 詹树萱 丁波 顾其敏 曹凯鸣关键词:大豆胰蛋白酶抑制剂 稳定性 抗虫性 生物农药 普通野生稻中NBS同源序列的克隆和分析 被引量:17 2001年 已知的植物抗病基因大多数具有核苷酸结合位点(NBS)和富含亮氨酸重复区(LRR).根据 NBS的保守区设计引物,应用聚合酶链式反应(PCR),从普通野生稻基因组中克隆了4个不 同的NBS同源序列(OSNBA1~OSNBA4).同源性比较显示它们均与非TIR类的NBS序列 相似.其中,OSNBA1与双子叶植物拟南芥的RPS2基因更接近;OSNBA2~OSNBA 4与单子叶植物水稻的XA1、RPR1基因更相似. 周玮斌 史晰 詹树萱 孙崇荣 曹凯鸣关键词:抗病基因 核苷酸结合位点 野生稻 同源序列